上海市崇明区猪—土壤界面微生态与抗生素耐药性相关性分析

探究养殖场内育肥猪粪便与土壤的微生物组成和抗生素耐药基因构成,并挖掘之间的关联。

选择上海市崇明区5家猪养殖场,采集猪粪便和土壤样本,使用Illumina NovaSeq 6000高通量测序平台进行全基因组鸟枪法测序。通过主坐标分析、LEfSe分析、共现网络分析和统计学检验,探究样本微生物组成、多样性特征和抗生素耐药基因之间的关系。

猪粪便中的主要微生物包括拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门和放线菌门,主要耐药基因类型包括多药耐药类、四环素类、糖肽类、肽类、氟喹诺酮类和β-内酰胺类等。来自同一养猪场的样本在微生物丰度和耐药基因多样性上存在相关性。此外,研究还发现养猪场运作因素如饲料成分、饲养密度和卫生环境等,导致了不同养猪场之间的微生物组成和耐药基因的差异。在猪粪—土壤界面,一些有益微生物之间存在共生关系,具有抑制潜在病原微生物的生长能力,并对土壤微生态产生影响。不同类型的耐药基因之间也存在共生关系。

通过宏基因组学方法研究了猪粪便与土壤中的微生物和耐药基因,揭示了微生物与抗生素耐药基因之间的相关性,提出微生物群是耐药基因谱的重要驱动因素。这一发现为通过微生态调控来预防和控制抗生素耐药性提供了科学依据。

     

TPA对Bcl-X前体mRNA在U251细胞中选择性剪接调控的初步研究

以含有部分Bcl-X序列的微小基因为研究模型,研究了TPA对Bcl-X前体mRNA选择性剪接在体内和体外的调控作用。通过RT-PCR和定点突变实验检测,结果表明PKC信号系统能调控Bcl-X前体mRNA选择性剪接,其机制可能是通过应答序列来调控Bcl-X前体mRNA5’上游和下游剪接位点的选择利用。     

鲍特菌属基因组比较研究进展

鲍特菌属的百日咳鲍特茵、副百日咳鲍特菌和支气管炎败血鲍特菌都是引起哺乳动物呼吸道感染的病原菌,宿主范围各不相同。本文从基因组一般结构、插入序列元件和菌种进化、菌种的特有基因和宿主范围限制、重要毒力因子等4个方面对三者进行了比较分析。     

鲍特菌属3型分泌系统的调控

在鲍特菌属中，百日咳鲍特菌（B．pertussis，Bpe）、副百日咳鲍特菌（B．papapcrtussis，Bpa）和支气管败血鲍特菌（B．bronchiseptica，Bbr）都包含1个高度保守的3型分泌系统。目前只有Bbr的3型分泌系统被详细研究，其3型分泌系统，受BvgAS双成分调控系统调节，由22个基因组成，都属于bsc基因座，包括BopD、Bsp22、BopB和BscN等。在bsc基因座附近新发现了5个保守的开放阅读框架（ORF）——btrS、btrX、btrV、btrW和btrU，这为研究鲍特菌属3型分泌系统提供了新的途径。