苹果Ty1-copia类逆转座子家族鉴定及特性分析

根据逆转座子RT保守序列设计引物,利用PCR方法从苹果'嘎拉'中克隆了20条RT片段,分析苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子家族特性及进化关系.结果显示,20条逆转录酶保守序列表现出了高度的异质性.结合已报道的37条苹果Ty1-copia类逆转座子RT片段,构建了系统发育树,发现家族1、3和4中具有转座活性的逆转座子的可能性较大;序列分析表明,Ty1-copia类逆转座子是苹果基因组内序列重组的热点.用RT序列为探针进行Southern杂交,发现苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子拷贝数高、分布广泛.研究结果为进一步分离具有转座活性的苹果Ty1-copia类逆转座子及其人工诱导芽变奠定了基础.     

苹果元帅系和富士系芽变品种的IRAP鉴定

以筛选的6对IRAP引物对15个元帅无性系芽变和16个富士无性系芽变进行了鉴定,以揭示苹果无性系变异的机理.结果显示,所有引物在两种无性系芽变中均扩增出丰富的条带,表现出多态性.SAHN聚类分析结果显示,以相似系数0.65为阈值,元帅芽变无性系和富士芽变无性系各自聚为一类;以相似系数0.83为阈值,供试的15个元帅无性系变异可聚为4类:第一类包括‘元帅'、‘居家店短红星'、‘艳红'、‘米勒矮生'、‘矮壮'、‘红星'、‘红冠'、‘矮威尔'、‘早红星'和‘华帅一号',第二类包括‘玫瑰红'、‘奥勒冈矮生'和‘矮红';‘新红星'和‘哈蒂·勃莱特'分别独自成类;以相似系数0.89为阈值,供试的16个富士芽变无性系可聚为4类,第一类包括‘长富3'、‘盛放富1'、‘长富6'、‘群富1'、‘烟富1'、‘竽井Ⅱ系'、‘岩手Ⅰ系'、‘富士Ⅰ系'、‘红王将'、‘长富7'和‘长野Ⅰ系',第二类包括‘富士'和‘秋富5',第三类包括‘斋藤Ⅱ系'和‘秋富2',‘秋富1'独自成类.研究表明,逆转座子在苹果基因组内的插入方向具有随意性,转座插入和逆转座子间重组是引起苹果无性系变异的两个重要机制,本试验所开发的引物是进行苹果无性系变异研究的有效工具.