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DPC4/Smad4基因RNA干扰靶点设计和慢病毒载体制备*
引用本文:仲丽丽 周忠光 白云 李洋 张维嘉. DPC4/Smad4基因RNA干扰靶点设计和慢病毒载体制备*[J]. 现代生物医学进展, 2014, 14(8): 1456-1459
作者姓名:仲丽丽 周忠光 白云 李洋 张维嘉
作者单位:1黑龙江中医药大学附属第一医院病理科黑龙江哈尔滨150040;2黑龙江中医药大学黑龙江哈尔滨150040;3 哈尔滨市第一医院骨外科黑龙江哈尔滨150010
基金项目:国家自然科学基金项目(81173599)
摘    要:摘要目的:DPC4/Smad4 基因RNA干扰靶点的设计和RNA 干扰靶点慢病毒载体制备。方法:针对DPC4/Smad4基因序列,并利用网站设计程序,依据RNA干扰序列设计的原则,设计多个RNA干扰靶点序列。根据设计经验和设计软件将其进行评估测定,选择最佳动力学参数靶点进入其后续的实验流程;生工生物合成含干扰序列的DNA oligo,具有严格的检测体系(PAGE 纯化体系),其两端含酶切位点粘端,直接连入酶切后的RNA干扰载体上。将连接好的产物转入制备好的细菌感受态细胞,并且对长出的克隆进行酶切鉴定。然后挑选出阳性克隆测序,进行测序比对后,鉴定阳性的克隆即为构建成功的目的基因RNA 干扰慢病毒载体。将构建的慢病毒载体以及辅助包装载体质粒共转染到293T 细胞。收获含有病毒的细胞培养上清,浓缩后进行滴度测定,并检测其感染性。另外应用荧光实时定量PCR 检测在感染的293T细胞中敲减效果。结果:成功构建DPC4/Smad4 shRNA的慢病毒载体LVshSmad4,并成功制备DPC4/Smad4 shRNA慢病毒,三株病毒感染细胞后均具有有效的敲减效应,其中SH1 最为显著。结论:DPC4/Smad4 基因RNA干扰靶点的成功设计和RNA 干扰靶点慢病毒制备,为以后探讨DPC4/Smad4 基因与肿瘤的相关性治疗提供了实验基础。

关 键 词:DPC4/Smad4 ;RNA干扰;慢病毒

Construction and Design of Lentiviral shRNA targeting DPC4/Smad4 Gene*
ZHONG Li-li,ZHOU Zhong-guang,BAI Yun,LI Yang,ZHANG Wei-jia. Construction and Design of Lentiviral shRNA targeting DPC4/Smad4 Gene*[J]. Progress in Modern Biomedicine, 2014, 14(8): 1456-1459
Authors:ZHONG Li-li  ZHOU Zhong-guang  BAI Yun  LI Yang  ZHANG Wei-jia
Abstract:
Keywords:DPC4/Smad4   RNA interference   Lentivirus
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