高通量RNA甲基化测序数据处理与分析研究进展

随着高通量测序技术快速发展,Me RIP-seq(methylated RNA immunoprecipitation sequencing)测序技术开启了RNA表观遗传学研究新局面,能够在全基因组范围内描述RNA甲基化.从Me RIP-seq高通量数据中挖掘RNA甲基化模式,有助于揭示m RNA甲基化在调控基因表达、剪切等方面所发挥的潜在功能,有效指导癌症的干预治疗.本文从Me RIP-seq测序原理出发,较全面地综述Me RIP-seq数据处理和分析方法研究现状,并对其所面临的计算问题进行讨论和展望.     

肺癌数字化临床路径管理平台的构建和初步应用

目的:构建肺癌数字化临床路径并研究其在临床中应用优势。方法:收集2013年8月-2016月3月于哈医大四院胸外二科入院的肺癌手术患者,150名患者通过肺癌数字化临床路径管理系诊治(临床路径组),150人通过常规方式诊疗(对照组),比较两组最终的住院天数和住院总费用。结果:临床路径组的住院总天数、住院总费用均小于对照组(P0.05或0.01)。结论:数字化肺癌路径管理平台在临床病人管理中具有一定的优势。     

见微知著：微生物对人体恶性肿瘤诊疗研究带来的机遇与挑战

微生物与人体共生共存,主要分布在口腔、鼻腔、阴道、肠道、皮肤等部位,目前的研究已经表明微生物的分布特异性、种群的动态变化在人体恶性肿瘤的发生发展过程中发挥着重要的作用,为该领域今后的临床诊疗带来了全新的机遇和挑战。因此,笔者着重阐述微生物在口腔癌、胃癌、胆囊癌、胰腺癌、结直肠癌等常见恶性肿瘤中的作用及临床研究进展。旨在帮助临床医师了解目前微生物肿瘤学的发展现状及机遇与挑战。     

缺血性心肌病的多模态心血管影像学方法进展

近年来,超声(ultrasound, US)、CT冠状动脉造影(CT coronary angiography, CCTA)、血管内超声(intravenous ultrasound,IVUS)、光学相干断层成像(optical coherence tomography, OCT)、多层螺旋CT成像(multi-slice computed tomography, MSCT)、单光子发射计算机断层成像(single-photon emission computed tomography, SPECT)、正电子发射计算机断层成像(positron emission computed tomography, PET)及心脏磁共振(cardiac magnetic resonance, CMR)等多种心血管成像技术能够提供与冠脉病变及心肌形态和功能相关的解剖学、血流动力学、细胞生物学及病理生理学等方面的重要信息,在缺血性心肌病的临床诊疗及预后评估中发挥着日益重要的作用。然而,如何恰当选择的多模态心血管影像技术是临床医师面临的一大难题。因此,本文在归纳总结主要心血管成像技术临床应用进展的基础上,对多模态心血管影像学在缺血性心肌病相关的冠脉解剖与斑块成像、心肌功能、心肌灌注及心肌活性显像中的临床应用价值进行综述。旨在帮助临床医师客观认识各种成像技术的优势与不足,从而制定最优化的选择方案。     

心脏磁共振成像评价缺血性心肌病的临床应用价值

目的:评估心脏磁共振(cardiac magnetic resonance,CMR)功能成像在缺血性心肌病临床诊断中的价值。方法:使用飞利浦3.0T磁共振仪,对32例临床确诊的缺血性心肌病患者进行CMR平扫及钆对比剂动态增强扫描。应用Cardiac MR Analysis软件进行相关后处理分析,计算左室射血分数、室壁增厚率等心功能参数并与超声心动图检查结果相比较。采用17节段分段法分析心脏形态学、心肌组织运动、局部灌注、延迟增强等特点,评价其临床应用价值。结果:所有患者的心功能参数均降低,包括左室射血分数、每搏输出量、心输出量和室壁增厚率,心脏磁共振和超声心动图的测量结果并无明显差异(49%±5.3%vs 52%±8.2%;42.8 mL±8.9 mLvs 45.7 mL±10.6 mL; 3.5 L/min±0.6 L/min vs 3.8 L/min±0.9 L/min; 28%±4%. vs 31%±6%)(P0.05)。所有患者中存在室壁运动异常的为184段(184/544);其中心肌血流灌注信号减低的有136段(136/184),呈现心肌延迟强化的有98段(98/136)。结论:CMR功能成像对于缺血性心肌病的临床诊疗及预后评估可提供与心肌形态及功能相关的重要信息。     

PBL教学法联合PACS系统在医学影像学教学中的应用

目的:探讨采用PBL和PACS相结合的教学模式在影像学实习教学中的应用效果。方法:对我院2010级临床本科生40人采用传统教学法授课,另40人采用PBL和PACS相结合的教学法授课。课程结束后以考试成绩作为教学效果的评价指标,评价两种教学方法的教学效果;以调查问卷的方法评价学生对两种教学方法的感兴趣程度,并对结果进行统计学分析。结果:我们的研究结果显示,采用PBL和PACS相结合的方法进行教学的学生与传统教学法相比,理论考试成绩有所提高,但缺乏统计学意义(p0.05),病例分析成绩显著提高,差异有统计学意义(P0.05)。问卷调查显示,PBL和PACS结合的教学方法更受同学欢迎,更能培养学生的自学能力和团队合作能力(P0.05)。结论:采用PBL和PACS相结合的教学方法,有助于提高学生的学习兴趣,提高学习成绩,值得在教学中应用。     

不同俯卧位通气时间对中重度肺内/外源性ARDS患者的治疗效果

目的:探讨中重度肺内/外源性ARDS患者行不同时间俯卧位通气的治疗效果。方法:将中重度30例肺内/30例外源性ARDS患者分别行2h、4h俯卧位通气,观察患者APCHEII评分,氧合指数、胸片吸收情况、心率、平均动脉压、脱机拔管时间,出ICU时间。结果:四组患者APCHEII评分、心率、平均动脉压比较差异均无统计学意义(P0.05)。肺内源性ARDS患者行2 h、4 h俯卧位通气均能有效改善患者氧合指数,4 h组较2 h组氧合指数改善、胸片吸收情况更明显,4 h组在脱机时间、转出ICU时间均优于2 h组(P0.05);肺外源性ARDS患者行2 h、4 h俯卧位通气均能有效改善患者各项指标,但两组间无统计学差异(P0.05),且均优于肺内源性ARDS患者(P0.05)。结论:俯卧位通气可改善中重度肺内/外源性ARDS患者的病情,其对肺外源性ARDS患者效果更好,2 h俯卧位通气即能取得较好效果,而肺内源性ARDS患者需更长时间的俯卧位通气改善病情且预后较差。     

底座入土深度和面积对典型草原土壤呼吸测定结果的影响

生态学家对土壤呼吸开展了大量研究, 但很少评估“底座”对土壤呼吸测量结果的影响, 特别是底座入土深度和面积对土壤呼吸测定结果的影响。为此, 该研究在内蒙古典型草原设置了2个底座面积(15 cm × 15 cm和30 cm × 30 cm)和2个底座入土深度(2 cm和5 cm)处理, 采用气室法在植物生长季对土壤呼吸进行了测定, 分析评估了底座面积和入土深度对土壤呼吸测定结果的影响。结果显示: 与底座入土较浅和面积较小的处理相比, 底座入土较深和面积较大的处理, 土壤呼吸测定值分别降低了8.0%-9.7%和9.1%-10.8%; 这两个处理的底座内土壤温度显著升高, 土壤含水量显著下降, 地上净初级生产力显著降低。结构方程模型分析表明, 底座入土较深、面积较大的处理, 主要通过降低地上净初级生产力和土壤含水量, 增加土壤温度, 使土壤呼吸下降, 各因子共同解释了土壤呼吸变异的89%。研究发现, 在使用气室法测定土壤呼吸时, 底座入土深度和面积对土壤呼吸测定结果具有显著影响, 评估底座处理效应对准确测定土壤呼吸强度具有重要的意义。理论上, 适当降低底座入土深度和底座面积大小, 将有助于准确测定土壤呼吸。但在实践中, 由于土壤异质性的影响, 减少底座面积可能会增加新的测量误差, 只能考虑适当降低底座入土深度。     

后处理对心肌缺血再灌注致脑损伤中炎症因子及GFAP的影响

目的:探讨缺血后处理对心肌缺血再灌注致脑损伤中炎症因子及胶质纤维酸性蛋白的影响。方法:24只雄性SD大鼠随机分为3组(n=8),假手术组(Sham)、心肌缺血/再灌注组(IR)、后处理组(IPost)。结扎大鼠冠状动脉左前降支30 min,复流120 min建立大鼠心肌缺血/再灌注模型。后处理组于再灌注前进行缺血后处理,再灌注10 s,缺血10 s,共3次。断头处死大鼠取脑组织,光镜下观察病理学结果,Western blot检测炎性因子IL-6、IL-8、IL-10,免疫组化法检测GFAP。结果:与Sham组相比较,IR组脑组织炎症因子IL-6,IL-8表达增加,IL-10下降(P0.01),而后处理可以降低脑组织中IL-6,IL-8的表达,增加IL-10的表达(P0.01);与Sham组相比较,IR组脑组织GFAP表达增多(P0.05),而后处理可以显著增加脑组织中GFAP的表达(P0.01)。结论:心肌缺血后处理可以减少脑组织中炎症因子的表达,增加GFAP的表达,从而起到脑保护作用。     

IMPAX PACS在黑龙江省区域化医疗远程会诊中的初步应用

目的:研究黑龙江省不同医疗机构之间新型协同服务模式,加强垦区各级医疗机构的信息化基础建设,建立基于医学影像存档与通信传输系统(Picture Archiving and Communications System,PACS)的数字化医疗区域。方法:将哈尔滨医科大学附属第四医院现有的影像数据归档,集成到IMPAX PACS数据中心(Internet Data Center,IDC),作为整个区域医疗的影像中心。通过IDC交换平台的延伸覆盖,以及医院信息系统(Hospital Information System,HIS)与XERO集成,可经网络调阅IDC中的影像,实现远程影像会诊。结果:建立基于IMPAX PACS的区域医疗;工程覆盖1家省会大医院和垦区2家综合性医院、5家二级医院、11家农场医院,实现联网医院间的影像学远程会诊。结论:PACS区域远程医疗系统的建立为基层百姓就医提供方便,影像学远程会诊可有效避免影像学重复检查,双向转诊、信息共享给患者带来更多的便利和实惠,具有巨大的社会效益。