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从蛋白质可及性分析的角度研究了ERABP与RA的相互作用模式,在原子水平和残基水平上计算了四个与维甲酸结合蛋白(ERABP)有关的分子的可及性,这四个分子是EPA(无配体结晶生成的ERABP),EPB—RA(ERAB和配体雏甲酸RA,并对其进行分析比较。分析结果表明,RA在结合蛋白中采取β-芷香酮环向里,羧基端向外的构象形式;围绕结合部位有24个残基;在结合配体RA时,在结合配体RA时,结合蛋白将发生构象变化,变化的结果是结合部位空穴的暴露程度增大。  相似文献   
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