Windows操作系统下二代测序数据处理平台的建立及高通量信息分析标准流程在个人计算机上的实现

当前二代测序数据的处理广泛使用基于标准版本的Linux操作系统分析方法。这一系统专业性强,成本较高,操作界面不够友好,严重限制了大多数科研人员对数据的自主分析。本文创建了一个基于微软Windows操作系统的全功能二代测序数据的生物信息学分析系统,利用该系统经优选实现当前多种高通量测序数据的主流标准化分析流程。通过RNA-Seq的代表性案例,演算实测数据与传统Linux系统驱动的数据分析结果相比较,结果显示,本系统的组件和流程在常用的数据分析过程中,可以基本取代目前主流的Linux服务器或云计算平台,在运行效率相近的情况下,其操作极为简便且成本大大降低。本系统与所配附的编译软件及流程脚本,不仅为测序数据的生物信息学分析实操演练提供全面的解决方案,而且可以直接应用于专业的测序数据分析中。     

赛默飞展示端到端的生物样本库和生物储存库解决方案

整体式生物样本库解决方案保障了生物样本的质量,提高了效率并促进了信息共享 中国上海,2011年11月16日——全球科学服务领域的领导者赛默飞世尔科技（以下简称：赛默飞）于11月16-19日期间在法国马赛举行的ESBB2011上展示其整体式生物样本库解决方案。这一综合性解决方案保障了生物样本质量,并涵盖了完整的生物样本库工作流程,包括样本收集、处理、     

基于信息技术平台的医院会诊模式重建

????? 临床会诊是综合性医院的一项经常性医疗活动,会诊制度也是一项基本的医疗制度。利用信息技术的平台,改变原有的传统会诊模式,再造新型的电子会诊模式,对于加强医疗会诊管理,控制医疗质量,确保医疗安全可起到重要的作用。

     

基于信息系统的放射检查流程优化

目的 分析信息系统对检查流程优化的价值。方法 比较信息系统应用前后患者接受放射学检查的流程环节和耗费的时间。结果 信息系统应用前,患者需完成6个步骤,放射科进行7个步骤,整个流程均为手工纸质操作,流程时间1天半。信息系统应用后,患者完成5个步骤,放射科完成5个步骤,整个流程均为信息化操作,流程时间半天到1天。结论 信息系统可以减少放射检查流程环节,提高工作效率,减少病人检查时间。     

Acknowledgement to all reviewers for Virologica Sinica in 2013

In the fruitful year of 2013,the impact of Virologica Sinica （VS） as been largely extended.The successful publication of VS with high-quality articles is largely benefited from the efforts made by experts listed below,who were committed in managing the editorial process and/or in peer-reviewing.Apology was offered to any reviewer whose name has been inadvertently omitted.The time and expertise of all the experts devoted to Virologica Sinica are greatly appreciated!     

系统发育分析中的最大简约法及其优化

随着生物技术的不断发展和系统发育学的深入研究, 在重构系统发育树时, 研究人员往往要面对更多的挑战和困难, 比如： (1)需要分析的样本数（物种数或个体数）不断增加; (2)需要分析的数据量迅速扩大。尤其在基因组测序技术的推动下, 基于分子信息的系统发育重建需要极大的计算量, 因此数学方法、 计算机技术以及其他辅助工具对于系统发育重建的效率和精确度起着至关重要的作用。最大简约法（maximum parsimony）是一种重要的系统发育重建方法, 提高其计算效率对系统发育学研究具有重要意义, 针对该算法的优化改进需要生物学家和计算机专家的共同努力。本文通过详细地阐述最大简约法的计算流程, 分析其参数选择对计算效率的影响, 帮助更多的计算机使用者, 在并不了解系统发育学基础的情况下, 更方便地针对实际的系统发育算法问题给出更好、 更快、 更精准的解决方案; 同时为系统发育研究工作者, 较为清晰地解释最大简约法的构树思想和计算逻辑, 推动针对最大简约法的不断改进与优化。     

住院服务中心模式流程再造的探索与实践

通过推进电子化预约登记,整合“预约登记、安排入院、入院检查、出院随访”服务流程,以信息化统筹全院床位,再造了入院流程。住院服务中心模式的实施,缩短了患者入院前等候时间,简化入院手续办理和入院后检查检验流程,缩短患者平均住院日,提高了床位使用率。     

中药制药工艺及设备使用分析

在中药制药专业的学习过程中,"中药制药工艺及设备"占据了重要地位.而本文将从传统的中药理论为起点,结合传统中药与现代中药的生产工艺,深入的研究总结了高新技术在中药生产中所发挥的巨大作用。设备与劳动者、劳动对象共同列为人类生产力的组成要素,由此可见设备也是中药制药工艺中所不可缺少的部分,因此本文也将重点介绍中药制药过程中所需要的设备的具体使用方法,同时也将就设备与工艺的共同问题与读者进行进一步的交流与学习。