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Hedgehog(Hh)信号通路在机体发育和肿瘤发生中发挥着重要作用。在该研究中,Western blot检测三株结肠癌细胞Hedgehog信号通路组分的表达,结果表明三株结肠癌细胞中HT-29细胞Hedgehog信号通路组分较完整。采用MTT和BrdU法检测Hedgehog信号通路膜受体Smo特异性抑制剂环杷明和末端转录因子Gli1/2的特异性抑制剂GANT61对HT-29细胞的影响,提示这两种抑制剂均显著抑制HT-29细胞生存率和细胞增殖率,且GANT61比环杷明更敏感。表达谱芯片检测阻断Hedgehog信号通路后HT-29细胞基因谱的变化,结合生物信息学分析,揭示HT-29细胞经环杷明和GANT61处理后基因表达呈现抑制特征,其差异基因表达主要以下调为主,其中环杷明主要影响细胞内源刺激等,而GANT61主要影响代谢和类固醇合成,并与MAPK信号通路有关联,两者均能影响细胞免疫及凋亡相关通路。这些结果提示,Hh信号通路有可能作为结肠癌的治疗靶点。 相似文献
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同一染色体上基因转换在HLA多态性形成中的作用 总被引:1,自引:0,他引:1
摘要: 人类白细胞抗原(Human leukocyte antigens, HLA)是人类基因组中已知多态性最高的基因家族, 为人类面对异源多变的外界生物分子所必须。以往对HLA多态性形成的研究多集中在互换式重组机制上, 文章研究了基因转换这一重要的多态性形成机制在HLA-DRB基因多态性形成中的作用。应用已知的各基因座的等位基因序列对其进行多态性分析表明, HLA-DRB是一高度多态的基因家族。用Ester Betran模型检测到32个基因转换的区域, 最小的基因转换区域长2 bp, 最远差异位点间隔为204 bp。在71~75、18~221等几个区域上出现基因转换的频数高, 成为基因转换的热点。进一步的分析显示, 71~75、205~217等热点区域分别与东方人、高加索人这两个人群密切相关, 提示基因转换的热点可能具有一定的人群特异性 相似文献
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固醇调节元件结合蛋白1及其靶基因网络 总被引:2,自引:0,他引:2
固醇调节元件结合蛋白1(Sterol regulatory element-binding protein 1, SREBP-1)是重要的核转录因子之一, 能调控内源性胆固醇、脂肪酸、甘油三酯和磷脂合成所需酶的表达, 以维持血脂动态平衡。研究表明, SREBP-1及其靶基因网络的异常可引起胰岛素抵抗、Ⅱ型糖尿病、心功能紊乱、血管并发症和肝脂肪变等一系列代谢性疾病。近年高通量组学技术的发展极大扩展了对SREBP-1靶基因及其转录调控模式的了解。文章对SREBP-1蛋白结构、活化过程、DNA结合位点及其调控的靶基因等方面的研究进展进行了综述, 并着重介绍了基于组学数据的转录调控网络的构建, 这将有助于更好的认识SREBP-1在脂类代谢中的作用, 为深入探讨脂质代谢性疾病的治疗提供新线索。 相似文献
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应用FP-TDI技术进行高通量单核苷酸多态分型 总被引:1,自引:2,他引:1
FP-TDI (fluorescence polarization template-directed dye-terminator incorporation)是一种操作简单、实验投入少、适于高通量反应的单核苷酸多态等位基因分型技术.使用两种评价分型图像质量的数值指标,可以有效地对分型结果进行评价,使该技术得到了改进.在此基础上优化了实验条件,并应用该技术,对人类基因组3号染色体上随机选取的337个单核苷酸多态性位点进行了高通量分型,反应的一次成功率达到59.94%. 相似文献
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糖尿病神经病变(Diabetic neuropathy,DN)是糖尿病在神经系统发生的多种并发病变的总称。文章旨在筛选2型糖尿病早期大鼠外周神经节差异表达的基因。采用Illumina大鼠基因表达芯片,比较糖尿病模型与非糖尿病大鼠外周神经节基因表达谱差异。结果表明,全基因组12 604个已知基因中,158个基因差异表达。糖尿病组与非糖尿病组相比,87个基因表达上调,71个表达下调。对差异表达的基因进行GO分析,发现上调基因所参与的最显著(P<0.001)的几个生物学过程都与神经细胞骨架及运动功能有关;下调基因所参与的最显著的生物学过程主要与"对病毒/生物刺激/其它生物的反应"有关。KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)分析显示,差异表达的基因所参与的最显著(P<0.001)的生物学通路为代谢通路。结果表明:高血糖可导致糖尿病大鼠外周神经节代谢紊乱;高血糖可能通过免疫炎症反应、改变神经细胞骨架及运动功能相关的基因的表达,继而损害外周神经节的结构和功能。 相似文献
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