福建省枳椇种质资源遗传多样性RAPD分析

建立和优化枳椇Hovenia acerba的RAPD反应体系,并对福建省12个种源地35份枳椇材料进行遗传多样性及亲缘关系研究。利用筛选出的10个RAPD引物共检测基因组DNA中193个位点,其中多态性位点161个(83.42%)。供试材料观测等位基因数(Na)1.8342、有效等位基因数(Ne)1.4155,Nei’s基因多样性(H)0.2493,Shannon多样性指数(I)0.3822。以遗传相似系数0.754为阈值,可将35份枳椇分成五大组。RAPD标记可有效揭示福建省枳椇种质资源的遗传多样性,所测枳椇种质资源遗传多样性丰富,极具开发利用价值。     

福建省枳椇种质资源遗传多样性的ISSR分析

通过建立和优化枳椇Hovenia acerba的ISSR反应体系,并利用ISSR分子标记方法,对福建省12个种源地35份枳椇材料进行遗传多样性及亲缘关系研究。枳椇遗传多样性分析的ISSR最佳反应体系为反应总体积25 μL,10×Ex Taq Buffer(Mg2+ plus) 2.5 μL,dNTP Mixture 375 μmol·L-1,引物0.4 μmol·L-1,DNA模板75 ng,Ex Taq酶1 U,ddH2O 14.55 μL。程序：预变性94 ℃ 5 min;变性 94 ℃ 30 s,退火50 ℃ 1 min,延伸72 ℃ 90 s,共 35 个循环;最后延伸72 ℃ 7 min。利用筛选出的10个ISSR引物共检测了基因组DNA中175个位点,其中多态性位点155个,占总位点数的88.57%。供试材料观测等位基因数(Na) 1.8857、有效等位基因数(Ne) 1.4300,Nei’s基因多样性指数(H) 0.2572,Shannon多样性指数(I) 0.3959。UPGMA聚类分析表明,以遗传相似系数0.74为阈值,可将35份枳椇分成四大组。ISSR标记有效地揭示福建省枳椇种质资源丰富的遗传多样性,具较大开发利用价值。