东南大学遗传学学科发展回顾与展望 ——纪念江苏省遗传学会成立40周年

遗传学是一个古老而发展迅速的基础学科,基于细胞或生物个体的基因结构、功能及其表达模式的研究,解析生物遗传性状的传递和变异规律.遗传学理论与技术已经渗透到生物学及其相关的学科领域,成为理解生命本质最重要的基础学科.我国遗传学研究从初始到如今的蓬勃发展已有百年历史.江苏省遗传学学会也历经了几十年的峥嵘岁月.在纪念江苏省遗传...     

转录因子AP-4基因真核表达载体构建及表达分析

本研究利用生物信息学分析AP-4与胃癌患者临床病理信息的相关性,根据GenBank中人AP-4基因cDNA序列设计并合成特异性引物,以胃癌细胞总RNA逆转录的cDNA为模板,利用高保真酶扩增AP-4基因CDS (Coding DNA sequence)序列并构建入pcDNA3.1+载体,并通过限制性内切酶酶切分析和测序法进行进一步验证;脂质体法将AP-4重组表达载体及对照pcDNA3.1+载体转染胃癌细胞,qRT-PCR(Quantitative real time polymerase chain reaction)和Western blotting检测分别检测AP-4在m RNA和蛋白水平的表达。生物信息学分析发现,AP-4的表达与胃癌分期及预后显著相关;酶切及测序分析表明,转录因子AP-4真核表达载体构建成功,并能够在胃癌细胞中实现转录和蛋白水平的高效表达。此研究为深入研究转录因子AP-4在胃癌等肿瘤发生发展中的作用及分子机制奠定了基础。     

RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因

为揭示DNA甲基转移酶3B（DNMT3B）在肝癌中是否参与了肿瘤的发生,应用Western blotting及细胞免疫化学方法分析DNMT3B蛋白在人的正常肝细胞株、肝癌癌旁细胞株及肝癌癌细胞株中的表达。构建了DNMT3B的RNAi稳定表达的重组载体,并转染人肝癌细胞株SMMC-7721中。以半定量RT-PCR及Western blotting分别鉴定DNM73B RNAi表达载体对内源性DNMT3B的抑制效率。用高通量的cDNA基因芯片分析了SMMC-7721中DNMT3B抑制后有影响的下游基因谱。结果显示,DNMT3B在肝癌细胞株中的表达水平明显高于肝癌癌旁和正常肝细胞株。DNMT3B的RNAi稳定表达重组载体转染SMMC-7721细胞株2个月后,观察到DNMT3B明显受到抑制。cDNA基因芯片分析发现,DNMT3B抑制后诱导26条基因表达下调,115条基因表达上调,包括一些发育相关基因以及肿瘤相关基因,如SNCG、NOTCH1、MBD3、WNT11、MAOA、FACL4等。提示DNMT3B的高表达可能与肝癌的发生有关,并以调控其他相关基因的表达而起作用,包括与发育相关的重要基因。     

一个在肺腺癌细胞系中差异表达cDNA片段的定位及表达分析

为了研究和克隆肺癌转移相关候选基因,探讨肺癌发生及转移的分子基础,应用细胞培养,cDNA克隆,Noorthern印记杂交和生物信息学技术分析了在细胞来源相同,但转移能力不同的肺腺癌细胞系AGZY83－a和Anip973中差异表达片段OPB7－1在人不同组织中和不同人肺癌细胞系中的表达情况,并应用RH定位技术对该片段进行了基因定位。表明OPB7－1与已知基因同源性差,该基因在正常人多种组织中有表达,心肌和骨骼肌中高表达,转录本均为3.0kb左右。在不同人肺癌细胞系中存在该基因的表达差异,高转移潜能,低分化及高浸润的细胞系中呈高表达趋势,且表达的片段大小略有差别。提示OPB7－1是一个具有广泛表达为的基因,可能是与肺癌的发生发展相关的新基因。     

Linc00651对胃癌细胞增殖与迁移侵袭能力影响的研究

胃癌是世上最常见的恶性肿瘤之一。人们对于胃癌的病因,尤其是对胃癌转移的分子机制并尚未完全阐明。表观遗传调控在肿瘤中的作用和机制已经引起研究者的高度关注。为了研究LincRNA是否在胃癌的侵袭迁移中发挥作用,本研究选择具有增强子样活性的长链非编码RNA Linc00651作为研究对象,通过CCK、流式细胞技术、Wound healing assay、Transwell迁移侵袭实验等,分析了Linc00651对胃癌细胞增殖及其迁移侵袭能力的影响。结果显示,Linc00651的转染,促进了胃癌细胞的侵袭和迁移能力,对胃癌细胞的增殖和细胞周期未见明显改变。本研究揭示了Linc00651参与了胃癌细胞侵袭迁移行为,为LncRNA应用于胃癌侵袭转移的临床评估提供了新的思路和视角。