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1.
设计用于SYBR Green I法实时定量逆转录多聚酶链反应(QRT-PCR)检测大鼠尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)mRNA的引物。从基因库获取靶基因及相关序列,充分收集争分析相关生物信息学数据,应用Oligo 6.22设计出一对长度为21bp的引物,其GG含量为52.4%;上下游引物3’最稳定二聚体和及发夹结构的能量分别为-1.5、-0.40 kcal/mol和-3.5、-O.90 kcal/mol,引物间最稳定二聚体为-3.1 kcal/mol。5’端和中间△G值较高,高于3’端△G;引发效率分别455和403。实验证明,该引物能够高效、特异地实现对靶序列的检测,适用于SYBR Green I法实时定量检测(uPA)mRNA。  相似文献   
2.
设计用于SYBR Green Ⅰ法实时定量逆转录多聚酶链反应(QRT—PCR)检测大鼠尿激酶型纤溶酶原激活因子(uPA)mRNA的引物。从基因库获取靶基因及相关序列,充分收集和分析相关生物信息学数据,应用Oligo 6.22设计出一对长度为21bp的引物,其GC含量为52.4%;上下游引物3’最稳定二聚体和及发夹结构的能量分别为-1.5、-0.40kcal/mol和-3.5、-0.90kcal/mol,引物间最稳定二聚体为-3.1kcal/mol。5’端和中间AG值较高,高于3’端AG;引发效率分别455和403。实验证明,该引物能够高效、特异地实现对靶序列的检测,适用于SYBR GreenⅠ法实时定量检测(uPA)mRNA。  相似文献   
3.
该研究在验证小鼠睾丸支持细胞TM4有内源性uPA基因表达的基础上,针对uPAmRNA靶序列设计三段不同的siRNA序列(si-uPA),通过瞬时转染TM4细胞,筛选确定uPA基因的有效干扰序列。将该有效干扰序列进行时效、量效实验,观察siRNA对TM4fi细胞uPAmRNA和蛋白表达的影响。结果显示,siRNA的最佳转染浓度为50nmol/L。三种si—uPA转染TM4细胞后,μPAmRNA和蛋白表达量均较空白对照组明显下降(P〈0.05),以si—μPAl作用最为明显。si—μPAl转染24h后,转染组细胞μPAmRNA的表达均较对照组显著降低,其中100nmol/L组抑制效果最为明显,抑制率达到70%;随转染时间的延长,μPAmRNA表达持续降低,转染72h后,三组转染细胞μPAmRNA表达量分别为对照组的153.9%、35.3%和27.7%(P〈0.05)。该研究成功筛选出针对μPAmRNA靶序列的有效干扰序列,抑制效应持续至72h;同一时间点内,抑制效应随转染浓度的增加而增强,表现出良好的量效关系。  相似文献   
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