转基因食品的过敏特性评估——食物过敏原数据库的建立

全球对转基因食品的管理逐渐趋于规范 ,最近国务院颁布了《农业转基因生物安全管理条例》 ,对转基因食品的安全管理将逐步完善。目前国内外均认为对转基因食品的过敏性评估是十分必要和迫切的。有关过敏性评估的原则性问题已确定 ,但目前还没有一个专门的数据库用于过敏性的评估。目前已经建立了一个食物过敏原数据库 ,此数据库提供转基因食物与已知食物过敏原氨基酸序列的同源比较 ,这是评估外源基因产物是否为过敏原的重要依据。同时 ,该数据库还包括了与食物过敏原有关的文献资料和相关的研究方法及花粉过敏的研究情况。最近国际食品生物…     

剪接因子异质核糖核蛋白A2B1在癌细胞和衰老细胞中的相反表达趋势及其对癌细胞衰老的调控

剪接因子异质核糖核蛋白A2/B1(HNRNPA2B1)与人类及小鼠的寿命相关,并在多个癌症的病程进展中发挥重要的作用.然而,HNRNPA2B1能否在细胞衰老这一与个体衰老和抑制癌症密切相关的生物学过程中发挥作用尚不清楚.本研究发现,HNRNPA2B1在多个癌症体系中呈显著上调表达趋势,而在多个细胞衰老体系中则呈显著下调...     

小鼠精子发生中环形RNA生成和功能分析

小鼠精子发生过程中存在大量环状RNA(circRNA,circular RNA),其来源和功能尚不清楚。利用生物信息学手段分析小鼠精子发生过程中5个时期(精原干细胞,原始精原细胞、前细线期精母细胞,粗线期精母细胞及圆形精子细胞)的circRNA,共发现3万余个circRNA。对circRNA两侧内含子中的重复序列分析发现:circRNA两侧内含子中显著富集反向互补重复序列。这些重复序列不仅包括已报道的SINE/Alu序列,还包括SINE/B2、SINE/B4、LINE/L1,LTR/ERVL-MaLR和LTR/ERVK,暗示多种类别的反向互补序列有可能参与了精子发生过程中的circRNA形成。采用sailfish-cir和maSigPro对获得的circRNA进一步定量和差异表达分析,发现5个不同时期的精子细胞中共存在409个差异表达circRNA,它们所在基因能够富集在与精子发生密切相关的功能类群上。对差异表达的circRNA进行miRNA结合预测,共发现有137个circRNA-miRNA结合位点。精子发生相关基因来源的circRNA序列中有93%含有与翻译有关的m~6A基序,暗示精子发生进程中的部分circRNA有形成多肽的潜力。研究发现小鼠精子发生过程中许多circRNA具有RNA结合蛋白(RBP)结合位点,提示circRNA可能具有"RBP海绵"的潜在功能。