猪资源家系MC4R基因扫描及其与脂肪性状的相关分析

黑素皮质激素受体－4（Melanocortin-4 Receptor,MC4R)是在人类肥胖研究中发现的重要调节因子,它可以与瘦蛋白（Leptin),神经肽Y（Neuropeptide Y,NPY),α－黑素细胞刺激激素（Alpha-melanocyte-stimulating hormone,α-MSH)第一起调节动物体重和采食量。采用PCR－RFLP技术,分析了MC4R基因部分片段在猪资源家系群体中的TaqⅠ酶切片段多态性分析。MC4R基因多态性与生长肥育性状,肉质性状,胴体性状的相关性分析的结果表明,MC4R基因型频率在不同品种群体中的分布不同;MC4R基因与猪胸腰椎间膘厚,臀部膘厚,平均背膘,眼肌宽度,眼肌面积,皮率呈显著性相关。MC4R基因主要以显性作用方式发挥作用,加性作用不显著。     

cre／lox P系统介导的基因重组研究进展

由于具有时间,组织和位点特异性,cre重组酶介导的DNA重组已成为基因靶位操作的一个重要工具,概述了cre/loxP系统的作用特点,cre重组酶的结构和重组机制,表达载体构建及重组个体检测等方面的问题,重点介绍了cre/lox P系统在基因重组研究中的应用及近来的发展与成就。     

猪2号染色体遗传连锁图谱的构建与QTL定位分析

构建了猪2号染色体的遗传连锁图谱,并进一步进行了重要生产性状数量性状位点的定位,结果表明,7个微卫星位点均为中高度多态性位点,多态信息含量为0．40182－0．58477,可以满足遗传连锁图谱构建的要求,构建的资源家系遗传连锁图谱总长152．9cM,位点的排列顺序与USDA结果一致,但除了Sw2516与Sw1201标记区间外,所有标记区间距离均大于USDA图谱,将连锁图谱与性状记忆结合起来,进一步进行了猪数量性状位点定位的研究,在2号染色体发现了显著影响活体估测瘦肉率等活体估测性状的QTLs,此外还发现眼肌高度和背最长肌大理石纹的QTLs,其中影响活体估测瘦肉率的QTL达到了染色体显著的水平（P＜0．01）,且解释性状的表型变异达21．55％,影响眼肌高度和背最长肌大理石纹的QTLs分别可以解释10．12％和10．97％的表型变异,影响活体估测性状的QTLs加性效应与显性效应作用方向相反,影响眼肌高度的QTL加性效应与显性效应相同,在大白猪中具有增效等位基因,定位的QTLs效应较大,为在群体中开展分子标记辅助育种奠定了理论基础。     

下一代测序技术在表观遗传学研究中的重要应用及进展

下一代测序技术(Next generation sequencing,NGS)的出现,极大地促进了表观遗传学的研究。将NGS技术引入表观遗传学,便形成了以NGS为基础的各种表观遗传学测序及研究方法,如:全基因组亚硫酸氢盐测序法(Whole genome bisulfite sequencing,WGBS)、简化代表性亚硫酸氢盐测序法(Reduced representation bisulfite sequencing,RRBS)、甲基化DNA免疫共沉淀测序(Methylated DNA immunoprecipitationsequencing,MeDIP-seq)、染色质免疫共沉淀测序(Chromatin immunoprecipitation-sequencing,ChIP-seq)、Tet辅助重亚硫酸盐测序法(Tet-assisted bisulfite sequencing,TAB-seq)、各种染色体构象捕获测序(Chromosome conformation capture sequencing,3C-seq)技术、DnaseⅠ-seq/MNase-seq/FAIRE-seq以及RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)。这些方法的应用和普及改变了人们对多种表观遗传现象的传统认识,使研究人员能够更加全面地深入了解各种表观遗传标志在机体内的广泛分布,以及如何在外界因素的影响下发生相应的动态变化。文章概述了当今主要商业NGS平台的原理和特点,系统介绍了以NGS方法为基础衍生出来的各种表观遗传学测序及研究方法,并在此基础上对近年来应用NGS技术在表观遗传学研究领域中取得的最新研究成果进行了综述。     

猪1号染色体微卫星多态性研究及遗传连锁图谱的构建

微卫星具有多态性高、保守性好等优点。本研究选取以20cM左右的间距均匀分布于1号染色体的8个多态微卫星基因座构建猪1号染色体的遗传连锁图谱,为进一步进行重要经济性状基因座的定位打下基础。试验结果表明,8个基因座等位基因数目2~5个,各个基因座等位基因频率在0.015~0.75之间,杂合度为0.39705~0.67675,多态信息含量为0.32925~0.59316。构建的资源家系遗传连锁图谱总长181.5cM,与USDA结果基本一致,可进一步用于猪数量性状基因座定位的研究。 The Microsatellite Polymorphism Research on Porcine Chromosome 1 and the Construction of Its Genetic Map QU Yan-chun,DENG Chang-yan,XIONG Yuan-zhu,SU Yu-hong,ZHENG Rong,LIU Gui-lan The Key Laboratory of Pig Breeding and Genetics,The Ministry of Agriculture, Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,China Abstract:As a molecular marker,microsatellite has many advantages such as high polymorphism and good conservativeness in animal genetic research.The study chose 8 microsatellite markers that evenly distributed on chromosome 1 with a distance about 20 cM to build the genetic map of porcine chromosome 1.The results of our experiment are as follows:the number of alleles for 8 markers is 2 to 5,their gene frequency is from 0.015 to 0.75,the heterozygosity is from 0.39705 to 0.67675 and the polymorphic information content is from 0.32925 to 0.59316.The map we built is basically in consistent with the result of USDA and can be used in searching quantitative traits loci in pigs. Key words：porcine; microsatellite; heterozygosity; polymorphic information content; genetic map     

IGF2基因PCR-RFLP多态性与脂肪沉积相关性状的关联分析

胰岛素样生长因子 2在胎儿生长发育、肿瘤细胞增殖、肌肉生长等方面具有重要的调控作用 ,是影响猪瘦肉量的主要候选基因。采用PCR RFLP技术 ,分析了IGF2基因第 8内含子部分片段在猪资源家系群体中的NciⅠ酶切片段多态性分布。IGF2基因该片段具有两个NciⅠ酶切位点 (切点位于第 8内含子 ,分别记录为位点A和位点B) ,两位点在资源家系中均具有多态性。IGF2基因B位点酶切未突变个体均比酶切突变的个体背膘薄 18 2 8% (P<0 0 1) ,肥肉率低 2 2 4 3% (P <0 0 1) ,瘦肉率高 8 71% (P <0 0 1) ,位点A具有相同的影响趋势。在该研究群体中 ,IGF2基因发挥作用的方式主要为加性效应 ,可作为猪提高瘦肉率的候选基因     

猪肌肉蛋白质含量的QTL分析

用酶山猪与大白猪构建的资源家系检测影响肌肉蛋白质含量的数量性状座位（QTL）。测定135头F2代个体及其相应父母和祖父母在分布1号、2号和6号染色体上的24个微卫星基因型。用这些微卫星标记计算每个F2代个体固定位置的加快和显性系数,以1cM的间距肌肉蛋白质含量与这些系数进行回归分析,发现3个与肌肉蛋白质含量具有显著效应的QTL（P＜0．05）,它们分别于位于1号染色体的Sw1332和Sw2130之间,2号染色体的Sw2516和Sw1201之间,6号染色体的Sw2516和Sw1201之间,分别解释0．91％、12．76％和4．60％的肌肉蛋白质含量变异方差。结果提示,影肌肉蛋白质含量的QTL分布在多条染色体上。     

胰岛素样生长因子2的遗传学特征与生物学作用

胰岛素样生长因子（insulin-like growth factor,IGF）是一类多功能细胞增殖调控因子,因其化学结构与胰岛素相似而得名,IGF2是一个由67个氨基酸组成的蛋白质,它在胎儿发育、肿瘤细胞增殖、肌肉生长等方面具有重要的调控作用。本文主要论述了IGF2的基因结构、遗传方式,以及与印迹表达、肿瘤发生、肌纤维增殖和生长发育有关的生物学作用。 Abstract:Insulin-like growth factor (IGF) is multiple proliferation controlling factor of cells,and it gets this name according to its similarity to insulin.IGF2 is a single chain protein of 67 amino acids,which is probably required for normal fetal growth and development.In this article,we discussed the gene structure ,ways of its heredity ,and biological effects concerning imprinting,tumor development,muscle forming and individual growing of IGF2.     

调控细胞凋亡的主要基因与因子

细胞凋亡是生物界广泛存在的一种重要的生命过程,许多研究者已从不同角度对其发生机理,影响因子,应用等方面开展了卓有成效的研究,本文主要论述了与细胞凋亡调控有关的ced基因,bcl-2基因,ICE基因,p53基因,Fas基因等,以及与之有关的蛋白,如caspases家族,TRAIL等,随着对细胞凋亡机理研究的不断深入,衰老等生理现象和细胞凋亡相关的疾病和机理将逐步得以阐明,并以此为基础建立相应诊断方法。     

肥胖基因及其受体与脂肪沉积调控

多年来的研究表明 ,哺乳动物能量平衡应该受到反馈回路的控制 ,回路中下丘脑可以感应能量贮存量 ,继而调节采食量和能量支出以保持平衡体重。此假说源于一种脂肪组织产物通过在血浆中循环作用于下丘脑影响能量平衡。试验表明 ,肥胖鼠不能产生足量的饱食因子调节其食物消耗 ,而ｄｂ鼠虽能产生饱食因子 ,但因饱食中枢缺陷而不能对其起反应。1 .肥胖基因的克隆表达及其多态性随着分子生物学技术的出现和发展 ,肥胖基因被克隆测序 ,终于发现了ｏｂ/ｏｂ小鼠的特定基因缺陷 (Ｚｈａｎｇ等 ,1 994) ,由于基因突变 ,ｏｂ/ｏｂ小鼠不能产生瘦蛋白。…