香蕉EST-SSRs标记的开发与应用

从NCBI搜索的2 282条香蕉EST中, 发掘出含有SSR的EST序列110条, 共有122个SSR位点, 检出率为5.3%。SSR位点可分为37种重复单元, 平均长度为20 bp, 其中二、三核苷酸重复单元的SSR占主导地位, 分别占总SSR的33.1%和47.6%。GA和GAA是二、三核苷酸中的优势重复类型, 分别占二、三核苷酸重复类型的75.7%和36.0%; 其他重复类型所占比例均不足10%, 而四核苷酸重复类型最少, 为4.0%。设计的63对EST-SSRs引物中, 有41对EST-SSRs引物对巴西蕉基因组DNA能扩增出产物, 占总引物数的65.1%。应用进一步筛选出的重复性好、多态性高的19对引物对49个香蕉品种(系)进行PCR扩增。每对引物扩增的多态性带数目为4~12个, 平均7.58个; 引物多态信息量变化范围为0.3572~0.8744, 平均0.7324。在相似系数为0.63的水平可将49个品种聚为2个类群：一类为含B基因组香蕉品种; 另一类为不含B基因组的香蕉品种, 表明EST-SSR引物可以应用于香蕉品种资源分类的研究。