中国1995～1999年鸡传染性支气管炎病毒地方分离株核蛋白基因的遗传变异分析

应用RT-PCR方法扩增到了我国1995~1999年10株IBV现地分离株的核蛋白基因片段,并将其进行了克隆、序列测定及分析。结果发现,10株IBV分离株核蛋白基因均含有一个长1 230bp的ORF,编码由409个氨基酸残基组成的多肽,未发现碱基的插入和缺失。与GenBank中的20个IBV参考毒株核蛋白基因序列进行比较和分析,发现本研究分离的毒株主要分布于3个群中,该3群病毒主要包括我国IBV现地分离株。对n基因及其局部功能区序列比较发现,我国分离株与H120疫苗株N蛋白存在广泛的氨基酸变异。通过与s1基因系统发育进化树比较发现,我国IBV分离株存在基因重组现象。以上结果表明我国1995~1999年IBV毒株存在基因突变和基因重组现象。     

重组SARS病毒N蛋白可与SARS患者血清发生特异反应

N蛋白是SARS CoV病毒基因组编码病毒核衣壳蛋白 ,它不同于现已知的任何蛋白质 .对它的深入研究对揭示SARS -CoV的致病机理和疫苗及诊断试剂的研制有重要意义 .灭活的病毒经逆转录后 ,用根据已知的病毒的基因组序列所设计的引物PCR扩增N蛋白基因 .扩增出的基因经序列分析表明和已知的序列完全一致 ,共编码 4 2 2个氨基酸残基 .将N蛋白基因克隆入原核表达载体pET2 8a构建成表达质粒pET2 8a N .表达质粒转化大肠杆菌BL2 1 (DE3) ,并用IPTG诱导后 ,获得了高表达N蛋白的重组菌株 .目的蛋白经一步金属离子螯合层析纯化后获得了纯度超过 90 %的样品 .Western印迹及ELISA分析表明 ,SARS患者体内有特异性的针对N蛋白的抗体 ,并具有较高的特异性 .这为临床上诊断SARS患者提供了新方法 ,并为SARS疫苗的研制提供了研究思路     

严重急性呼吸系统综合征冠状病毒N蛋白对甘油三酯和总胆固醇含量的影响

目的:研究严重急性呼吸系统综合征冠状病毒(SARS-CoV)N蛋白对甘油三酯和总胆固醇含量的影响。方法:检测分析144例SARS患者甘油三脂和总胆固醇含量在发病后的变化;将小鼠随机分组,分别注射生理盐水和SARS-CoV N蛋白,连续给药9 d后检测小鼠血清中甘油三酯和总胆固醇含量的变化。结果:SARS患者的甘油三酯和总胆固醇含量随发病时间有升高变化(P0.05),在发病40 d前后甘油三酯和总胆固醇含量超标的病例数占本时间段内的病例数的比例显著高于其他时间段,而且超标的含量也明显升高。SARS-CoV N蛋白使小鼠体重明显高于对照组(P0.05),甘油三酯含量在39和51 d明显高于对照组(P0.05),总胆固醇含量在21和39 d也明显高于对照组(P0.05)。结论:SARS-CoV N蛋白可以升高小鼠的甘油三酯和总胆固醇的含量,其升高最为明显的时间段与SARS患者的甘油三酯和总胆固醇含量升高的时间段基本一致。由此推测,SARS-CoV N蛋白可能是促使SARS患者发病后甘油三酯和总胆固醇含量升高的重要原因。     

汉坦病毒H8205部分核壳蛋白基因在E.coli中的表达

根据汉坦病毒Ｈ８２０５株ＮＰ基因的序列,设计一对引物,扩增ＮＰ前２９２个氨基酸多肽基因片段,克隆于表达载体ｐＧＥＸ３Ｘ,与载体中２６ｋＤ的谷胱苷肽巯基转移酶（ＧＳＴ）融合表达。ＳＤＳＰＡＧＥ显示表达产物（ＧＳＴＮＰ）主要以包涵体形式存在。Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔｉｎｇ表明此融合蛋白有抗原性。包涵体经分离、洗涤、溶解后,Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ６Ｂ层析纯化,用此融合蛋白作抗原,进行ＥＬＩＳＡ法检测临床ＨＦＲＳ病人标本的ＩｇＧ和ＩｇＭ,有很好的特异性和敏感性。有生物活性的汉坦病毒Ｈ８２０５ＮＰ的体外表达成功,为汉坦病毒基因工程抗原的大量制备奠定了基础,也为汉坦病毒的临床检测和流行病学调查提供了一种廉价、安全、可靠的抗原。     

棉铃虫单核衣壳核多角体病毒囊膜蛋白odv—e66基因及其邻近区域的序列分析

杆状病毒ODV－E66蛋白是包涵体来源病毒（occlusion-derived virus,ODV）囊膜的结构蛋白,ODV囊膜对ODV的稳定性和感染性具有重要作用。本文报道了HaSNPV odv-e66基因及其邻近区域共4237bp的核苷酸序列及其分析结果。HaSNPV的odv-e66基因编码区全长2019bp,推测编码一个由672个氨基酸残基组成的,分子量为74.5kD的蛋白质。在起始密码子ATG上游具有杆状病毒晚期转录起始信号ATAAG。与其他杆状病毒ODV－E66的氨基酸序列比较分显示HaSNPV ODV-E66蛋白具有多个保守区域,包括N末端的强疏水功能区、序列中部的一个可能的核定位信号RKIW,两个Leu-xipper以及5个跨膜区。odv-e66基因上游的两个ORF分别与AcMNPV的orf108和orf109具有同源性,下游的ORF与LsNPV的p13基因具有同源性。     

检测牛冠状病毒抗体间接ELISA方法的建立与应用

[背景]牛冠状病毒(Bovine coronavirus,BCoV)是引起新生犊牛死亡的主要病原之一,有效的检测手段是防治该病的前提。目前BCoV ELISA检测方法存在敏感性低、不稳定等缺陷。[目的]对原有BCoV ELISA方法进行改进,建立间接ELISA检测方法。[方法]应用我国BCoV流行毒株CD株n基因为模板,预测N蛋白抗原表位,通过原核表达制备可溶性的重组N蛋白作为抗原,建立间接ELISA方法,应用该方法对黑龙江省2010-2017年的BCoV感染进行血清流行病学调查。[结果]该ELISA方法最佳工作条件为:用50 mmol/LpH 9.6碳酸盐作为包被液,抗原包被浓度2.5μg/mL;用PBST作为样本稀释液,稀释浓度1:50,37℃孵育1.5 h;HRP-羊抗牛IgG稀释浓度1:7 500,37℃孵育1.0 h;用1%明胶37℃封闭30 min。阴阳性临界值为0.225。该方法与BRV、BRSV、BVDV、IBRV、BPIV3和E.coli阳性血清均无交叉反应。批内和批间变异系数均小于10%,与病毒中和试验的符合率高达93.5%。对黑龙江省部分地区共603份奶牛血清样品检测结果显示,BCoV抗体阳性率为98.84%。[结论]建立的ELISA方法特异性强、敏感性高、稳定性好,为进一步研发ELISA试剂盒提供了技术基础。     

Emergence,evolution, and vaccine production approaches of SARS-CoV-2 virus: Benefits of getting vaccinated and common questions

The emergence of coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic in Wuhan city, China at the end of 2019 made it urgent to identify the origin of the causal pathogen and its molecular evolution, to appropriately design an effective vaccine. This study analyzes the evolutionary background of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2 or SARS-2) in accordance with its close relative SARS-CoV (SARS-1), which was emerged in 2002. A comparative genomic and proteomic study was conducted on SARS-2, SARS-1, and Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS), which was emerged in 2012. In silico analysis inferred the genetic variability among the tested viruses. The SARS-1 genome harbored 11 genes encoding 12 proteins, while SARS-2 genome contained only 10 genes encoding for 10 proteins. MERS genome contained 11 genes encoding 11 proteins. The analysis also revealed a slight variation in the whole genome size of SARS-2 comparing to its siblings resulting from sequential insertions and deletions (indels) throughout the viral genome particularly ORF1AB, spike, ORF10 and ORF8. The effective indels were observed in the gene encoding the spike protein that is responsible for viral attachment to the angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) cell receptor and initiating infection. These indels are responsible for the newly emerging COVID-19 variants αCoV, βCoV, γCoV and δCoV. Nowadays, few effective COVID-19 vaccines developed based on spike (S) glycoprotein were approved and become available worldwide. Currently available vaccines can relatively prevent the spread of COVID-19 and suppress the disease. The traditional (killed or attenuated virus vaccine and antibody-based vaccine) and innovated vaccine production technologies (RNA- and DNA-based vaccines and viral vectors) are summarized in this review. We finally highlight the most common questions related to COVID-19 disease and the benefits of getting vaccinated.