化合物药物-靶标蛋白互作关联预测算法进展分析

药物的使用极大地提高了人类的生存质量。药物的有效性是药物发现研究中的关键环节。药物的有效性通过识别药物与其作用的靶标蛋白来判断。然而,通过高通量筛选的实验方法分析确定化合物药物-靶标蛋白互作关联是一个十分昂贵、耗时且富有挑战性的任务。基于计算方法的化合物药物-靶标蛋白互作关联预测研究具有效率高、成本低的特点,越来越受到人们的重视。相比实验验证方法,化合物药物-靶标蛋白互作关联的计算方法可为药物发现研究后续的生物药学实验提供更为准确的潜在化合物药物-靶标蛋白候选对,达到减少生物实验的时间和成本的目的。本文回顾了近20年来基于计算方法的化合物药物-靶标蛋白互作关联预测算法所涉及的生物医学特征数据、预测方法和技术,并分析研究过程中所面临的生物医学特征数据高维稀疏,以及多源生物医学数据融合程度不高等问题,为进一步研究提供有价值的参考。     

用于肺水肿量化的掩码图像-语言蒸馏模型

肺水肿量化是治疗急性充血性心力衰竭(congestive heart failure, CHF)的关键。用于视觉和语言预训练的多模态掩码自编码器已被证实可有效融合胸片和肺水肿放射学报告的多模态信息以提升肺水肿量化精度。但现有的方法是随机地对图像和文本进行掩码操作,这一不稳定的操作容易导致模型忽略图像病灶和文本关键词,并阻碍多模态信息的融合与对齐,最终影响量化精度。针对上述问题,本研究设计了一种掩码图像-语言蒸馏模型,首次将自蒸馏引入到医学图像-语言预训练任务中,使得模型获得更为稳定可靠的医学图像和语言表示;并对跨模态注意力融合机制进行优化,使得模型更好地融合与对齐多模态信息。相比于101层残差神经网络(residual network 101, ResNet101)、视觉Transformer (vision transformer, ViT)-B/16、联合胸片和肺水肿放射学报告建模(joint modeling of chest radiographs and radiology reports for pulmonary edema assessment, JMC3R)和用于视觉...     

广东上川岛潮间带软体动物的分布

对上川岛潮间带软体动物进行了采集调查,共鉴定软体动物172种,分属53科。其中瓣鳃纲20科81种,占总数47．09％,腹足纲33科91种,占总数52．91％。分析表明,其区系特点是以南海亚热带-热带种和东海、南海亚热带种为主要成分。