利用rbcL-a序列模拟检测小鼠食性

动物食性是研究动物生活习性中非常重要的一环,利用DNA条形码进行检测变得非常快捷和方便。利用这项技术,模拟生态环境研究动物食性,来检测小白鼠的食物组成。首先,给小白鼠喂食了6种植物(白菜、玉米、胡萝卜、小麦、生菜、花椰菜)并收集其粪便,然后对这些样本进行DNA提取、PCR扩增与克隆,最后测序并获得来自质体的rbcL基因(ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase large subunit gene)的部分序列(rbcL-a)。粪便样本中得到的序列分别与GenBank数据库和实验中得到的作为食物的5种植物的rbcL-a序列(玉米中未发现)进行比对,确定其分类单元。利用GenBank数据库,共鉴定出了3科和1属。与实验中的5种植物rbcL-a序列比对能鉴定出3个植物物种。表明实验用的rbcL-a序列在检测粪便中物种方面具有很大的潜力,对野生动物的食性分析及分子生态学的研究具有重要的意义。