| 嗜水气单胞菌诱导的池蝶蚌血细胞cDNA 文库的构建和亲环蛋白基因序列的初步分析 |
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| 引用本文： | 谢凯,徐灵,盛军庆,曾柳根,王军花,洪一江.嗜水气单胞菌诱导的池蝶蚌血细胞cDNA 文库的构建和亲环蛋白基因序列的初步分析[J].水生生物学报,2011,35(5):783-789. |
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| 作者姓名： | 谢凯 徐灵 盛军庆 曾柳根 王军花 洪一江 |
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| 作者单位： | 南昌大学生命科学与食品工程学院,南昌,330031 |
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| 基金项目： | 国家公益性行业科研专项(200903028); 江西省科技攻关项目(2009BNA07400); 江西省自然科学基金(2008GZN0070); 江西省教育厅科技项目(GJJ10306)资助 |
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| 摘 要： | 实验利用灭活的嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)诱导处于四龄池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)14h,将诱导后的池蝶蚌血细胞的总RNA 进行逆转录, 用LD-PCR 法合成双链cDNA, 从而首次成功构建池蝶蚌血细胞的全长cDNA 文库。原始文库的滴度为4106 cfu/cm3, 重组率为90%, 扩增后文库的滴度为3.55109pfu/mL。目前文库已随机测序672 个样品, 将所得双向序列进行拼接, 去除载体, 并多序列比对去除重复序列后, 发现436 条为已知功能序列, 其余为未知功能序列。序列中最小长度270 bp, 最大长度为2153 bp, 平均大小608.6 bp, 表明插入片段大小理想。从文库中筛选获得免疫相关基因池蝶蚌亲环蛋白A(HsCyp A)全长基因并进行序列分析。结果显示, HsCyp A 全长1229 bp, 序列包括52 bp 的5非编码区、495 bp 的开放阅读框、682 bp 的3非编码区和29 bp 的poly(A)尾, 没有明显的加尾信号。对Cyp A 氨基酸序列二级结构进行了较详细的分析并进行了三维建模, 同时构建了其系统进化树, 分析表明亲环蛋白家族是一个在进化上非常保守的蛋白家族。综合分析, Cyp A 在水生动物中不仅仅只是一种组成型蛋白, 而是可能在病原感染防御中发挥重要作用。
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| 关 键 词： | 池蝶蚌 血细胞 cDNA 文库 嗜水气单胞菌 亲环蛋白 |
THE FULL-LENGTH cDNA LIBRARY OF HEMOCYTE INDUCED BY AEROMONAS HYDROPHILA AND MOLECULAR CHARACTERISTICS OF CYCLOPHILIN A FROM HYRIOPSIS SCHLEGELII |
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| XIE Kai,XU Ling,SHENG Jun-Qing,ZENG Liu-Gen,WANG Jun-Hua,HONG Yi-Jiang.THE FULL-LENGTH cDNA LIBRARY OF HEMOCYTE INDUCED BY AEROMONAS HYDROPHILA AND MOLECULAR CHARACTERISTICS OF CYCLOPHILIN A FROM HYRIOPSIS SCHLEGELII[J].Acta Hydrobiologica Sinica,2011,35(5):783-789. |
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| Authors: | XIE Kai XU Ling SHENG Jun-Qing ZENG Liu-Gen WANG Jun-Hua HONG Yi-Jiang |
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| Institution: | XIE Kai,XU Ling,SHENG Jun-Qing,ZENG Liu-Gen,WANG Jun-Hua and HONG Yi-Jiang(College Life Science and Food Engineering,Nanchang University,Nanchang 330031,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hyriopsis schlegelii Hemocyte cDNA library Aeromonas hydrophila Cyclophilin A |
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