E-box元件修饰端粒酶核心启动子序列及体外转录活性分析

人类端粒酶启动子(hTERT启动子)在肿瘤基因治疗中的有效性已经得到了证实. 然而,hTERT启动子有限的肿瘤靶向转录活性困扰着它的临床应用.早期研究已经揭示,核心hTERT启动子上的-34位E-box元件与该启动子的肿瘤靶向转录活性有关.为进一步探索核心hTERT启动子序列3′端富余E-box元件是否能提高启动子的肿瘤靶向转录能力,用化学合成方法在野生型hTERT(WT-hTERT)核心启动子片段(编码蛋白起始子ATG上游-268 bp～-10 bp)的3′端接入3个E-box序列, 构建成修饰型hTERT(Mod-hTERT)启动子. 然后,分别用WT-hTERT和Mod-hTERT启动子去调控增强型绿色荧光蛋白(EGFP)及荧光素酶报告基因在293FT、HepGⅡ、SGC7901、U2OS、以及原代培养人成纤维细胞(PHF)中表达. 结果表明, 在Mod-hTERT启动子的各实验组细胞中,能够在端粒酶阳性的293FT、HepGⅡ及 SGC7901细胞组中观测到EGFP的表达,而在端粒酶阴性的U2OS及PHF细胞组中没有观测到EGFP的表达;在端粒酶阳性的293FT、HepGⅡ和SGC7901细胞株中,Mod-hTERT启动子调控下的荧光素酶活性要高于WT-hTERT启动子组（P＜0.01）; 而在端粒酶阴性的U2OS细胞组中,Mod-hTERT启动子调控下的荧光素酶活性则低于WT-hTERT启动子组（P＜0.01); 在PHF细胞组中,Mod-hTERT启动子组与WT-hTERT启动子组的荧光素酶活性差异不显著(P＞0.05).研究提示,在3′端增加E-box元件可以提高核心hTERT启动子序列的肿瘤靶向转录活性.     

白蜡虫蜡花微生物多样性分析

【目的】探究白蜡虫Ericerus pela(Chavannes)雄若虫分泌的蜡花中微生物的多样性,比较不同厚度蜡花(随雄若虫发育蜡质层厚度增加)中细菌及真菌的种类和变化。【方法】采用Mi Seq高通量测序方法对不同发育阶段白蜡虫雄若虫分泌的蜡花中细菌16S rRNA和真菌ITS进行测序,利用Mothur软件计算蜡花中细菌和真菌的操作分类单元(operational taxonomic unit,OTU)及其丰富度、Alpha多样性分析。【结果】细菌3个样品共获470个OTU,真菌2个样品共获264个OTU。细菌共鉴定出18门30纲92科173属;真菌共鉴定出3门15纲43科68属。其中丛毛单胞菌属Comamonas细菌在蜡花中为优势菌,分别占前、中、后期雄若虫分泌的蜡花中细菌总量的79.79%,41.61%和46.86%;枝胞属Cladosporium在前期雄若虫分泌的蜡花中占真菌总量的17.01%,隐球菌属Cryptococcus在后期雄若虫分泌的蜡花中占真菌总量的60.84%,是蜡花中真菌重要组成部分。【结论】不同发育阶段雄若虫分泌的蜡花中细菌及真菌群落存在差异,随着蜡花厚度增加,细菌多样性先增加后减少,而真菌多样性降低。     

基于信息熵的蛋白质二级结构预测算法的准确性研究

蛋白质二级结构的预测可以采用建立数学模型,利用计算机来预测问题的解,然后再通过生物学实验来验证,这样可以节约大量的时间和精力,但是数学模型的预测效果如何,相当关键,文章提出基于信息熵的蛋白质二级结构预测算法的准确性评价方法,与现有方法相比,这种方法更全面,不仅能确定阳性率,假阴性率,还能确定预测值与实际值之间的不确定性的减少量。