科学出版社生命科学编辑部新书推介（2006-1月）

《微生物基因组》；《混沌生物学》（生命科学交叉系列）；《数字创世纪：人工生命的新科学》（生命科学交叉系列）；《脑与非线性动力学》（生命科学交叉系列）；《中国遗传伦理的争鸣与探索》（生命科学交叉系列）；     

动态

我国科学家成功解析SARS冠状病毒进化规律全国防治非典科技攻关组和广东省防治非典科技攻关领导小组 1月30日在广州宣布 ,我国科学家经过 8个月的联合攻关 ,在防治SARS基础理论研究中取得重大突破。1月 2 9日美国《科学》杂志全文公布了中国课题组研究SARS的分子流行病学 ,解析     

大豆结瘤突变体成分的初步分析及其对硝酸还原酶活性和结瘤的影响

超结瘤大豆（Ｇｌｙｃｉｎｅ ｍ ａｘ （Ｌ．） Ｍｅｒｒ．） ｎｔｓ ３８２ 和不结瘤大豆Ｎｏｄ ４９ 的叶和根组织水提取物经Ｓｅｐｈａｄｅｘ Ｇ２５ 过滤、洗脱,再根据洗脱物对硝酸还原酶（ＮＲ）活性的影响可划分为４ 个组分（ｆｒａｃｔｉｏｎ）样品,即ｎｔｓ ３８２（Ｎｏｄ ４９） Ｆ１、ｎｔｓ ３８２（Ｎｏｄ ４９） Ｆ２、ｎｔｓ ３８２（Ｎｏｄ ４９） Ｆ３ 和ｎｔｓ ３８２（Ｎｏｄ ４９） Ｆ４。其中, ｎｔｓ３８２ Ｆ２ 和Ｆ４ 抑制ＮＲ 活性作用在接种ＵＳＤＡ１１０ 后明显下降, 但接种的ｎｔｓ ３８２ Ｆ２ 却能提高大豆Ｂｒａｇｇ 的结瘤数达一倍, 而接种的ｎｔｓ ３８２ Ｆ３ 和Ｆ４ 的作用不明显。ＮＲ 活性抑制因子不是刺激结瘤的因子, 刺激结瘤的因子主要分布在接种的ｎｔｓ３８２ Ｆ２ 部分中。与这一现象相反, Ｎｏｄ ４９ Ｆ２ 和Ｆ４ 抑制ＮＲ活性的作用在接种后更强, 且也抑制大豆ｎｔｓ ３８２ 的结瘤, 其中Ｎｏｄ ４９ Ｆ４ 抑制结瘤的作用基本不能逆转。抑制结瘤因子主要分布在接过种的Ｎｏｄ ４９ Ｆ４ 部分中     

寄主大豆对根结瘤的控制

我国９个大豆品种感染根瘤菌ＵＳＤＡ１１０后,产生不同的结瘤数,低者在２０个以下,高者在６０个以上。赤豆、绿赤豆也可被感染结瘤,而豇豆、扁豆则不能。超结瘤大豆ｎｔｓ３８２作为接穗时能诱导我国大豆原结瘤数有４５个的开育１０号、原结瘤数有１２个的大黄分别发生高结瘤。ｎｔｓ３８２作为砧木时,则不能表现超结瘤,表达超结瘤因子能传给我国大豆,反之存在于我国大豆中的限制超结瘤的因子也能传给ｎｔｓ３８２。ｎｔｓ３     

青皮核桃采后病害生防菌贝莱斯芽胞杆菌XRD006全基因组分析及防治效果研究

【目的】探究生防菌贝莱斯芽胞杆菌(Bacillus velezensis) XRD006对青皮核桃采后病害的生防能力及其贮藏保鲜效果,解析菌株的基因特性和次级代谢产物,了解菌株的抑菌机制。【方法】通过抑菌试验确定XRD006对青皮核桃采后病原菌的抑制能力。利用活体抑菌及贮藏试验探究生防菌对青皮核桃采后病原菌的抑制能力及对青皮核桃贮藏品质的影响。以全基因组测序了解菌株XRD006的基因组特征及潜在抑菌相关基因;利用antiSMASH软件预测XRD006的次级代谢产物;结合比较基因组学分析XRD006和贝莱斯芽胞杆菌标准株FZB42、SQR9之间的共线性关系和次级代谢产物基因簇差异。利用高效液相色谱(high performance liquid chromatography,HPLC)和质谱鉴定XRD006次级代谢产物并通过牛津杯法测定其抑菌能力。【结果】抑菌试验表明菌株XRD006对青皮核桃采后病原菌隐秘刺盘孢(Colletotrichum aenigma)、暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)、葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea)和藤仓...     

基于单细胞测序构建胶质母细胞瘤预后模型

[目的]基于单细胞测序筛选胶质母细胞瘤特征基因并构建预后模型。[方法]分析GEO数据库单细胞RNA测序数据集GSE84465,筛选出GBM细胞分化相关的差异基因。下载TCGA数据库GBM的基因表达谱和临床数据,采用Lasso回归、Cox回归分析筛选出特征基因构建预后模型,根据独立预后因素构建列线图,GSE83300作为外部验证集。基于风险评分中位数将患者分组,比较两组生存差异。[结果]通过scRNA-seq得到492个分化差异基因,经过回归分析得到基于6个基因(PLAUR、RARRES2、G0S2、MDK、SERPINE2、CD81)的预后模型。其1、3、5年ROC曲线下面积均大于0.7;KM分析显示高低风险组预后存在差异(P<0.001),GSE83300验证结果与TCGA一致。多因素Cox回归分析表明年龄和风险评分可以作为独立影响因素(P<0.01);C-Index(0.679)、校准图显示列线图预测模型有良好的拟合度。GSEA分析示高低风险组差异基因集参与细胞因子受体相互作用、抗原处理与提呈等通路。[结论]由PLAUR、RARRES2、G0S2、MDK、SERPINE...     

人类Y染色体常染色质部分DNA YAC重叠克隆构建

人类基因组研究的目标在于人类基因组全部DNA的核苷酸顺序的测定,及在此基础上的对所有基因的编码及其生化功能的研究。全基因组DNA的完全的物理图谱构成,包括全基因组DNA的大片段克隆,及覆盖完整基因组的克隆重叠排序是达成这一目标的首要步骤。