胃癌相关的幽门螺杆菌铁摄取调节蛋白基因多态性及进化分析

摘要 目的：探寻幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,Hp）铁摄取调节蛋白（ferric uptake regulator,Fur）基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）和进化分型与胃癌的相关性。方法：选取2011-2018年青岛市市立医院保存的150株Hp（胃癌来源59株和胃炎来源91株）,运用聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）方法扩增fur基因,并进行一代测序及SNP分析。通过NCBI数据库下载226株东亚亚群Hp菌株fur基因序列,应用MEGA 5.0软件分析SNP并构建fur基因Neighbour-Joining系统进化树,建立进化分型。结果：98.7 %（148/150）Hp菌株fur基因PCR扩增阳性。序列分析发现fur基因351位点存在碱基A→G的同义SNP（SNP A351G）,胃癌来源的菌株中G等位基因的变异频率明显高于胃炎来源的菌株,差异有统计学意义（χ²=5.161,P=0.023）;携带该等位基因的菌株发生胃癌风险明显升高（OR=2.4）。在东亚Hp fur基因的Neighbour-Joining系统进化树中,依据进化距离将东亚Hp菌株分为Ⅰ型和Ⅱ型两个亚型,fur基因进化Ⅰ型中的胃癌来源Hp菌株比例明显高于Ⅱ型,差异有统计学意义（χ²=41.8,P=9.9×10^-11）;感染furⅠ型Hp的患者发生胃癌的风险显著升高（OR=4.7）。结论：携带fur SNP A351G的Hp菌株导致胃癌发生风险显著升高,fur基因进化Ⅰ型与胃癌发生风险具有一定相关性。