哈尔滨城市和乡村青年居民肠道菌群多样性研究

【目的】分析居住于哈尔滨城市和乡村的青年居民肠道菌群多样性的异同。【方法】采用PCR和DGGE技术相结合的方法对生活于哈尔滨城市和乡村的青年志愿者肠道菌群多样性进行研究。基于DGGE指纹图谱,分别使用聚类和PCA分析对志愿者肠道微生物相似性进行分析,使用Shannon-Weine多样性指数(H′)、丰度(S)和均匀度(EH)对志愿者肠道微生物多样性进行分析,对图谱中具有代表性的共性和特异性条带进行胶回收和克隆测序以分析志愿者肠道微生物组成。基于PCR技术在种水平上对城乡志愿者肠道内乳杆菌属和双歧杆菌属多样性进行定性分析。【结果】相似性分析显示,城乡青年居民间肠道微生物群落结构存在分开趋势,相似性小于城市或乡村青年居民内部;多样性分析显示,城乡青年居民肠道微生物多样性差异不显著;测序结果表明,城乡居民肠道微生物组成在门水平上相同,但是在种属水平上存在差异。PCR定性分析显示Lactobacillus plantarum、L.casei和L.salivarius在哈尔滨城乡青年居民肠道内检出率接近100%,Bifidobacterium longum和B.breve的检测率约90%,在哈尔滨城乡青年居民肠道内普遍存在;乳杆菌属和双歧杆菌属各细菌种在城乡居民肠道中的检出频率差异不显著。【结论】哈尔滨城市和乡村青年居民肠道微生物多样性差异不显著。     

米酒曲细菌多样性研究

目的分析米酒曲中微生物群落组成。方法采集7个地区的米酒曲样品,通过PCR-DGGE与传统可培养方法对米酒曲中的细菌多样性进行解析。结果基于PCR-DGGE法,米酒曲中细菌由Enterococcus、Streptococcus、Lactobacillus、Pediococcus和Weissella等乳酸菌类群组成。基于传统纯培养方法,在厌氧条件下共分离到细菌24株,使用MRS培养基分离得到14株乳酸菌,其中Enterococcus类群乳酸菌最多,其次是Weissella,而Pediococcus最少;在厌氧条件下,通过LB培养基得到10株菌,经鉴定属于Cronobacter、Enterobacter、Klebsiella类群。结论米酒曲中存在着丰富的乳酸菌类群,同时也有有害微生物的存在。     

基于MiSeq高通量测序技术对 3个孝感凤窝酒曲细菌多样性的评价

目的对凤窝酒曲细菌多样性进行研究。方法选取孝感地区3个凤窝酒曲作为研究对象,采用MiSeq高通量测序技术以16S rRNA为靶点,对其细菌菌群构成进行研究。结果 3个凤窝酒曲中发现9个优势核心属,其相对含量累计为78.15%,发现10个相对含量大于1.0%的分类操作单元,累计相对含量为60.62%。结论 3个凤窝酒曲共有大量的核心细菌菌群。     

丢糟窖窖泥细菌多样性评价

目的对丢糟窖窖泥细菌多样性进行评价。方法选取3个丢糟窖窖池为研究对象,每个窖池分别从上、中和下部取样,采用MiSeq高通量测序技术以16SrRNA为靶点,从分类操作单元(operational taxonomic units,OTU)分布、菌群分类学地位、核心OTU、菌群α和β多样性等维度对其细菌多样性进行研究。结果在门水平上,Firmicutes和Actinobacteria的平均含量分别为93.89%和4.73%。在属水平上,Lactobacillus、Clostridium、Bacillus、Paenibacillus和Thermoactinomyces的平均相对含量分别为59.67%、8.28%、5.73%、4.97%和1.29%。发现7个平均相对含量大于1.0%的核心OTU,累计相对含量为63.30%。结论丢糟窖窖泥中的细菌主要由隶属于Firmicutes的5个属构成,不同样品间共有大量的核心菌群。     

六名襄阳地区青年志愿者肠道菌群多样性的研究

目的对襄阳地区青年人肠道菌群多样性进行研究。方法选取湖北襄阳地区6名健康青年人的粪便样品作为研究对象,采用MiSeq高通量测序技术以16SrRNA为靶点,对其肠道菌群构成进行研究。结果 6名青年人肠道中发现了13个优势核心属,其相对含量累计为70.72%,发现10个相对含量大于1.0%的分类操作单元,累计相对含量为28.43%。结论 6名襄阳青年志愿者肠道微生物共有大量的核心菌群。