Indinavir resistance evolution in one human immunodeficiency virus type 1 infected patient revealed by single-genome amplification

Abstract  

Human Immunodeficiency Virus Type 1 exists in vivo as quasispecies, and one of the genome’s characteristics is its diversity. During the antiretroviral therapy, drug resistance is the main obstacle to effective viral prevention. Understanding the molecular evolution process is fundamental to analyze the mechanism of drug resistance and develop a strategy to minimize resistance.     

HIV-1 Vif protein mediates the degradation of APOBEC3G in fission yeast when over-expressed using codon optimization

Interaction between the HIV-1 Vif protein and the cellular host APOBEC3G protein is a promising target for inhibition of HIV-1 replication. Considering that human cells are a very complicated environment for the study of protein interactions, the goal of this study was to check whether fission yeast could be used as a model cell for studying the Vif-APOBEC3G interaction. Vif and APOBEC3G were expressed in fusion with GFP protein in the S. pombe SP223 strain. Subcellular localizations of Vif and APOBEC3G were observed with fluorescent microscopy. Codon optimization was used to over express the Vif protein in S. pombe cells. The degradation of APOBEC3G mediated by Vif was tested through expressing Vif and GFP-APOBEC3G proteins in the same cell. Western Blot analysis was used to measure the corresponding protein levels under different experimental conditions. The results showed that the Vif protein was predominantly localized in the nucleus of S.pombe cells, APOBEC3G was localized in the cytoplasm and concentrated at punctate bodies that were often in close proximity to the nucleus but were not necessarily restricted from other regions in the cytoplasm. Vif protein expression levels were increased significantly by using codon optimization and APOBEC3G was degraded when Vif was over-expressed in the same S. pombe cells. These results indicate that fission yeast is a good model for studying the interaction between the Vif and APOBEC3G proteins.     

肠道传播非甲非乙肝炎在恒河猴中的传代研究

用ET-NANBH感染的两只猴(R5和R6)含病毒颗粒的粪便悬液和肝组织悬液分别接种7只和4只恒河猴,分别有5只猴和4只猴在攻毒后20—49天内ALT开始升高,持续时间为7—10天,肝组织学的特征性改变为肝细胞的嗜酸性变和嗜酸小体的形成。在猴ALT升高前2—3天和升高后一周内均检查到大量的27—34nm的病毒样颗粒,这些颗粒只与ET-NANBH病人血清、黑猩猩和猴感染后急性期和恢复期血清发生特异性聚集。在猴感染后血清中未检出抗-HAV、抗-HAV-IgM、HBsAg和抗-HBe-IgM。结果提示:恒河猴是研究ET-NANBH较适宜的动物模型;病人和猴粪便中的27—34nm的病毒样颗粒是ET-NANBH的病原因子。     

河南省部分地区人类免疫缺陷病毒1型耐药性发生和演变的队列研究

目的 了解河南省某地人类免疫缺陷病毒(HIV)耐药性毒株的进化演变规律.方法 将河南省南部某地74例接受齐多夫定(AZT)+去羟肌苷(ddI)+奈韦拉平(NVP)联合抗病毒治疗的艾滋病患者纳入研究队列,分别在抗病毒治疗后3、6、12、18个月进行随访调查,通过逐一访谈了解一般情况、服药方案、服药依从性及保障措施、抗病毒治疗前后的临床表现等,同时采集14 ml EDTA抗凝静脉血,检测CD4/CD8细胞数、病毒载量及基因型耐药性.结果 核苷类反转录酶抑制剂中,发生频率最高的耐药突变位点是:67、118、151和215.治疗3、6、12、18个月时AZT耐药发生率分别为6.76%、13.51%、14.86%和9.46%,ddI的耐药发生率分别为2.70%、6.76%、8.11%和5.45%,AZT的耐药发生率高于ddI,核苷类反转录酶抑制剂的耐药性呈现出先上升后下降的趋势.非核苷类反转录酶抑制剂的耐药发生率高于核苷类反转录酶抑制剂,发生频率最高的耐药突变位点是:103和181.治疗3、6、12、18个月时,NVP耐药发生率分别为9.46%、18.92%、22.97%和32.43%.非核苷类反转录酶抑制剂呈现出持续上升的耐药发生趋势.耐药和不耐药患者的病毒载量和CD4+T淋巴细胞计数无显著性差异.服药依从性差可能是耐药发生的主要影响因素.结论 本组患者中已出现对非核苷类反转录酶抑制剂的高度耐药,服药依从性是耐药发生的主要影响因素.应加强服药的监督管理,改善患者的服药依从性.     

HIV-1包膜基因变异的体外研究

采用亚型测定、核苷酸和氨基酸序列测定和同源性分析等方法,观察了HIV-1 ⅢB毒株在实验室长期传代过程中包膜基因变异的情况.研究的毒株包括:经过实验室8年多连续使用而获得的毒株、在MT4细胞长期连续传代而获得的每间隔10代的毒株样品及多次更换宿主细胞传代而获得的毒株.主要结果有:(1)各种毒株包膜基因变异均不显著,核苷酸序列同源性均大于92%,变异距离均小于7.5%,且随着传代数增加核苷酸趋于稳定,代间同源性由92%上升至99%,而变异距离由7.5%下降为0.6%.(2)在传代过程中HIV-1亚型保持稳定,各种毒株均为HIV-1 B3亚型.结果显示HIV在体外长期传代培养的过程中变异不大,遗传性状稳定,可能是体外生长的环境十分稳定,缺乏机体免疫学压力.结果也提示体外长期传代HIV毒株仍然适用于各种HIV的应用研究,用长期传代的方法发展HIV-减毒活疫苗的可能性不大.     

新生儿肠道双歧杆菌数量与其相关影响因素的探讨

目的　探讨影响新生儿肠道双歧杆菌数量的相关因素。方法　以重庆医科大学附属二院和重庆市妇幼保健院的12 0例新生儿为研究对象,每例生后5～7d,均采集新鲜大便做双歧杆菌定量培养,并做10个相关因素的准确登记。结果　母亲分娩方式、临产期及产后是否使用抗生素、母亲妊娠期饮食习惯以及新生儿黄疸期长短与新生儿肠道双歧杆菌数量有相关性( P均<0 .0 1)。结论　提倡阴道分娩、临产期及产后不用抗生素、妊娠期多食发酵制品和素食,并尽量设法缩短新生儿黄疸时间,均有益于新生儿肠道双歧杆菌数量相对充足     

细胞分离戊型肝炎病毒的初步研究

本文报告用2BS细胞分离戊型肝炎病毒(HEV)感染成功的猴肝脏标本中的HEV的初步结果,将2BS细胞长成致密单层,接种已知含有HEV的肝悬液,盲传至第4代,发现在第27天细胞出现了轻微的细胞病变(CPE),随着进一步的传代,细胞病变时间逐渐提前。至第7代时,在第17天就可见到CPE,CPE的主要特征是细胞间隙变宽,透明度降低和轻度细胞破坏,无大片细胞溶解和脱落现象。免疫电镜检查在第5代和第6代细胞培养液中见到很少的27—34nm的病毒颗粒。将第4代至第7代的细胞悬液20ml接种了3只恒河猴,有2只猴在24天和26天出现了典型的ALT升高,待这3只猴恢复正常后一年,再次接种以上细胞悬液20ml,3只猴全部发生了ALT升高,并在胆汁中检查到27—34nm的病毒颗粒,我们初步推测2BS适应的这株病毒很可能是戊型肝炎病毒。     

正交试验优选环草石斛(D.loddigesii Rolfe.)组培苗壮苗生产工艺

采取正交试验设计对环草石斛(Dendrobium loddigesiiRolfe.)组培苗壮苗进行了优化生产工艺研究,以培养基(A)、添加物马铃薯汁液(B)、激素NAA(C)和pH值(D)为因素,以环草石斛组培苗的株高(cm)、茎粗(cm)、叶片数、叶面积(cm2)、根数、根长(cm)、丛生芽数、单株鲜重(g)等各个性状的增加值为考察指标,优选环草石斛组培苗壮苗的生产工艺。其中自己设计了一种改良培养基(WM),结果显示,改良培养基、添加物马铃薯汁液、激素NAA和pH值均对环草石斛组培苗壮苗产生显著影响,其影响程度为培养基>pH>马铃薯汁液>NAA。由此正交试验筛选出环草石斛组培苗壮苗较优生产工艺为A3B3C3D2,即培养基WM,添加马铃薯汁液200 g/L,NAA2 mg/L,pH值5.6。优选出的壮苗工艺经济,简便,苗壮根多且长,适宜工厂化生产。     

若干苄基异喹啉类化合物的HPLC保留因子与抑制钙调素活性的关系

苄基异喹啉类化合物具有较强的拮抗钙调素(Calmodulin,Cam)的活性,测定这类化合物HPLC参数LogK′作为疏水参数与抑制钙调素的活性进行相关分析,结果表明活性随化合物亲脂性的增大而升高,二者较符合抛物线关系。