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1.
Jianxi Xiao Rayna M. Addabbo Janelle L. Lauer Gregg B. Fields Jean Baum 《The Journal of biological chemistry》2010,285(44):34181-34190
The mechanism by which enzymes recognize the “uniform” collagen triple helix is not well understood. Matrix metalloproteinases (MMPs) cleave collagen after the Gly residue of the triplet sequence Gly∼[Ile/Leu]-[Ala/Leu] at a single, unique, position along the peptide chain. Sequence analysis of types I-III collagen has revealed a 5-triplet sequence pattern in which the natural cleavage triplets are always flanked by a specific distribution of imino acids. NMR and MMP kinetic studies of a series of homotrimer peptides that model type III collagen have been performed to correlate conformation and dynamics at, and near, the cleavage site to collagenolytic activity. A peptide that models the natural cleavage site is significantly more active than a peptide that models a potential but non-cleavable site just 2-triplets away and NMR studies show clearly that the Ile in the leading chain of the cleavage peptide is more exposed to solvent and less locally stable than the Ile in the middle and lagging chains. We propose that the unique local instability of Ile at the cleavage site in part arises from the placement of the conserved Pro at the P3 subsite. NMR studies of peptides with Pro substitutions indicate that the local dynamics of the three chains are directly modulated by their proximity to Pro. Correlation of peptide activity to NMR data shows that a single locally unstable chain at the cleavage site, rather than two or three labile chains, is more favorable for cleavage by MMP-1 and may be the determining factor for collagen recognition. 相似文献
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Abstract We have analyzed the sequence downstream of rpoN from Zcinetobacter calcoaceticus and identified an open reading frame encoding a protein with high similarity to UDP- N -acetylgucosamine 1-carboxyvinyl-transferase (MurZ). Multicopy plasmids encoding this enzyme conferred phosphomycin resistance to A. calcoaceticus . The polar effect of a rpoN mutation on the phosphomycin resistance level suggests that murZ is, in part, cotranscribed with rpoN . These observations confirm that A. calcoaceticus represents the first exceptin from a conserved genetic context of rpoN observed in several other Gram-negative bacteria. 相似文献
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The overproduction of specialized metabolites requires plants to manage the inherent burdens, including the risk of self-intoxication. We present a control mechanism that stops the expression of phytoalexin biosynthetic enzymes by blocking the antecedent signal transduction cascade. Cultured cells of Eschscholzia californica (Papaveraceae) and Catharanthus roseus (Apocynaceae) overproduce benzophenanthridine alkaloids and monoterpenoid indole alkaloids, respectively, in response to microbial elicitors. In both plants, an elicitor-responsive phospholipase A2 (PLA2) at the plasma membrane generates signal molecules that initiate the induction of biosynthetic enzymes. The final alkaloids produced in the respective plant inhibit the respective PLA, a negative feedback that prevents continuous overexpression. The selective inhibition by alkaloids from the class produced in the “self” plant could be transferred to leaves of Nicotiana benthamiana via recombinant expression of PLA2. The 3D homology model of each PLA2 displays a binding pocket that specifically accommodates alkaloids of the class produced by the same plant, but not of the other class; for example, C. roseus PLA2 only accommodates C. roseus alkaloids. The interaction energies of docked alkaloids correlate with their selective inhibition of PLA2 activity. The existence in two evolutionary distant plants of phospholipases A2 that discriminate “self-made” from “foreign” alkaloids reveals molecular fingerprints left in signal enzymes during the evolution of species-specific, cytotoxic phytoalexins. 相似文献
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Wolfgang von Westernhagen und José Pons Oliveras 《Journal of Ornithology》1966,107(2):154-166
Zusammenfassung Im Ebrodelta ist, abgesehen von einigen Seen und Sümpfen, nur noch ein schmaler Küstenstreifen landwirtschaftlich ungenutzt. Hier hat sich ein Teil ursprünglichen Vogelreichtums erhalten, und hier wurde seit einigen Jahren eine Reihe faunistischer Erhebungen durchgeführt.Diese erbrachten mehrere erste Brutnachweise für Spanien oder die spanische Mittelmeerküste:Larus ridibundus, Sterna dougallii, St. sandvicensis, Haematopus ostralegus, Limosa limosa, Asio flammeus, Acrocephalus palustris.
Als Rast- und Überwinterungsgebiet ist das Delta von großer Bedeutung, z. B. fürEgretta garzetta undPhoenicopterus ruber. Enge Beziehungen zur Camargue sind vielfach erkennbar, vielleicht sogar hinsichtlich der Ausbreitung vonLarus ridibundus undHaematopus ostralegus.
Regelmäßige Wintervorkommen vonMarmaronetta angustirostris sind erwähnenswert.Es wird mit einigen bisher unbekannten Brutplätzen von Laro-Limicolen bekanntgemacht, von denen eine Kolonie vonSterna albifrons mit 300–400 Paaren besonders vermerkt sei. Für weitere Arten können Bestandsangaben gemacht werden.Dieses einzige, bedeutende Brut- und Rastgebiet zwischen Camargue und Coto Doñana ist in höchster Gefahr, durch intensivere landwirtschaftliche Nutzung und touristische Erschließung vernichtet zu werden.
Resumen Datos ornitologicos sobre el Delta del Ebro. — Sin contar con charcas y marismas, el Delta del Ebro es una franja costera aun no explotada por la agricultura. Gracias a esto una numerosa variedad de aves ha podido mantenerse aprovechando las todavia persistentes condiciones orginarias del medio ambiente. Sobre estas aves se han venido acumulando en los ultimos años un buen acopio de observaciones.Se pudo constatar como nidificantes por primera vez en España o costas mediterranes a las siguientes especies:Larus ridibundus, Sterna dougalli, St. sandvicensis, Haematopus ostralegus, Limosa limosa, Asio flammeus, Acrocephalus palustris. Como lugar de invernada o refugio durante el paso el Delta del Ebro tiene un especial interes, por ejemplo paraEgretta garzetta yPhoenicopterus ruber. Se establecen algunas relaciones con la Camarga principalmente en cuanto a la expansión deLarus ridibundus yHaematopus ostralegus. Se mencionan invernadas regulares deMarmaronetta angustirostris. Se señalan algunos nuevos lugares de cria para Laro-Limicolas, merece destacarse el hallazgo de una colonia deSterna albifrons compuesta por unos 300–400 pares. Para otras especies se dan datos numerieos estimativos.El Delta del Ebro es un lugar unico y de gran importancia, situado entre la Camarga y el Coto de Doñana, que está hoy en peligro de desaparición debido a la colonización intensiva de la agricultura y a la creciente afluencia turistica.相似文献