| 嗜热四膜虫腺苷三磷酸结合盒转运蛋白ABCC10基因的可变剪切分析 |
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| 引用本文： | 陆星亦,熊杰,袁冬霞,缪炜.嗜热四膜虫腺苷三磷酸结合盒转运蛋白ABCC10基因的可变剪切分析[J].动物学研究,2011,32(6). |
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| 作者姓名： | 陆星亦 熊杰 袁冬霞 缪炜 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院水生生物研究所 水生生物多样性与保护重点实验室,湖北 武汉 430072;中国科学院研究生院,北京 100049
2. 中国科学院水生生物研究所 水生生物多样性与保护重点实验室,湖北 武汉,430072 |
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| 摘 要： | 哺乳动物中腺苷三磷酸结合盒转运蛋白(ATP-binding cassette transporter,ABCT)可通过可变剪切产生多种转录本,其中含有提前终止密码子(premature terminal codon,PTC)的转录本还可与无义介导的mRNA降解通路(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作用来调节蛋白的相关功能,但这些现象尚未在低等生物的ABCT研究中发现.该文以单细胞原生动物——嗜热四膜虫为对象,利用转录组数据发现ABCC10基因存在可变剪切,并产生两条转录本(SV1和SV2),其中SV2在第五个内含子处发生内含子保留事件,这段长49bp的序列使SV2发生移码并产生PTC.在构建NMD通路中关键因子UPF1基因的嗜热四膜虫敲降株的基础上,利用实时荧光定量PCR方法检测SV2的转录情况.结果显示:含有PTC的转录本SV2在UPF1敲降株中的转录水平相对于野生型显著增加,说明SV2可被NMD通路降解.这与高等动物中某些ABCC蛋白通过可变剪切引入含PTC转录本,并能被NMD降解的方式一致,推测该方式在真核生物中十分保守,并在真核生物的共同祖先(the last eukaryotic common ancestor)中就已形成.
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| 关 键 词： | 嗜热四膜虫 ABC转运蛋白 可变剪切 实时荧光定量PCR NMD |
Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila |
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| LU Xing-Yi
,
XIONG Jie
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YUAN Dong-Xia
,
MIAO Wei.Alternative splicing of an ATP-binding cassette transporter ABCC10 in Tetrahymena thermophila[J].Zoological Research,2011,32(6). |
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| Authors: | LU Xing-Yi XIONG Jie YUAN Dong-Xia MIAO Wei |
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