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GDF-8、IGF-I,IGF-III、IGF2R、,IGFBP2和GHR是鸡的重要经济性状候选基因.利用miRanda和Targetscan软件预测6个基因3'UTR潜在的microRNA靶标,并发掘靶标区域SNP位点.结果表明:在6个基因的26个microRNA靶标区域,共检测到125个SNP位点,在靶标及其5'和3'邻接等长侧翼区分别检测到47个,44个和35个SNPs位点,其中12个SNP定位于靶标种子序列互补区.种子序列互补区及其3'侧翼区的SNP位点可能会影响microRNA的调控,导致家禽的表型变异. 相似文献
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AFLP标记在玉米种质资源鉴定中的应用 总被引:9,自引:0,他引:9
利用AFLP分子标记技术对55份玉米(Z ea m ay s L.)种质材料进行了研究.结果表明,20对AFLP引物检测到清晰可见的带656条,其中多态性带487条.平均每个引物组合可以检测到24.4条多态性带.将55份玉米材料聚为6组,与材料来源基本一致.结果显示AFLP有利于玉米遗传多样性分析.对来源美国先锋的P ioneer系列与瑞得种群和BSSS种群的关系进行了初步探讨,认为P ioneer系列中有很多材料与瑞得种群有亲缘关系. 相似文献
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鸡6个功能基因microRNA靶标区域SNP的生物信息学预测 总被引:1,自引:0,他引:1
GDF-8、IGF-I、IGF-III、IGF2R、IGFBP2和GHR是鸡的重要经济性状候选基因。利用miRanda和Targetscan软件预测6个基因3′UTR潜在的microRNA靶标, 并发掘靶标区域SNP位点。结果表明: 在6个基因的26个microRNA靶标区域, 共检测到125个SNP位点, 在靶标及其5′和3′邻接等长侧翼区分别检测到47个、44个和35个SNPs位点, 其中12个SNP定位于靶标种子序列互补区。种子序列互补区及其3′侧翼区的SNP位点可能会影响microRNA的调控, 导致家禽的表型变异 相似文献
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鸡基因组pre-microRNA SNP多态性 总被引:2,自引:0,他引:2
为探讨鸡pre-microRNA SNP的多态性及其可能的功能意义, 对鸡471个pre-microRNA区域的SNP位点进行了鉴定和生物信息学分析。结果表明: pre-microRNA的SNP多态性显著地低于其侧翼区(P<0.01=, 其种子区SNP变异对pre-microRNA二级结构稳定性的影响高于其他各区; microRNA成熟体SNP可能影响microRNA对靶基因的选择。研究结果提示: pre-microRNA相对于其侧翼区在分子进化过程中受到更大的选择压力; 成熟体SNP可通过影响microRNA加工和靶基因的选择, 改变多种生理过程, 导致鸡种间表型变异。研究结果将为鸡microRNA的进化模式研究及其功能性SNP的鉴定提供参考信息。 相似文献
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