植物形态学线图绘制

图象表达是植物形态学中很重要的部分,植物的图形是说明植物形态特征的最好方式,也被称为植物形态学的最好“语言”。一般不论从外形、显微结构或超微结构上,都需要有不同尺度的图形来说明,也就是说,植物形态学的研究与教学,都需要利用各种图形来表示。在植物形态学的发展史中,线图一直受到重视,许多经典著作中的线图,至今仍被引用,例如1874年萨克斯(Sachs)的“植物学教科书”(Textbook of Botany),距今已     

基于甲基化组学数据建立并验证肝细胞癌预后评价模型研究

利用甲基化CG位点建立并验证肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）预后相关模型是当前的研究热点。利用R语言平台分析肝癌基因组图谱数据库（TCGA-LIHC）和基因表达综合数据库（GSE136380）甲基化组学数据,采用limma包分析TCGA-LIHC和GSE136380数据差异甲基化CG位点,采用wgcna包对GSE136380进行加权基因共表达网络分析,确定三者交集为关键甲基化CG位点集,共获得83个甲基化CG位点。利用LASSO-COX风险比例回归分析筛选出6个甲基化CG位点,包括cg15744128、cg24282479、cg17922226、cg13090969、cg23505966和cg08708079,构建并验证HCC外科切除术后的预后模型。拟合模型在训练集中1、3和5年的AUC分别是0.756(95%CI:0.644～0.876)、0.749(95%CI:0.638～0.854)和0.797(95%CI:0.661～0.920);测试集中1、3和5年的AUC分别为0.848(95%CI:0.680～0.990)、0.833(95%CI:0....     

Drawing method of the black line chart in botanical scientific illustration

墨线图是植物科学绘画中常用的表现形式之一,在植物学研究领域中得到广泛应用,它具有科学性强、真实自然、简洁明快、优美精致和印刷方便等特点,其绘法技法具有一定的特殊性.该文对植物科学绘画中墨线图的绘法作了详细的介绍和阐述.     

一种利用ViewGIS软件绘制生物墨线图的方法

本文介绍一种利用ViewGIS地信之窗软件绘制生物墨线图的方法,该方法较好地克服了传统手工绘图中存在的问题,具有操作简单、结构特征准确、耗时短、比例准确等特点.     

基于鸟类边缘种行为的景观连接度研究——空间句法的反规划应用

在城市森林及其他生态景观的研究与规划中,结合特定物种(使用者)行为的景观连接度已得到业界越来越多的重视。为了给基于物种行为的景观连接度提供新的建模和分析理念,拟将建筑及城市规划学科中一种可靠的人工智能语言通过反规划思想引入景观生态学领域,通过模拟演绎展示空间句法在研究中的优越性。鉴于鸟类边缘种的栖息地景观构型特点,将空间句法轴线图借用于基于鸟类边缘种行为的景观连接度研究。首先介绍了传统景观连接度的量化方法及物种迁移模型,通过文献综述归纳出此类研究方法的局限性;接着,由反规划启蒙提出将空间句法模型引入"边缘种-栖息地"互动研究的设想;最后,以贺州城市森林规划为例,利用空间句法轴线图探究基于鸟类边缘种行为的景观连接度。模拟实验旨在展示轴线图模型能反映物种对不同景观元素非等权重的选择行为,并可根据物种邻域感知信息预测其复合尺度的行为。     

真花说与假花说有关教学问题的商榷

有关被子植物花的起源主要有两种假说,即真花说和假花说,自1978年以来,高等学校植物学教材中用4个线图来表达该图解,但对大学生的理解存在一定困难;本文增加4个线图,并进一步阐明“真花”与“假花”的原理、概念。     

植物学教学中线图的创新

北京大学的李正理教授曾经指出:植物的图形是说明植物形态特征的最好方式,也被称为植物形态学的最好“语言”……植物形态学的研究与教学,都需要利用各种图形来表示。然而,以往植物学教科书的编写或改版,多偏重于文字内容的写作,而忽视了图形的创新。由于图形的创作既要求作者对植物种类形态特征进行认真研究,又要具有较好的绘图技能,或具较好拍摄照片的设备条件,一幅理想的图形是作者教学、研究心得和艺术的结晶。从这个角度来说,它较单纯文字的编写难度大,因此,一些不完全适合教学需要的图形仍继续被沿用,某     

经脐单孔腹腔镜胆囊切除术后切口感染的列线图模型预测价值研究及防治策略分析

摘要 目的：探讨经脐单孔腹腔镜胆囊切除术后切口感染的列线图模型预测价值及防治策略。方法：回顾性分析2018年10月-2021年5月合肥市第一人民医院收治的经脐单孔腹腔镜胆囊切除术患者94例的临床资料,根据患者术后是否发生切口感染分为感染组（n=12例）和非感染组（n=82例）。查阅两组病历资料,对患者术后切口感染的可能影响因素进行单因素及多因素Logistic回归分析;引入R软件建立经脐单孔腹腔镜胆囊切除术后切口感染预测模型并绘制列线图模型,获得预测风险值;绘制ROC曲线,分析列线图模型对术后切口感染的预测效能。结果：94例经脐单孔腹腔镜胆囊切除术患者中12例术后切口发生感染,感染率为12.77%。多因素Logistic回归分析结果表明：年龄、手术时间、住院时间、胆囊破裂是经脐单孔腹腔镜胆囊切除术后切口感染发生的影响因素（P<0.05）;列线图模型看出：年龄得分为63分,住院时间得分为37.6分,手术时间得分为71.5分,胆囊破裂得分为50分,预测风险值为2.221,ROC曲线下面积为0.832。结论：经脐单孔腹腔镜胆囊切除术后切口感染率较高,且受到的影响因素较多,基于上述影响因素构建的预测模型能获得较高的预测效能,值得推广应用。     

结合自噬相关基因表达谱和临床因素的肺腺癌预后预测模型

对肺腺癌自噬相关基因进行生物信息学分析,结合多基因预后标志和临床参数构建能够预测肺腺癌患者预后的模型。首先,对TCGA肺腺癌数据中的938个自噬相关基因进行差异分析,获得了82个差异自噬相关基因,使用单因素Cox比例风险回归模型从差异自噬相关基因中筛选出候选基因,通过 lasso回归进一步筛选出预后相关基因,分别是ARNTL2、NAPSA、ATG9B、CAPN12、MAP1LC3C和KRT81。通过多因素Cox回归分析以构建风险评分模型,根据最优cutoff值将患者分为高低风险组,生存曲线显示高低风险组之间生存差异显著,ROC曲线显示风险评分的预测能力良好,并在内、外验证集中得到验证。同时对传统的临床因素进行单因素和多因素Cox回归分析,结果显示Stage、复发和风险评分能够独立预测预后,结合这三个独立的预后参数以构建列线图模型,使用一致性指数、校准曲线评估列线图的预测能力,结果显示预测结果与实际结果之间具有良好的一致性。通过与Stage和风险评分的比较发现,列线图的预测能力表现最佳。基于肺腺癌相关的自噬基因和临床参数构建了一个列线图模型来预测肺腺癌患者的预后生存,这可能为临床医生提供了一种可靠的预后评估工具。     

植物科学绘画中墨线图的绘画方法

墨线图是植物科学绘画中常用的表现形式之一,在植物学研究领域中得到广泛应用,它具有科学性强、真实自然、简洁明快、优美精致和印刷方便等特点,其绘法技法具有一定的特殊性。该文对植物科学绘画中墨线图的绘法作了详细的介绍和阐述。