Selection of trkB-binding peptides from a phage-displayed random peptide library

Brain-derived neurotrophic factor (BDNF) shows potential in the treatment of neurodegenerative diseases, but the therapeutic application of BDNF has been greatly limited because it is too large in molecular size to permeate blood-brain barrier. To develop low-molecular-weight BDNF-like peptides, we selected a phage-displayed random peptide library using trkB expressed on NIH 3T3 cells as target in the study. With the strategy of peptide library incubation with NIH 3T3 cells and competitive elution with 1 μg/mL of BDNF in the last round of selection, the specific phages able to bind to the natural conformation of trkB and antagonize BDNF binding to trkB were enriched effectively. Five trkB-binding peptides were obtained, in which a core sequence of CRA/TXΦXXΦXXC (X represents the random amino acids, Φ represents T, L or I) was identified. The BDNF-like activity of these five peptides displayed on phages was not observed, though all of them antagonized the activity of BDNF in a dose-dependent manner. Similar results were obtained with the synthetic peptide of C1 clone, indicating that the 5 phage-derived peptides were trkB antagonists. These low-molecular-weight antagonists of trkB may be of potential application in the treatment of neuroblastoma and chronic pain. Meanwhile, the obtained core sequence also could be used as the base to construct the secondary phage-displayed peptide library for further development of small peptides mimicking BDNF activity.     

Selection of trkB-binding peptides from a phage-displayed random peptide library

Brain-derivedneurotrophicfactor(BDNF),originallypurifiedfrompigbrainbyBarderetal.[1]in1982,belongstothefamilyofneurotrophins(NTs)aswellasnervegrowthfactor(NGF),neurotrophin-3(NT-3),NT-4/5.Itisabletopromotesurvivalanddifferentiationofseveralpopu-lationsofneurons,includingmesencephalicdopaminergicneurons,motorneurons,andcholiner-gicneurons,andtoprotectthemagainstneurotoxicityandischemia.BDNFplaysanimportantroleinregulatingneuronsurvivalanddifferentiationduringdevelopmentandinmaintainingthe…     

HGV RNA基因组感染HepG2细胞的研究*

为了观察HGV　RNA基因组在HepG2细胞中的复制和表达并建立HGV感染的细胞模型,体外转录制备HGV RNA基因组,Lipofectamin介导转染HepG2细胞。取HGV RNA阳性培养上清液传代感染HepG2细胞,采用RT-PCR、免疫组化和Western blot等技术检测HGV在HepG2细胞中的复制和表达。HepG2细胞在转染后24h便可在培养上清液中检测到HGV负链RNA,传代感染的细胞及培养上清液中可检测到HGV正、负链RNA。在90d内传代20余次,均能检测到HGV的复制。免疫组化和W     

新型血管内皮细胞抑制因子VEGI_(151)的基因克隆表达及其活性

血管内皮细胞生长抑制因子 (vascularendothelialcellgrowthinhibitor,VEGI)是近年发现的一类肿瘤坏死因子超家族成员 ,具有抑制内皮细胞增殖的作用。从人脐静脉内皮细胞株 (ECV30 4)克隆到其基因 ,构建N端缺失 2 3个氨基酸的表达载体 ,并通过原核表达系统进行表达 (命名为VEGI151) ,表达量为 2 5 .5 % ,纯化后纯度达92 .5 %。通过生物学效应检测 ,发现VEGI151可明显抑制无血清培养基中内皮细胞的增殖 ,2 4h时VEGI151对内皮细胞的IC50 为 10mg/L ,0 .6 13mg/L时使内皮细胞在 36h内完全凋亡。通过检测体外培养肿瘤细胞 (A5 49、HepG2、Hela等 )的存活率 ,未发现明显的增殖或抑制效应。提示VEGI是一种主要作用于血管内皮细胞 ,在新生血管性疾病及肿瘤的治疗中有潜在的应用前景。     

同型HCV不同分离株NS5区基因片段的比较分析

对同一地区两例输血后丙型肝炎进行ＰＣＲ分型,结果为Ⅱ型。分别将其ＮＳ５区基因部分片段克隆到ｐＵＣ１８和Ｍ１３ｍｐ１８中,序列分析结果表明在ＮＳ５区基因相同区段,二者的核苷酸同源性为８９．０４％,氨基酸同源性为９０．７５％。而且在分离株Ｖ中第７０～７２位发现阅读框内终止密码子ＴＧＡ。与Ⅱ型代表株ＨＣＶＢＫ序列相比,相同区段的核苷酸和氨基酸同源性分别为：９１．５％,９１．９２％和９１．９１％,９１．９１％。对比分析表明,在同一地区基因型相同的不同分离株间ＮＳ５区基因仍存在较大变异,分离株Ｖ可能为缺陷性病毒     

一株丙型肝炎病毒缺陷株NS5A基因片段的序列分析

Ｑ丙型肝炎是由丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）引起的一种严重的传染病。丙型肝炎病毒主要通过输血和应用不洁的血液制品传播,所以利用敏感、特异的检测方法筛选献血员对丙型肝炎的预防尤为重要。现在第二代ＨＣＶ检测试剂已大批应用,加入ＮＳ５Ａ抗原的第三代试剂也正在研制中...     

从噬菌体展示的构象限制性随机肽库中筛选有 trkB 结合活性的小肽

脑源性神经营养因子(brain-derived neurotrophic factor, BDNF)能够促进多种神经元的存活和分化, 在神经退行性疾病的治疗中具有广阔的应用前景, 但由于其分子量大而无法穿过血脑屏障, 限制了其临床应用. 以表达于NIH 3T3细胞上的BDNF受体trkB为靶分子, 从噬菌体展示的随机肽库中筛选与trkB有亲和力的小肽, 采用不表达trkB 的NIH 3T3细胞预吸附和最后一轮筛选以1 μg/mL的BDNF竞争性洗脱策略, 使能与trkB天然构象结合、又能有效拮抗BDNF与trkB结合的特异性噬菌体得到了有效富集, 获得了5种trkB结合小肽, 它们有核心序列CRA/TXφXXφXXC(X代表随机残基, φ为T, L或I). 对展示有5种外源小肽的噬菌体进行了初步生物活性测定, 未发现有BDNF样活性, 反而能剂量依赖性地拮抗BDNF的生物功能. 依据其中一个克隆序列(C1)合成的肽也证实有拮抗BDNF的作用, 表明获得的5种小肽可能为trkB受体拮抗剂. 这些trkB拮抗性小肽在治疗神经母细胞瘤和慢性痛以及神经生物学研究中具有应用前景, 同时也为构建二级噬菌体展示肽库、继续筛选BDNF模拟小肽奠定了基础.     

HGV RNA基因组感染HepG2细胞的研究

为了观察HGV RNA基因组在HepG2细胞中的复制和表达并建立HGV感染的细胞模型,体外转录制备HGV RNA基因组,Lipfectamin介导转染HepG2细胞。取HGV RNA阳性培养上清液传代感染HepG2细胞,采用RT-PCR、免疫组化和Western blot等技术检测HGV在HepG2细胞中的复制和表达。HepG2细胞地转染后24h便可在培养上清液中检测到HGV负链RNA,传代感染的细胞及培养上清液中可检测到HGV正、负链RNA。在90d内传代20余次,均能检测到HGV的复制。免疫组化和Western blot可检测到 HGV E2蛋白在感染细胞中的表达。HGV感染细胞经冻存后复苏,仍能检测到HGV RNA。故HGV RNA基因组能够在HepG2细胞中复制和表达,此细胞模型有可能用于HGV的复制与感染防治的研究。     

庚型肝炎病毒NS3蛋白在昆虫细胞中的表达

庚型肝炎病毒(HGV)/GB病毒C(GBV-C)疑似引起人类庚型肝炎[1～3].HGV和GBV-C为同一病毒的两个不同分离株,本文将其称为GBV-C/HGV.GBV-C/HGV属黄病毒科,为单股正链RNA病毒,全长约9.4kb.基因组中仅含有一个单一开放阅读框,编码E1、E2结构蛋白和NS2、NS3、NS4及NS5非结构蛋白.GBV-C/HGV的NS3蛋白具备丝氨酸蛋白酶活性和解旋酶活性[3],在NS3蛋白中还存在线性抗原表位[4],因此,NS3蛋白是GBV-C/HGV的重要功能蛋白.     

TT型病毒基因组的克隆与进化分析

利用PCR方法从输血传播性病毒 (transfusiontransmittedvirus,TTV)阳性标本中获得不同长度且重叠覆盖TTV基因组的DNA片段。将PCR扩增片段克隆到pT Adv载体中 ,筛选获得阳性克隆。DNA序列测定结果表明所克隆的片段为TTV基因组序列。利用DNA片段中特有的限制性内切酶位点将TTV的DNA片段首尾相连 ,得到近全长的基因组克隆 ,命名为TTV0 2 1。对TTV0 2 1的核酸序列进行分析 ,TTV0 2 1长 3472nt,存在 2个阅读框架ORF1和ORF2 ,分别编码 785和 1 46个氨基酸。将TTV0 2 1与其它已知的TTV基因组全序列进行了同源性比较 ,并进行进化分析。结果表明 ,TTV0 2 1序列与TTV分离株CHN2、BDH1的遗传距离较近 ,而与其它分离株相对较远。