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1.
基于图论的代谢网络中流通代谢物处理新方法
高雅杰
袁倩倩
杨雪
毛志涛
余文童
刘浩
Igor Goryanin
马红武
《生物工程学报》
2022,38(4):1554-1564
使用图论方法对基因组尺度代谢网络进行途径搜索是目前途径设计中最常用的方法之一.然而,由于流通代谢物(如H+、H2O、CO2和ATP等)的影响,图论搜索得到的途径在生物学上经常是不可行的.虽然前人提出了一些方法对流通代谢物进行处理,但均存在一些问题,目前还没有标准的处理方法.文中基于流通代谢物在反应中作为转移磷酸等功能基...
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