花生种子高纯度DNA的提取（简报）

花生种子高纯度ＤＮＡ的提取（简报）王艳,何军贤,傅家瑞（中山大学生命科学学院,广州５０２７５）关键词花生;种子;ＤＮＡ;十六烷基三甲基溴化铵ＲＡＰＩＤＡＮＤＥＦＦＩＣＩＥＮＴＰＵＲＩＦＩＣＡＴＩＯＮＯＦＤＮＡＦＲＯＭＰＥＡＮＵＴ（ＡＲＡＣＨＩＳＨＹＰ...     

不同酸水解酪蛋白对W135群和Y群脑膜炎奈瑟菌荚膜多糖产量的影响

目的 探索不同酸水解酪蛋白对W135群与Y群脑膜炎奈瑟菌(脑膜炎球菌)荚膜多糖产量的影响。方法 分别以NaCl质量分数为37%和14%的酸水解酪蛋白作为有机氮源配制改良半综合高盐培养基和低盐培养基,利用全自动细菌发酵罐分别在两种培养基里培养W135群和Y群脑膜炎球菌,比较这两种菌株在两种培养基中的生长时间、收获液菌密度( A 600 nm 值)、收获液去菌体后与去复合多糖后上清中的荚膜多糖含量,以及纯化后的精糖产量;比较高盐培养基收获液及其2倍稀释液中不同终含量的十六烷基三甲基溴化铵(cetyltrimethylammonium bromide, CTAB)溶液对多糖沉淀效果的影响。结果 W135群与Y群脑膜炎球菌在两种培养基中的培养时间差异无统计学意义( P >0.05),但高盐培养基收获液的菌密度、收获液去菌体后上清液中的多糖含量均高于低盐培养基收获液,差异有统计学意义( P < 0.05),而高盐培养基收获液纯化后的精糖产量低于低盐培养基,差异有统计学意义( P <0.05)。高盐培养液2倍稀释后,在CTAB终体积分数为0.04%时,W135群与Y群脑膜炎球菌多糖全部沉淀,而未稀释高盐培养液即使CTAB终体积分数提高到0.14%,依然也不能完全沉淀 W135群与Y群脑膜炎球菌多糖。结论 不同酸水解酪蛋白对W135群和Y群脑膜炎球菌的生长密度和荚膜多糖产量有影响,用CTAB溶液沉淀荚膜多糖时需控制收获液盐含量。     

添加CTAB促进吸水链霉菌产谷氨酰胺转胺酶

研究了添加十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)对吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus)合成谷氨酰胺转胺酶的影响。结果表明,添加CTAB可以提高发酵过程中谷氨酰胺转胺酶的酶活,摇瓶培养中,CTAB的最佳添加时间和添加量分别为32h和1%,发酵终了时,谷氨酰胺转胺酶酶活最高达5.04u/mL,比对照提高了21.8%。初步研究表明,CTAB的主要作用是促使谷氨酰胺转胺酶的酶原转化为成熟酶,因此,在发酵过程中添加适当浓度的CTAB,可使酶原快速、完全地转化为成熟的MTG,解除酶原的产物抑制作用,促进了细胞产酶。     

CTAB选择性沉淀和纯化质粒DNA工艺的建立

通过直接在大肠杆菌碱裂解上清中加入十六烷基三甲基溴化铵(CTAB), 优化CTAB与质粒DNA量的比例、质粒DNA选择性释放溶液的选择和TritonX-114的使用, 建立了简单、易行的大规模质粒DNA纯化工艺。纯化质粒DNA的质量检测结果显示, CTAB纯化的质粒DNA无菌体RNA污染, 菌体基因组DNA、内毒素和蛋白含量分别小于 100 ng/mg、50 EU/mg和10 mg/mg质粒DNA, OD260/OD280比值介于1.75~1.85之间, 超螺旋质粒DNA的比例大于80%, 该工艺纯化的质粒DNA能达到或接近FDA规定的人用质粒DNA的各项指标, 整个过程不使用动物源性酶和苯酚、氯仿、无水乙醇等有毒或易燃、易爆试剂, 成本低廉, 工艺环保。     

十六烷基三甲基溴化铵对枯草杆菌( B. subtilis )黄嘌呤缺陷型菌株产生腺苷的影响

在枯草杆菌中,嘌呤核柑酸合成途径中丰在AMP和GMP转变成IMP的环行途径,而在该菌的黄嘌呤缺陷型菌株中IMP至XMP的分枝途径被阻塞,同时在该菌株内又有强的5’一核苷酸酶活性,这使其可以生成腺苷（AR）,但反馈抑制是腺苷产率的一个重要影响因素,使用季铵盐阳离子表面活性剂十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）可改善细胞的渗透性,减少细胞内产物的反馈抑制,促进产物的分泌,结果表明,在发酵60h添加4％的CTAB能使产率从3．0g/l提高到3．6g/l,提高幅度达20％。     

添加CTAB促进吸水链霉菌产谷氨酰胺转胺酶

研究了添加十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）对吸水链霉菌（Streptomyces hygroscopicus）合成谷氨酰胺转胺酶的影响。结果表明,添加CTAB可以提高发酵过程中谷氨酰胺转胺酶的酶活,摇瓶培养中,CTAB的最佳添加时间和添加量分别为32h和1%,发酵终了时,谷氨酰胺转胺酶酶活最高达5.04u/mL,比对照提高了21.8%。初步研究表明,CTAB的主要作用是促使谷氨酰胺转胺酶的酶原转化为成熟酶,因此,在发酵过程中添加适当浓度的CTAB,可使酶原快速、完全地转化为成熟的MTG,解除酶原的产物抑制作用,促进了细胞产酶。     

DNA Extraction Protocol for Biological Ingredient Analysis of Liuwei Dihuang Wan

Traditional Chinese medicine(TCM) preparations are widely used for healthcare and clinical practice. So far, the methods commonly used for quality evaluation of TCM preparations mainly focused on chemical ingredients. The biological ingredient analysis of TCM preparations is also important because TCM preparations usually contain both plant and animal ingredients,which often include some mis-identified herbal materials, adulterants or even some biological contaminants.For biological ingredient analysis, the efficiency of DNA extraction is an important factor which might affect the accuracy and reliability of identification. The component complexity in TCM preparations is high, and DNA might be destroyed or degraded in different degrees after a series of processing procedures. Therefore, it is necessary to establish an effective protocol for DNA extraction from TCM preparations. In this study, we chose a classical TCM preparation,Liuwei Dihuang Wan(LDW), as an example to develop a TCM-specific DNA extraction method.An optimized cetyl trimethyl ammonium bromide(CTAB) method(TCM-CTAB) and three commonlyused extraction kits were tested for extraction of DNA from LDW samples. Experimental results indicated that DNA with the highest purity and concentration was obtained by using TCM-CTAB. To further evaluate the different extraction methods, amplification of the second internal transcribed spacer(ITS2) and the chloroplast genome trnL intron was carried out.The results have shown that PCR amplification was successful only with template of DNA extracted by using TCM-CTAB. Moreover, we performed high-throughput 454 sequencing using DNA extracted by TCM-CTAB. Data analysis showed that 3–4 out of 6 prescribed species were detected from LDW samples, while up to 5 contaminating species were detected, suggesting     

红树DNA的十六烷基三甲基溴化铵法提取及其随机扩增多态DNA反应

采用ＣＴＡＢ法提取了耐盐植物红树ＤＮＡ,所得ＤＮＡ样品的紫外吸收Ａ２５８／Ａ２８０比值为１．８９,纯度能符合限制性内切酶酶切、ＰＣＲ反应以及ＤＮＡ重组克隆等分子生物学操作的要求．方法简便,容易掌握,较普通的酚－氯仿法有明显的优点．还探讨了以ＣＴＡＢ法制备的红树ＤＮＡ为模板进行ＲＡＰＤ反应参数的优化组合     

W／O微乳液中糖化酶的研究

在十六烷基三甲基溴化铵/正戊醇/异辛烷/水体系中,选取W/O型微乳液作为糖化酶的微环境,研究了其催化活性.并与其在水溶液中进行了比较.结果表明,在微乳液中,糖化酶催化淀粉水解反应的最佳反应温度和pH比在水溶液中低,反应的最大速度V_m和米氏常数K_m比其在水溶液中分别提高了近6倍和3倍.     

一种高效的哺乳动物粪便DNA提取通用方法

以粪便为材料提取动物DNA进行动物保护遗传学和分子生态学研究的关键是能否提取到高质量的粪便DNA.然而提取方法通用性不好和产物质量不高等问题阻碍了粪便DNA分析技术的推广.本文介绍的改进型十六烷基三甲基溴化铵提取法可广泛适用于各食性哺乳动物粪便DNA提取,在11种不同食性动物的粪便DNA提取实验中验证了它的可靠性和通用性.本方法成本低廉(3元/样),用实验室常规试剂即可完成粪便DNA提取,其产物纯度高于专用试剂盒QIAamp DNA Stool Kit,在拥有超过专业试剂盒提取效果的同时尽可能的降低了实验成本,有利于粪便DNA技术的推广.