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1.
Xiaoyan Guo Yunfang Gao Fangzheng Liu Yong Tao Haibo Jin Jianjun Wang Sheng Wu 《Microbial biotechnology》2023,16(6):1333-1343
R-1,3-butanediol (R-1,3-BDO) is an important chiral intermediate of penem and carbapenem synthesis. Among the different synthesis methods to obtain pure enantiomer R-1,3-BDO, oxidation–reduction cascades catalysed by enzymes are promising strategies for its production. Dehydrogenases have been used for the reduction step, but the enantio-selectivity is not high enough for further organic synthesis efforts. Here, a short-chain carbonyl reductase (LnRCR) was evaluated for the reduction step and developed via protein engineering. After docking result analysis with the substrate 4-hydroxy-2-butanone (4H2B), residues were selected for virtual mutagenesis, their substrate-binding energies were compared, and four sites were selected for saturation mutagenesis. High-throughput screening helped identify a Ser154Lys mutant which increased the catalytic efficiency by 115% compared to the parent enzyme. Computer-aided simulations indicated that after single residue replacement, movements in two flexible areas (VTDPAF and SVGFANK) facilitated the volumetric compression of the 4H2B-binding pocket. The number of hydrogen bonds between the stabilized 4H2B-binding pocket of the mutant enzyme and substrate was higher (from four to six) than the wild-type enzyme, while the substrate-binding energy was decreased (from −17.0 kJ/mol to −29.1 kJ/mol). Consequently, the catalytic efficiency increased by approximately 115% and enantio-selectivity increased from 95% to 99%. Our findings indicate that compact and stable substrate-binding pockets are critical for enzyme catalysis. Lastly, the utilization of a microbe expressing the Ser154Lys mutant enzyme was proven to be a robust process to conduct the oxidation–reduction cascade at larger scales. 相似文献
2.
本工作采用离体孵育技术,观察大鼠下丘脑薄片(含有室旁核和视上核)释放精氨酸加压素(AVP)和糖皮质激素(GC)及其他甾体激素对AVP释放的快速影响。结果如下:(1)大鼠下丘脑薄片经过90min的恢复之后,在长达6h的孵育过程中能够相当稳定地释放AVP,释放量为9.06±1.23pg/min;(2)皮质酮(B)在20min内可明显地抑制AVP的释放,在10-7—10-4mol/L范围内呈剂量-效应关系;(3)在同一剂量(10-6mol/L),皮质醇、17β-雌二醇和睾丸酮也可快速地抑制AVP的释放,而相同剂量的地塞米松、醛固酮、孕酮、RU486和胆固醇却无此效应;(4)RU486(10-7—10-3mol/L)对AVP的释放没有影响,但却能(10-5—10-3mol/L)部分地阻断B的快速抑制效应。这些结果表明,GC对大鼠下丘脑AVP的释放具有不通过传统的基因组机制的快速抑制效应,此种抑制效应可能与GC的负反馈调节作用有关。 相似文献
3.
IL-6受体结构与功能的研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
IL-6是一个多功能的细胞因子,其生物学作用在很大程度上受IL-6受体(IL-6R)结构和功能的影响。IL-6R由两条多肽链组成,即配体结合链gp80和信号传导链gp130。它们在结构和功能上既有分工又有合作。两种亚基组成的高和力IL-6R是介导细胞效应所必需的。IL-6Rα中的造血功能区属于造血因子受体超家族成员,它决定着结合IL-6的能力,然而gp130则是多种细胞因子共用的信号传递分子,其胞 相似文献
4.
白蛋白与甲胎蛋白基因是由同一祖先基因进化而来。在小鼠,它们是一前一后定位在同一条染色体DNA上。在个体发育和肝癌变过程中,这两基因的相互关系也呈现相反的表达水平。因此,研究甲胎蛋白基因表达的调控与白蛋白基因是不可分割的。本文简要报道我们克隆了大鼠白蛋白mRNA 3′端顺序,为研究白蛋白基因结构和表达提供了必要的探针。白蛋白mRNA是从Wistar大鼠肝脏用双抗体免疫沉淀法提取。分子克隆技术基本是按“分子克隆”实验手册进行。 相似文献
5.
耕作方式对潮土土壤团聚体微生物群落结构的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
为探究不同耕作方式对潮土土壤团聚体微生物群落结构和多样性的影响,采用磷脂脂肪酸(PLFA)法测定了土壤团聚体中微生物群落。试验设置4个耕作处理,分别为旋耕+秸秆还田(RT)、深耕+秸秆还田(DP)、深松+秸秆还田(SS)和免耕+秸秆还田(NT)。结果表明:与RT相比,DP处理显著提高了原状土壤和>5 mm粒级土壤团聚体中真菌PLFAs量和真菌/细菌,为真菌的繁殖提供了有利条件,有助于土壤有机质的贮存,提高了土壤生态系统的缓冲能力;提高了5~2 mm粒级土壤团聚体中细菌PLFAs量,降低了土壤革兰氏阳性菌/革兰氏阴性菌,改善了土壤营养状况;提高了<0.25 mm粒级土壤团聚体中微生物丰富度指数。总的来说,深耕+秸秆还田(DP)对土壤团聚体细菌和真菌生物量有一定的提高作用,并且在一定程度上改善了土壤团聚体微生物群落结构,有利于增加土壤固碳能力和保持土壤微生物多样性。冗余分析结果表明,土壤团聚体总PLFAs量、细菌、革兰氏阴性菌和放线菌PLFAs量与土壤有机碳相关性较强,革兰氏阳性菌PLFAs量与总氮相关性较强。各处理较大粒级土壤团聚体微生物群落主要受碳氮比、含水量、pH值和团聚体质量分数的影响,较小粒级土壤团聚体微生物群落则主要受土壤有机碳和总氮的影响。 相似文献
6.
7.
8.
对家蝇溶菌酶(Musca domestica lysozyme,MDLZM2)基因进行克隆、序列分析,构建原核表达载体并在大肠杆菌中表达。从Gen Bank家蝇基因组中筛选获得MDLZM2基因。以该基因的序列设计引物,进行PCR扩增,测序分析获得该基因完整编码序列。运用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、信号肽、二级结构、三级结构和保守结构域等方面进行预测和分析。构建p EASY-E1-MDLZM2重组质粒,转化到大肠杆菌BL21(DE3)p Lys S Chemically Competent Cell中进行诱导表达及纯化。结果表明MDLZM2基因ORF全长552 bp,编码183个氨基酸,理论分子量21.2 k Da;等电点为6.13,具有Lysozyme家族的蛋白保守结构域。成功构建重组原核表达p EASY-E1-MDLZM2并诱导表达、纯化重组蛋白,为进一步研究该蛋白的生物学及免疫学活性奠定了基础。 相似文献
9.
我国首例肌曲霉病及其试验研究 总被引:1,自引:1,他引:0
目的报道国内首例肌曲霉病,对所分离的黄曲霉进行形态、药敏、rDNA序列分析研究。方法对患者病变肌组织行B超和病理检查;将分离菌株接种于察氏培养基观察形态学特征;微量法测定MIC值;酚氯仿法提取DNA,扩增ITS间区序列并进行多序列分析。结果B超示左腓肠肌不规则回声,病理示肌细胞变性、坏死,肌组织内见分枝分隔菌丝。表型及基因型特征为黄曲霉;分离菌株对多种抗真菌药物耐药;多基因序列分析显示所分离菌株与标准株及自然和临床分离株具有100%的相似性。给予特比萘芬治疗3个月后痊愈。结论黄曲霉可致肌肉感染;药敏试验对临床治疗具有指导意义;环境中普遍存在的真菌可引起免疫低下患者致死性感染。 相似文献
10.
Chen Y Traverse JH Hou M Li Y Du R Bache RJ 《American journal of physiology. Heart and circulatory physiology》2003,284(5):H1513-H1520
Inhibition of phosphodiesterase type 5 (PDE5) can relax systemic and coronary vessels by causing accumulation of cGMP. Both the endothelial dysfunction with decreased nitric oxide production and increased natriuretic peptide levels in congestive heart failure (CHF) have the potential to alter cGMP production, thereby influencing the response to PDE5 inhibition. Consequently, this study examined the effects of PDE5 inhibition with sildenafil in dogs with CHF produced by rapid ventricular pacing. CHF resulted in decreases of left ventricular (LV) systolic pressure, coronary blood flow, and the maximal first time derivative of LV pressure (LV dP/dt(max)) at rest and during treadmill exercise compared with normal, whereas resting LV end-diastolic pressure increased from 10 +/- 1.4 to 23 +/- 1.4 mmHg. Sildenafil (2 and 10 mg/kg per os) caused a 5- to 6-mmHg decrease of aortic pressure (P < 0.05), with no change of heart rate, LV systolic pressure, or LV dP/dt(max). Sildenafil caused no change in coronary flow or myocardial oxygen consumption in animals with CHF at rest or during exercise. In contrast to findings in normal animals, sildenafil did not augment endothelium-dependent coronary vasodilation in response to acetylcholine in animals with CHF. Furthermore, Western blotting showed decreased PDE5 protein expression in myocardium from failing hearts. These findings demonstrate that PDE5 contributes little to regulation of coronary hemodynamics in CHF. 相似文献