基于数据挖掘分析ONECUT2基因在胃癌的表达及与幽门螺杆菌感染的相关性

目的分析ONECUT2基因在胃癌中的表达及其与幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)感染的相关性。方法 (1)利用Oncomine数据库、TCGA数据库分析ONECUT2基因在胃癌中的表达,R软件包进行基因的共聚类微阵列数据分析。(2)利用Kaplan-Meier Plotter数据库和GEPIA数据库分析ONECUT2差异表达与胃癌患者预后的关系。(3)利用生物信息学功能注释数据平台DAVID对胃癌中与ONECUT2基因表达正相关的前200个基因进行功能富集分析。(4)利用GEO数据库中的数据分析H.pylori感染与ONECUT2表达的相关性。结果 (1)Oncomine数据库中的数据在胃癌、膀胱癌等8种肿瘤中共有14项研究显示ONECUT2基因在肿瘤组织中的高表达;其中胃癌相关的有两项(t=6.064,P0.000 1;t=4.335,P0.000 1);TCGA数据库的数据也证实胃癌中ONECUT2高表达(t=6.680,P0.001)。(2)胃癌中ONECUT2与EHF、FUT6、TNFRSF11A、RSAEF、EPCAM等20个基因有较高的共表达。(3)GO分析发现胃癌中ONECUT2富集在分子结构活性等相关的基因功能上;而KEGG富集分析发现ONECUT2富集于紧密连接功能等6个通路。(4)Kaplan-Meier Plotter数据库中207676-at芯片结果显示ONECUT2高表达组患者远期生存率下降(P0.001);GEPIA数据库中的分析结果同样显示ONECUT2高表达组患者其总体生存率(P0.05)和无病生存率(P0.01)下降。GEO数据库中GSE74577(P=0.005)、GSE70394(P=0.034)和GSE25146(P=0.036)三个数据集均显示H.pylori感染AGS和GES-1细胞系后ONECUT2表达上调。结论 ONECUT2在胃癌中高表达,且与胃癌一类致癌原H.pylori感染相关。ONECUT2高表达组患者远期生存率下降,表明其与胃癌发生发展密切相关,可能成为胃癌治疗的新靶点。     

孤独症谱系障碍小鼠肠道屏障功能研究

研究孤独症谱系障碍（ASD）模型小鼠肠道屏障功能及肠道动力的改变情况,为微生物−肠−脑轴在ASD发病中的作用提供理论基础。

C57bl/6J雌鼠和雄鼠交配,丙戊酸钠（VPA）诱导的ASD模型及对照组小鼠分别于孕12.5天皮下注射VPA或生理盐水。BTBR模型组为BTBR T⁺Itpr3^tf/J小鼠交配所产幼雄鼠。各组小鼠出生3周后,每窝随机选择2只雄鼠,各组5窝,共计10只,纳入相应组别。各组小鼠6周开始按如下顺序进行行为学检测：旷场实验、埋珠实验、三室社交实验、发声检测和自我梳理实验,各检测间隔5 d。评估小鼠肠道动力（粪便含水量及小肠推进率）和小鼠肠道屏障功能：FITC-葡聚糖灌胃后光谱仪检测小鼠血清中FITC-葡聚糖水平;Western blot检测各组小鼠结肠TREK1,CLDN1,CLDN3,OCLN及ZO1蛋白的表达;qPCR检测各组小鼠结肠Il6,Tnf-α和Ifn-γ mRNA的表达情况。

行为学检测结果显示：与对照组相比,BTBR组和VPA组小鼠穿越旷场中间区次数和停留时间显著降低（P＜0.05）;于目标小鼠侧室的停留时间率显著降低（P＜0.05）;埋珠率和自我梳理时间均显著升高（P＜0.05）;在（20～50）kHz和（50～100）kHz频率范围的发声次数及持续时间均显著降低（P＜0.05）。与对照组相比,BTBR组小鼠粪便含水量显著降低（P＜0.05）,而VPA组小鼠的差异无统计学意义（P＞0.05）。BTBR组和VPA组小鼠小肠推进率与对照组相比无差异（P＞0.05）。此外,与对照组相比,BTBR组和VPA组小鼠血清FITC−葡聚糖水平均升高,结肠TREK1,CLDN1,CLDN3,OCLD蛋白的表达水平降低,结肠Il6,Tnf-α和Ifn-γ mRNA的表达显著升高,差异均具有统计学意义（P＜0.05）,而ZO1的表达差异无统计学意义（P＞0.05）。

鉴于BTBR及VPA模型小鼠均表现出与ASD患者类似的广泛行为障碍,上述模型可作为ASD研究的可靠参考。与此同时,两种ASD小鼠模型均出现肠道紧密连接蛋白表达下调,肠道屏障通透性和促炎细胞因子水平的增高,表明微生物−肠−脑轴在ASD发病中扮演重要角色,且对治疗ASD症状具有潜在临床价值。