慢性阻塞性肺疾病患者支气管肺泡灌洗液细菌宏基因组DNA的制备

【目的】优化稳定期慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary diseases,COPD)患者支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluids,BALF)细菌宏基因组DNA的提取方法,以便于高效提取微量的细菌DNA进行后续的PCR反应和测序。【方法】取稳定期COPD患者的BALF 5mL,离心收集细胞。为了有效提取样品中革兰氏阳性菌的基因组,对QIAGEN的DNA提取试剂盒的操作步骤进行优化:加入裂解缓冲液ATL后首先运用研磨珠和多功能生物样品匀质器破碎菌壁,再加入蛋白酶K孵育,然后加入裂解缓冲液AL振荡混匀。无水乙醇沉淀DNA后,将全部溶液过柱,用洗液AW1和AW2各洗柱一次,最后加50μL洗脱液洗脱DNA。提取的DNA定量后,运用PCR方法检测样本中的细菌16S rDNA量,并按照测序要求构建DNA文库进一步验证。【结果】试剂盒优化法提取的BALF的DNA总量为467.5(135.0-1697.5)ng,明显高于按照传统酚-氯仿法提取的DNA总量95.0(0-612.5)ng,并且所提取的DNA可以很好的扩增细菌的16S rDNA以及构建DNA文库,改良后的扩增产物明显增多(P=0.002)。【结论】使用DNA提取试剂盒结合研磨珠和多功能生物样品匀质器破菌壁的方法能够更高效的提取BALF中微量的宏基因组DNA,为进一步的测序和菌群分析打下基础。     

羊水栓塞妊娠大鼠血清中PLA2和PAF的水平变化研究

摘要 目的：探讨羊水栓塞妊娠大鼠血清中PLA2和PAF的水平变化。方法：30只健康妊娠大鼠均分为生理盐水组（A组）、羊水组（B组）及羊水胎粪混合组（C组）。将健康妊娠大鼠麻醉,麻醉效果生成后,全部切除大鼠子宫后关腹,分离出左颈总动脉,并将二通道生理记录仪与其连接,连续监测血液动力学指标,随后将生理盐水、羊水和羊水胎粪混合液腹腔静脉注射于大鼠,1小时后取大鼠肺组织,用HE、APK染色结合CK16免疫组织化学法来检测模型是否制作成功。实验前后1小时两个取血点时,在制备好的羊水栓塞模型大鼠左颈动脉插管处各取1 mL血。采取酶联免疫检测法,测定血清、羊水及羊水胎粪混合液中 PLA2、PAF 的含量。获得的数据用SPSS 20.0软件进行处理,采用配对 t 检验、协方差分析及相关回归分析对血清PLA2、PAF 的浓度进行分析。结果：B组和C组的3个血液动力学指标（动脉收缩压、舒张压及平均动脉压）均显著低于A组（P<0.05）,而B组与C组的4个血液动力学指标均无显著性差异（P>0.05）。同时,A组、B组与C组之间在心率改变方面无显著性差异（P>0.05）。HE染色中,B组与C组大鼠的肺间质显著变宽,且有充血、水肿及炎性细胞浸润,而A组无此现象。AMP染色中,B组和C组大鼠的肺小管中可见被染成蓝色的不定形物质和桃红色的角化鳞状上皮,而A组无此现象。CK16染色中,B组和C组大鼠的肺小管中,可以看到被染成黄色的颗粒和鳞状上皮,而A组无此现象。实验1小时后所取血液中,B组和C组的PLA2与PAF的含量显著高于A组（P<0.05）,且C组中升高程度更大。妊娠大鼠羊水与羊水胎粪混合液中均检测到PLA2和PAF,且羊水胎粪混合液中二者的含量均高。实验1小时前所取的血液中,PLA2和PAF浓度无相关性（P=0.762,R=0.012）,而实验1小时后所取血液中,PLA2和PAF浓度呈正相关关系（P=0.002,R=0.437）。结论：羊水栓塞妊娠模型大鼠羊水和胎粪中均有PLA2和PAF,且实验1小时后所取血液中,PLA2和PAF含量在B组和C组中显著高于A组,说明羊水和胎粪中含有使PLA2、PAF水平增高的刺激因子。