Overview of SARS-CoV-2 genome-encoded proteins

Science China Life Sciences - Severe acute respiratory syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has spread rapidly throughout the world. SARS-CoV-2 is an enveloped, plus-stranded RNA virus with a...     

MethylPurify: tumor purity deconvolution and differential methylation detection from single tumor DNA methylomes

We propose a statistical algorithm MethylPurify that uses regions with bisulfite reads showing discordant methylation levels to infer tumor purity from tumor samples alone. MethylPurify can identify differentially methylated regions (DMRs) from individual tumor methylome samples, without genomic variation information or prior knowledge from other datasets. In simulations with mixed bisulfite reads from cancer and normal cell lines, MethylPurify correctly inferred tumor purity and identified over 96% of the DMRs. From patient data, MethylPurify gave satisfactory DMR calls from tumor methylome samples alone, and revealed potential missed DMRs by tumor to normal comparison due to tumor heterogeneity.

Electronic supplementary material

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浓缩狂犬病疫苗接种后不良反应与血清抗体水平分析

报导了≥２．５ＩＵ浓缩狂苗人体接种后的不良反应其反应率为１．３１％与以往未浓缩常规苗的反应率为０．７３％比较两者具有显著性差异（Ｘ２＝６．９４,Ｐ＜０．０１）,浓缩苗以注射１～３针时的不良反应多,临床表现以局部极痛、红肿、瘙痒、急性荨麻疹和过敏性休克等。但其血清抗体阳转率７天时为４０．０％以上,１４天时为１００％,而常规苗仅是４０．０％,抗体滴度浓缩苗第７天时达到有效保护水平（中和试验）。显示了其抗体产生早,水平高特点,关于如何减少浓缩狂苗不良反应问题,作者提出了几点建议     

DM423菌株诱变前后对吡哌酸的耐药性测定

为了研制一种对腹泻病人疗效快,又不造成菌群失调的药物。我们确定吡哌酸与DM423菌联合应用。首先把DM423菌株诱变成耐药菌株,经多次诱变筛选结果是,耐药量比原菌株提高了2000倍,耐药性相对稳定,耐药株生物学特性与原菌株相同。定名为DM423-1菌株。     

Clustal W—蛋白质与核酸序列分析软件

蛋白质与核酸的序列分析在现代生物学和生物信息学中发挥着重要作用,新的算法和软件层出不穷,本文介绍一个可运行在ＰＣ机上的完全免费的多序列比较软件－ＣｌｕｓｔａｌＷ,它不但可以进行蛋白质与核酸的多序列比较,分析不同序列之间的相似性关系,还可以绘制进化树。由于其灵活的输入输出格式、方便的参数设定和选择、详尽的在线帮助以及良好的可移植性,使得ＣｌｕｓｔａｌＷ在蛋白质与核酸的序列分析中得到了广泛应用。     

小鼠卵巢组织的超速冻存法研究

目的　本实验通过对小鼠卵巢组织进行冻存研究 ,掌握卵巢的低温生物学特性 ,摸索出一种简便有效的组织器官冻存法 ,为卵巢移植及器官冷冻提供有用的技术方法。方法　通过对小鼠卵巢组织进行慢速程序法与快速液氮蒸汽法冻存 ,比较分析了不同方法所需保护剂种类、浓度、渗透平衡时间。采用对解冻后卵巢组织超微结构观察、组织化学染色、激素测定及自体、异体移植后动情期的恢复作为评价指标。结果与结论　通过上述实验表明用同种冷冻保护剂 ,液氮蒸汽法冻存的卵巢组织超微结构保存良好 ;组织化学染色示其活性与程序法冻存组织相同 ;自体、异体移植后 ,小鼠动情周期的恢复率及血清雌二醇水平各项指标均与慢速程序法冷冻无显著性差异