人骨髓间充质干细胞过表达白细胞介素-34对THP-1细胞的调节作用

构建人IL-34真核表达载体并将其转染到人骨髓间充质干细胞,观察高表达IL-34的骨髓间充质干细胞对THP-1细胞的影响。PCR扩增IL-34 DNA,并将其克隆到真核表达载体pIRES2-EGFP;将构建成功的重组体转染到骨髓间充质干细胞,Western blotting和ELISA分析IL-34在细胞中的表达;用高表达IL-34的骨髓间充质干细胞培养上清液来培养THP-1细胞,Real-time PCR分析THP-1细胞中IL-10和TNFα的表达变化。经双酶切和测序鉴定,成功构建了pIRES2-EGFP-IL-34重组体;转染至骨髓间充质干细胞的IL-34可以促进THP-1细胞表达IL-10和TNFα。结果表明,骨髓间充质干细胞表达分泌的IL-34对THP-1有调节作用。     

基于SNP共表达网络肝癌分子分型及预后分析

基于SNP突变数据与mRNA表达谱关联分析,构建一种肝癌分子分型方法并对比不同分型预后的差异,并对不同分型肝癌的发生发展机制进一步研究。首先通过TCGA数据库收集359例肝细胞癌患者的SNP突变数据和mRNA表达数据,采用Wilcoxon秩和检验,筛选突变后差异表达基因,并通过生物信息学工具String和Cytoscape构建差异表达基因的蛋白互作网络,筛选连接度最高的10个Hub基因。利用Consensus Cluster Plus软件包,基于Hub基因mRNA表达水平构建NMF分子分型模型,再结合生存数据评估各分型患者的预后。最后利用加权基因共表达网络分析(WGCNA),识别与肝癌分子分型相关的模块,并针对关键模块的基因进行通路富集,从而对不同分型肝癌的基因表达谱进行比较。结果：NMF模型将肝癌分为高危、低危2个分型,其中CDKN2A和FOXO1基因对分型贡献度高。生存分析显示低危组患者的生存情况显著优于高危组,高危组富集多个与肿瘤细胞侵蚀、转移、复发过程相关的信号通路,低危组则与细胞周期和胰液分泌相关。本研究在无先验性信息的前提下,基于突变后显著差异表达的Hub基因表达水平构建的...