几种甲壳动物促雄性腺素结构预测分析

利用生物信息学方法对目前已知的3种甲壳动物促雄性腺素前体(AGH precursor)和5种类胰岛素促雄性腺因子(insulin-like AG factor)进行分析,探讨了促雄性腺素前体的氨基酸理化特性、信号肽、跨膜结构域、二级结构、motif等,并利用Phyre软件对其三级进行同源性收索。结果显示:促雄性腺素前体包含信号肽,存在跨膜结构域,并和信号肽同位。PDB库中没有找到匹配的motif。3种促雄性腺素前体的二级结构有比较高的相似性,比如都包含两个中心螺旋区。Phyre搜索显示,与8种蛋白的三级结构匹配的均为胰岛素家族的蛋白,这也进一步证实了促雄性腺素前体和胰岛素原的相似性。