从新冠病毒起源到BLAST工具的正确实践

基本局部比对搜索工具(basic local alignment search tool,BLAST)是核酸或蛋白质序列相似性分析最常用的工具之一.因为程序涉及参数较多,一些学生和研究者有时不根据实际情况也不阅读说明书就直接选择默认参数,可能会得出错误结论.BLAST可以进行核酸、蛋白质序列及其相互间的比对,一些低年级...     

糖尿病诱导硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)对小鼠胰岛β细胞衰老的影响*

目的: 本研究旨在观察糖尿病中硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)的表达是否影响胰岛β细胞衰老。方法: 正常小鼠(db/m)、糖尿病小鼠(db/db)随机各取6只,血糖仪检测其空腹血糖值,Western blot检测胰腺组织TXNIP蛋白表达、免疫化学染色检测胰腺组织中衰老相关β-半乳糖苷酶活性,Western blot检测胰腺组织衰老相关指标p16、p21、Rb表达的变化。INS-1胰岛β细胞随机分7组(n=6),用各组慢病毒(30 μl)转染4~6 h后,嘌呤霉素(PM, 3 μg/m)筛选7 d,构建Normal组(正常组)、Scramble ShRNA组(干扰空病毒组)、TXNIP-ShRNA-1(TXNIP沉默一组)组、TXNIP-ShRNA-2(TXNIP沉默二组)组、TXNIP-ShRNA-3组(TXNIP沉默三组)、Ad-GFP组(过表达空病毒组)、Ad-TXNIP-GFP组(TXNIP过表达组)稳转INS-1胰岛β细胞株,检测其TXNIP蛋白表达、衰老相关β -半乳糖苷酶活性、衰老相关指标。结果: 与正常小鼠相比,db/db组小鼠空腹血糖显著上升(P＜0.01),胰腺组织TXNIP蛋白表达显著升高(P＜0.05),胰腺组织β -半乳糖苷酶阳性染色率增加,p16、p21、Rb蛋白表达显著升高(P＜ 0.05)。与Ad-GFP组相比,Ad-TXNIP-GFP组β -半乳糖苷酶阳性染色率增加,p16、p21、Rb蛋白表达均显著增加(P＜0.01)。与Scramble ShRNA组相比,TXNIP-ShRNA组β -半乳糖苷酶阳性染色率降低,p16、p21以及Rb蛋白表达均降低(P＜0.05)。结论: 糖尿病可通过上调TXNIP表达,诱导胰岛β细胞衰老。     

腺病毒过表达TXNIP抑制INS-1胰岛β细胞增殖

糖尿病可以引起硫氧还蛋白相互作用蛋白(thioredoxin interaction protein,TXNIP)表达增加,而TXNIP可以结合内源性硫氧还蛋白(thioredoxin,Trx)并抑制其活性。本研究旨在探讨TXNIP对INS-1胰岛β细胞增殖的影响及机制。构建TXNIP过表达(Ad-TXNIP-GFP)和半胱氨酸247位点突变的TXNIP过表达(Ad-TXNIPc247s-GFP)腺病毒载体并感染INS-1细胞,用Ed U法和Ki67法检测细胞增殖,用Western blot检测ERK和AKT蛋白磷酸化水平。结果显示,TXNIP和TXNIPc247s(不能与Trx特异性结合并抑制其活性)蛋白过表达均显著抑制INS-1细胞增殖,且TXNIP过表达细胞增殖的受抑制程度大于TXNIPc247s过表达细胞。另外,TXNIP和TXNIPc247s过表达均抑制INS-1细胞ERK和AKT的磷酸化。以上结果提示,TXNIP过表达可能通过Trx依赖途径以及非Trx依赖途径抑制ERK和AKT的磷酸化,进而抑制INS-1细胞增殖。     

使用腺病毒过表达TXNIP对H9C2心肌细胞损伤和凋亡的影响北大核心CSCD

本文旨在使用病毒转染技术,观察正常培养条件下的心肌细胞单纯过表达硫氧还蛋白相互作用蛋白(thioredoxin inter-acting protein,TXNIP)是否可以引起细胞损伤和凋亡的发生,并分析其作用途径。对数生长期的H9C2心肌细胞分为三组:正常培养组、空病毒(Ad-eGFP)组、TXNIP过表达(Ad-TXNIP-eGFP)组,使用正常糖脂浓度(5mmo1/L葡萄糖)的DMEM培养基,均于转染72h后收集细胞和培养基进行指标测定。结果显示,细胞转染成功,72h转染效率达到高峰。与Ad-eGFP组相比,Ad-TXNIP-eGFP转染组TXNIPmRNA(P<0.05)和蛋白表达(P<0.01)均明显升高;心肌caspase-3(P<0.05)和LDH活性明显升高(P<0.01);使用流式细胞仪测得细胞凋亡明显增加(P<0.01)。Trx活性、与Trx相关的自由基损伤以及介导氧化应激损伤凋亡途径的p38激酶的活性检测显示,与Ad-eGFP组相比,TXNIP过表达组的Trx活性明显降低(P<0.01),反映膜脂质过氧化损伤的指标丙二醛(malondial dehyde,MDA)、3-硝基酪氨酸明显升高(P<0.01),p38激酶活性明显升高(P<0.01)。这些结果提示,通过腺病毒转染单纯过表达TXNIP可以引起正常糖脂浓度培养条件下的心肌细胞发生损伤和凋亡,其具体机制与抑制Trx活性、增加自由基损伤和p38激酶介导的凋亡有关。     

血管紧张素Ⅱ通过其1型受体诱导胰岛β细胞TXNIP的表达

本研究旨在探讨血管紧张素Ⅱ(angiotensin Ⅱ,Ang Ⅱ)对INS-1胰岛细胞凋亡及硫氧还蛋白相互作用蛋白(thioredoxin-interacting protein,TXNIP)表达的影响,并分析其可能的作用机制。体外常规培养大鼠胰岛细胞株INS-1,使用CCK-8试剂盒检测不同浓度和不同作用时间的Ang Ⅱ对细胞存活率的影响,确定最佳作用浓度及作用时间为1×10~(-6) mol/L和24 h;在上述浓度及作用时间条件下,使用流式细胞术及Western blot检测细胞凋亡;Western blot检测Ang Ⅱ对TXNIP、碳水化合物反应元件结合蛋白(carbohydrate response element-binding protein,ChREBP)及血管紧张素Ⅱ 1型受体(angiotensin Ⅱ type 1 receptor,AT1R)蛋白表达的影响;Real-time PCR检测TXNIP及ChREBP mRNA表达;IF/ICC法观察TXNIP、ChREBP及AT1R的表达变化。结果显示Ang Ⅱ可浓度依赖性及时间依赖性地降低细胞活力(P0.05,n=6)并上调TXNIP的表达(P0.05,n=6);与对照组相比,Ang Ⅱ组细胞凋亡率、ChREBP及AT1R的表达均明显增高(P0.05,n=6)。使用AT1R受体抑制剂替米沙坦(telmisartan,TM)后,Ang Ⅱ对INS-1细胞TXNIP及ChREBP的诱导作用被抑制(P0.05,n=6),Ang Ⅱ诱导的细胞活力降低及细胞凋亡升高被逆转。上述结果表明,Ang Ⅱ可通过AT1R增加ChREBP活化而上调TXNIP的表达,促进细胞凋亡,提示TXNIP可能在糖尿病时Ang Ⅱ诱发胰岛细胞凋亡中发挥作用,并有望成为糖尿病新的治疗靶点。