RGMb/DRAGON与BMP信号转导

RGMb/DRAGON为RGM家族成员之一,在许多组织和器官中存在并表达.最初它作为粘附分子在神经系统中调节轴突排斥被发现.近来研究发现,它还是BMP的辅助受体,与BMP配体和受体结合,通过调控BMP信号通路在繁殖、肾脏机能的维持以及免疫疾病等生理和病理条件下发挥重要作用.本文评述了RGMb的基因及蛋白结构特征、表达定位及其在神经系统中的作用,并重点介绍了其在BMP信号通路中的作用机制和生物学研究进展.     

微生物降解石油烃的功能基因研究进展

微生物对石油烃的降解在自然衰减去除土壤和地下水石油烃污染的过程中发挥了重要作用。微生物通过其产生的一系列酶来利用和降解这类有机污染物,其中,编码关键降解酶的基因称为功能基因。功能基因可作为生物标志物用于分析环境中石油烃降解基因的多样性。因此,研究石油降解功能基因是分析土著微生物群落多样性、评价自然衰减潜力与构建基因工程菌的重要基础。本文主要介绍了烷烃和芳香烃在有氧和无氧条件下的微生物降解途径,重点总结了烷烃和芳香烃降解的主要功能基因及其作用,包括参与羟化作用的单加氧酶和双加氧酶基因、延胡索酸加成反应的琥珀酸合酶基因以及中心中间产物的降解酶基因等。     

Bivariate genome-wide association analyses of femoral neck bone geometry and appendicular lean mass

Objective

Femoral neck geometric parameters (FNGPs), such as periosteal diameter (W), cross-sectional area (CSA), cortical thickness (CT), buckling ratio (BR), and section modulus (Z), are highly genetically correlated with body lean mass. However, the specific SNPs/genes shared by these phenotypes are largely unknown.

Methods

To identify the specific SNPs/genes shared between FNGPs and appendicular lean mass (ALM), we performed an initial bivariate genome-wide association study (GWAS) by scanning ∼690,000 SNPs in 1,627 unrelated Han Chinese adults (802 males and 825 females) and a follow-up replicate study in 2,286 unrelated US Caucasians.

Results

We identified 13 interesting SNPs that may be important for both FNGPs and ALM. Two SNPs, rs681900 located in the HK2 (hexokinase 2) gene and rs11859916 in the UMOD (uromodulin) gene, were bivariately associated with FNGPs and ALM (p = 7.58×10⁻⁶ for ALM-BR and p = 2.93×10⁻⁶ for ALM-W, respectively). The associations were then replicated in Caucasians, with corresponding p values of 0.024 for rs681900 and 0.047 for rs11859916. Meta-analyses yielded combined p values of 3.05×10⁻⁶ and 2.31×10⁻⁶ for rs681900 and rs11859916, respectively. Our findings are consistent with previous biological studies that implicated HK2 and UMOD in both FNGPs and ALM. Our study also identified a group of 11 contiguous SNPs, which spanned a region of ∼130 kb, were bivariately associated with FNGPs and ALM, with p values ranging from 3.06×10⁻⁷ to 4.60×10⁻⁶ for ALM-BR. The region contained two neighboring miRNA coding genes, MIR873 (MicroRNA873) and MIR876 (MicroRNA876).

Conclusion

Our study implicated HK2, UMOD, MIR873 and MIR876, as pleiotropic genes underlying variation of both FNGPs and ALM, thus suggesting their important functional roles in co-regulating both FNGPs and ALM.     

短期放牧对草甸草原土壤微生物与土壤酶活性的影响

【目的】为呼伦贝尔草甸草原生态系统的保护、恢复及重建提供微生物学基础数据。了解草原土壤微生物和酶活性对放牧强度的响应。【方法】分别采集六个不同放牧强度的土壤样品,测定土壤微生物数量、土壤微生物量和土壤酶活性,分析短时期不同放牧强度土壤微生物数量、土壤微生物量和土壤酶活性的变化特征及其相互关系。【结果】不同放牧强度下,菌群数量分布为细菌>放线菌>真菌;土壤微生物数量、微生物量均表现为放牧区高于对照区;在土壤表层(0 10 cm),土壤过氧化氢酶、转化酶和蛋白酶活性表现出随放牧强度的增加先上升后略降的趋势,且放牧区均高于对照区,与土壤表层比较,在较深层(10 cm 20 cm),土壤细菌、真菌的数量和微生物量碳、氮下降幅度随放牧强度的增大而增大。土壤微生物数量、微生物量及土壤酶活性的垂直分布为0 10 cm>10 cm 20 cm。相关分析结果表明:放牧干扰条件下,土壤微生物数量与微生物量之间均存在显著或极显著的相关性。土壤酶活性与微生物数量、微生物量密切相关,过氧化氢酶、转化酶与细菌、放线菌极显著相关(P<0.01)、与微生物量碳显著相关(P<0.05);蛋白酶与真菌及微生物量碳、氮极显著相关(P<0.01),与细菌显著相关(P<0.05)。【结论】适度放牧可使土壤微生物数量、微生物量和土壤酶活性增加。土壤微生物数量、微生物量与土壤酶活性之间具有密切关系。     

鲤鱼mtDNA酶切图谱的构建

采用密度梯度离心法及ＲＮａｓｅ消化法制备并纯化了鲤（ＧｙｐｒｉｎｕｓｃａｒｐｉｏＬｉｎｎａｅｕｓ）肝脏线粒体ＤＮＡ（ｍｔＤＮＡ）,用１０种限制性内切酶对ｍｔＤＮＡ进行了分析,鲤鱼ｍｔＤＮＡ分子量约１０．１２×１０￣６,约１６．４９ｋｂ．ＳａｌⅠ、ＰｓｔⅠ、ＢａｍＨⅠ、ＸｂａⅠ、ＢｇｌⅠ、ＰｖｕⅡ、ＸｈｏⅠ、ＥｃｏＲⅠ、ＤｒａⅠ和ＨｉｎｄⅢ分别为１、１、３、３、３、４、１、４、４、和６个切点。根据单酶解及双酶解结果,构建了鲤ｍｔＤＮＡ１０种具酶３０个切点的限制性酶切图谱。     

大鵟消化系统蛋白水解酶种类和活性分析

采用蛋白水解酶复性电泳(G-PAGE)技术对大(Buteo hemilasius)消化系统5种器官腺胃、胰脏、十二指肠、空肠、大肠蛋白水解酶的种类和性质进行了研究,以期为研究野生鸟类的分类地位、系统演化提供基础资料,结果表明,①受pH值的影响和制约,大消化系统蛋白水解酶的活性在碱性、中性与酸性条件下递减;②在酸性条件下,45 ku蛋白水解酶存在于除腺胃外的各受检器官;③pH 7.0时,腺胃、胰脏酶谱相似,均含有683、5、342、0 ku的蛋白水解酶;④pH 8.0时,空肠和十二指肠的蛋白水解酶种类最多、活性最强,分别检出8种和7种蛋白水解酶。总之,pH值对蛋白水解酶的活性有明显的制约作用,46、41ku蛋白水解酶随着pH值的增高而失去活性,为酸性蛋白水解酶,250、2064、5 ku蛋白水解酶随着pH值的增高活性逐渐增强,为碱性蛋白水解酶。十二指肠和空肠的蛋白水解酶种类多、活性强,可能为蛋白质消化的主要场所。     

风干羊肉中乳酸菌的体内外抗氧化特性

【背景】机体的衰老和一些疾病多与氧化作用有关,随着对抗氧化制剂研究的深入,人工合成抗氧化剂的安全性受到质疑,因此寻找天然抗氧化制剂的研究已成为热点。【目的】从风干羊肉中筛选抗氧化活性较高的乳酸菌,分析肉源乳酸菌体内外抗氧化能力。【方法】以24株肉源乳酸菌为研究对象,以自由基清除能力、亚铁离子螯合能力、还原能力及抗脂质过氧化能力为体外抗氧化能力分析指标,筛选出体外抗氧化活性较强的乳酸菌,运用16S rRNA基因序列同源性分析进行菌种鉴定,通过小鼠试验研究其体内抗氧化能力。【结果】试验所测24株乳酸菌均具有一定的体外抗氧化能力,其中菌株TR13为24株乳酸菌中体外抗氧化能力较强的菌株,其超氧阴离子自由基(·O2?)清除率为54.29%,羟自由基(·OH)清除率为90.84%,1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基(1,1-diphenyl-2-picrylhydrazyl,DPPH)清除率为99.38%,亚铁离子螯合率为55.85%,还原能力达1.345,抗脂质过氧化率为39.99%。通过16S rRNA基因鉴定,菌株TR13为一株瑞士乳杆菌。通过给D-半乳糖诱导的衰老型小鼠饲喂TR13菌液,验证了TR13对小鼠的肝脏、肾脏及血液组织中谷胱甘肽过氧化物酶(glutathione peroxidase,GSH-Px)活性、超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)活性、过氧化氢酶(catalase,CAT)活性均有显著的提升作用(p<0.05),且TR13组的GSH-Px活性显著高于维生素C (Vc)组(p<0.05)。【结论】菌株TR13对机体的氧化具有一定的防御作用,研究结果可为乳酸菌抗氧化制剂的研究提供参考依据。     

Sirtuins与PARP-1在细胞凋亡过程中的相互作用

哺乳动物Sirtuins家族目前共发现7个成员：SIRT1～SIRT7,它们均为NAD+依 赖性且从细菌到人类都保守的一类酶.人们已经对这7种去乙酰化酶进行了亚细胞定位 .目前,对其研究主要集中在对细胞发育相关的重要转录因子如p53、FOXO家族及相关 蛋白的去乙酰化修饰.Sirtuins对许多生理过程有着重要的调节作用,尤其是当发现 它们对寿命延长的调控作用后,Sirtuins引起了人们极大的关注,且都发表在世界顶 级刊物上.聚ADP核糖聚合酶(poly ADP-ribose polymerase, PARP)是一类存在于大多 数真核细胞中的蛋白质翻译后修饰酶,尤其是聚ADP核糖聚合酶1(PARP-1)在细胞内 DNA损伤修复等过程中起着重要作用,该酶同样以NAD+作为催化反应的底物.有研究发 现,Sirtuins家族成员与PARP-1在细胞内某些重要生理过程中存在着相互作用.本文评 述了Sirtuins家族成员、PARP-1的生物学特点,并就其参与哺乳动物细胞凋亡的调控 机制和相关信号通路进行了详细的论述,以期对Sirtuins家族成员、PARP-1生物学功 能及其相互作用的研究提供理论指导.     

Distribution and linkage disequilibrium analysis of polymorphisms of MC4R, LEP, H-FABP genes in the different populations of pigs, associated with economic traits in DIV2 line

PCR-RFLP was used to analyze the polymorphisms of MC4R, LEP, H-FABP genes in a swine breed composite (DIV₂) and 4 swine breeds (Yorkshire, Landrace, Meishan, Bamei). The association study of these polymorphisms with several economic traits was carried out on a DIV₂ population. The results obtained showed that MC4R/TaqI genotype had an effect for average backfat thickness (P < 0.05) and lean meat percentage (P < 0.05). At locus LEP/HinfI animals of AA genotype had lower test daily gain than that of BB (P < 0.01) or AB genotype (P < 0.05). At the H-FABP/HaeIII locus lean meat percentage of the individuals with genotype DD were higher than that with genotype dd (P < 0.05). Linkage disequilibrium analysis among MC4R, LEP and H-FABP revealed that these genes were independent. This represented two or more genes that could be combined together within one genotype in order to facilitate breeding for objective traits. In addition, a method allowing simultaneous detection of fragments of MC4R and LEP gene was developed.