利福霉素生产菌产生钝化RifSV物质的分离及性质研究

利福霉素ＳＶ（简称ＲｉｆＳＶ）生产菌──地中海拟无枝菌酸菌在生物合成ＲｉｆＳＶ过程中,产生一种能钝化自身产物（ＲｉｆＳＶ）的物质．实验证实,该物质是由谷氨酸、天冬氨酸、赖氨酸及缬氨酸等１４种常见氨基酸组成的蛋白质．分子量（ＭＷ）约２．５×１０４Ｄ,等电点（ＰＩ）为５．７—６．１．在１００℃下加热１０ｍｉｎ,其活性丧失．作用于ＲｉｆＳＶ的最适ｐＨ值范围为７．４—８．６,最适温度为２９℃,初步证实该物质是一种酶（暂称利福霉素钝化酶）     

紫花苜蓿的花蜜量和访花蜜蜂数量对种子产量的影响

对10个紫花苜蓿品种的花萼直径、花蜜量、访花蜜蜂数量和种子产量进行了研究,结果表明,紫花苜蓿的单位面积花蜜量与访花蜜蜂数量呈极显著正相关(r=0.93**),访花蜜蜂数量与种子产量呈显著正相关(r=0.87*);紫花苜蓿的花蜜量与花萼直径呈极显著正相关(r=0.99**);紫花苜蓿品种赛特(Sitel)和德宝(Derby)在兰州地区能获得高产、优质的种子。     

土壤中质粒pLV1016在快生型大豆根瘤菌间的水平转移

在滤膜、液体培养基和土壤微宇宙 3种系统中 ,研究了接合型质粒 pLV1 0 1 6由快生型大豆根瘤菌 (Rhizobiumfredii)QB1 1 31向R .frediilux3的水平转移及pLV1 0 1 6由QB1 1 31向土著细菌的转移 .接合培养 1d后 ,分别计算供、受体菌的生长速率和质粒转移速率常数 (γ) .结果表明 ,相同接种浓度下 ,滤膜接合时γ值最高 ,土壤中γ值最低 ,γ值不受土壤是否灭菌和是否有大豆植株的影响 ,γ值与初始接种浓度负相关 ,与供、受体的生长速率正相关 .在未灭菌土中检测到 pLV1 0 1 6可转移到土著细菌 ,土著接合子分别属于根瘤菌属和假单胞菌属 .     

Dual function of a tip fimbrillin of Actinomyces in fimbrial assembly and receptor binding

Interaction of Actinomyces oris with salivary proline-rich proteins (PRPs), which serve as fimbrial receptors, involves type 1 fimbriae. Encoded by the gene locus fimQ-fimP-srtC1, the type 1 fimbria is comprised of the fimbrial shaft FimP and the tip fimbrillin FimQ. Fimbrial polymerization requires the fimbria-specific sortase SrtC1, which catalyzes covalent linkage of fimbrial subunits. Using genetics, biochemical methods, and electron microscopy, we provide evidence that the tip fimbrillin, FimQ, is involved in fimbrial assembly and interaction with PRPs. Specifically, while deletion of fimP completely abolished the type 1 fimbrial structures, surface display of monomeric FimQ was not affected by this mutation. Surprisingly, deletion of fimQ significantly reduced surface assembly of the type 1 fimbriae. This defect was rescued by recombinant FimQ ectopically expressed from a plasmid. In agreement with the role of type 1 fimbriae in binding to PRPs, aggregation of A. oris with PRP-coated beads was abrogated in cells lacking srtC1 or fimP. This aggregation defect of the ΔfimP mutant was mainly due to significant reduction of FimQ on the bacterial surface, as the aggregation was not observed in a strain lacking fimQ. Increasing expression of FimQ in the ΔfimP mutant enhanced aggregation, while overexpression of FimP in the ΔfimQ mutant did not. Furthermore, recombinant FimQ, not FimP, bound surface-associated PRPs in a dose-dependent manner. Thus, not only does FimQ function as the major adhesin of the type 1 fimbriae, it also plays an important role in fimbrial assembly.     

Molecular Cloning of Novel Cellulase Genes <Emphasis Type="Italic">cel</Emphasis>9A and <Emphasis Type="Italic">cel</Emphasis>12A from <Emphasis Type="Italic">Bacillus licheniformis</Emphasis> GXN151 and Synergism of Their Encoded Polypeptides

A thermophilic bacterial strain GXN151 which could degrade Avicel efficiently was isolated and identified as Bacillus licheniformis. A genomic library of GXN151 was constructed and two novel endoglucanase genes designated cel9A and cel12A were isolated by screening the library on carboxylmethyl cellulase indicator plates. The analysis of amino acid sequences deduced from the genes indicated that Cel9A consisted of a catalytic domain belonging to glycosyl hydrolase family 9, a linker domain, and a carbohydrate binding module family 3 from N-terminal to C-terminal; Cel12A had only one catalytic domain belonging to glycosyl hydrolase family 12. The combinations of Cel9A and Cel12A produced by the recombinant E. coli exhibited synergistic action against substrates of carboxylmethyl cellulose as well as Avicel.     

实时荧光定量PCR及其在微生物生态学中的应用

定量描述微生物群落的组成,在微生物生态学的许多研究领域都是非常重要的。然而由于可培养技术的局限性,定量描述微生物群落成为比较困难的事情。最近包括PCR技术在内的分子生物学技术为人们提供了有力的工具,使对微生物群落的分布、丰度等有了进一步的了解。实时荧光定量PCR技术作为核酸定量检测技术,自从发明以来在微生物生态学研究中逐渐得到了广泛的应用。从微生物生态学角度,综述了实时荧光定量PCR技术的原理、发展、优缺点及其在微生物生态学研究中的应用与研究进展,并探讨了实时荧光定量PCR技术的发展和应用前景。     

大肠杆菌共表达LeGGPS2、LePSY1和crtI基因合成番茄红素

利用大肠杆菌研究番茄红素的合成,不仅可以获得副产物少的高产菌株,而且可以探讨基因或基因簇的功能。文中将番茄LeGGPS2和LePSY1的cDNA序列,及欧文氏菌crtI的编码序列分别添加上核糖体结合位点后,以单独或组合的方式受控于T7启动子和终止子,在大肠杆菌菌株BL21(DE3)中进行表达和诱导番茄红素合成。结果显示,仅T7::crtI-LeGGPS2-LePSY1三价基因共表达时才能合成番茄红素,且将种子液以1∶50接种于含3%蔗糖的LB培养基(pH 6.8)中,于37℃摇8 h左右的对数生长后期加IPTG至80μmol/L,30℃诱导表达5 h的发酵条件下,获得2.124 mg/g DCW的番茄红素。该结果既验证了原核化的番茄LeGGPS2和LePSY1基因及与crtI基因协同作用的功能,又为在番茄质体中建立独立的番茄红素合成途径奠定了基础。     

三门湾浮游动物的季节变动及微型浮游动物摄食影响

2002年8月、11月、2003年2月和5月,在三门湾进行了4个航次生物、化学和水文等专业综合调查。根据采集的浮游动物样品的分析鉴定及海上现场实验结果,对浮游动物的群落组成、生物量、丰度、多样性指数的分布和季节变动及其浮游动物对浮游植物的摄食影响进行研究。结果表明,三门湾浮游动物有67属,89种,16类浮游幼体,主要可划分为4个生态类群：以近岸低盐类群为主,其优势种为中华哲水蚤Calanus sinicus、真刺唇角水蚤Labidocera etwhaeta、捷氏歪水蚤Tortanus derjugini、太平洋纺锤水蚤Acartiapacifica、中华假磷虾Pseudeuphausia sinica和百陶箭虫Sagitta bedoti等。半咸水河口类群、暖水性外海类群和广布种相对较少。浮游动物生物量和丰度的平面分布趋势除了夏季有所差异外,其它季节基本一致。2月份和5月份,浮游动物生物量和丰度,从湾顶向湾口呈逐渐增加趋势;8月份,湾口区生物量最高,而丰度高值区出现在湾顶部;11月份,生物量和丰度的平面分布相对均匀。浮游动物种类多样性指数有明显的季节变化,其动态变化与浮游动物种数和丰度的变化一致。微型浮游动物对浮游植物存在摄食压力,且有季节变化,摄食率的变化在0．18．0．68d^-1,微型浮游动物的摄食率低于相同季节的浮游植物生长率。微型浮游动物对浮游植物摄食压力的变化范围为16．1％-49．1％d^-1,对初级生产力摄食压力的变化在58．3％-83．6％d^-1。11月份,微型浮游动物对浮游植物和初级生产力的摄食压力均出现最高值。     

作用于cip-cel mRNA的核糖核酸内切酶的鉴定

【目的】本研究以革兰氏阳性细菌解纤维素梭菌(Ruminiclostridium cellulolyticum)为研究对象,筛选作用于纤维小体编码基因簇cip-cel mRNA的核糖核酸内切酶。【方法】通过对预测的4个假定编码核糖核酸内切酶基因进行基因敲除、体内过表达、体外过表达和活性分析等方法,分析它们对cip-cel mRNA剪切位点的剪切能力。【结果】敲除rnc和rnj基因,对cip-cel mRNA剪切没有任何影响;体内过表达RNase时能够加速cip-cel mRNA的降解,而过表达RNase G时,则结果与野生型对照菌株无异;RNase G基因rng和RNase Y基因rny的体外活性鉴定分析,发现RNase G对体外转录的包含cip-cel mRNA剪切位点的RNA没有作用,而RNase Y能够对其进行剪切和降解。【结论】RNase Y是能够作用于cip-cel mRNA的核酸内切酶。该研究结果对理解革兰氏阳性细菌核糖核酸内切酶的作用机制,及其在转录后水平的调控基因差异表达等方面具有重大意义。