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171.
We report that fluorescently tagged arabinogalactan glycosyltransferases target not only the Golgi apparatus but also uncharacterized smaller compartments when transiently expressed in Nicotiana benthamiana. Approximately 80% of AtGALT31A [Arabidopsis thaliana galactosyltransferase from family 31 (At1g32930)] was found in the small compartments, of which, 45 and 40% of AtGALT29A [Arabidopsis thaliana galactosyltransferase from family 29 (At1g08280)] and AtGlcAT14A [Arabidopsis thaliana glucuronosyltransferase from family 14 (At5g39990)] colocalized with AtGALT31A, respectively; in contrast, N‐glycosylation enzymes rarely colocalized (3–18%), implicating a role of the small compartments in a part of arabinogalactan (O‐glycan) biosynthesis rather than N‐glycan processing. The dual localization of AtGALT31A was also observed for fluorescently tagged AtGALT31A stably expressed in an Arabidopsis atgalt31a mutant background. Further, site‐directed mutagenesis of a phosphorylation site of AtGALT29A (Y144) increased the frequency of the protein being targeted to the AtGALT31A‐localized small compartments, suggesting a role of Y144 in subcellular targeting. The AtGALT31A localized to the small compartments were colocalized with neither SYP61 (syntaxin of plants 61), a marker for trans‐Golgi network (TGN), nor FM4‐64‐stained endosomes. However, 41% colocalized with EXO70E2 (Arabidopsis thaliana exocyst protein Exo70 homolog 2), a marker for exocyst‐positive organelles, and least affected by Brefeldin A and Wortmannin. Taken together, AtGALT31A localized to small compartments that are distinct from the Golgi apparatus, the SYP61‐localized TGN, FM4‐64‐stained endosomes and Wortmannin‐vacuolated prevacuolar compartments, but may be part of an unconventional protein secretory pathway represented by EXO70E2 in plants.   相似文献   
172.
173.
174.
偏头痛相关酶和KEGG通路分析   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
黄瑞  郑珩 《生物信息学》2014,12(3):218-226
搜集与偏头痛相关的编码酶的基因,利用KEGG通路分析目标基因的分布和功能,促进偏头痛遗传学研究和新药靶点研究。以"gene name"AND migraine检索PUBMED数据库,从原始文献中搜集并整理偏头痛相关酶基因数据,用DAVID在线分析工具对数据进行处理。搜索得到31个偏头痛酶基因,对7条KEGG代谢通路进行了分析:色氨酸代谢通路、酪氨酸代谢通路、精氨酸和脯氨酸代谢通路、叶酸一碳单位循环代谢通路、药物代谢通路、外源物质细胞色素P450代谢通路、肾素血管紧张素代谢通路。其中药物代谢通路包括9个药物,又以高选择性5-羟色胺重摄取抑制剂西酞普兰的应用前景最大。DDC、DBH、MTHFD1等6个偏头痛相关基因需要完善多态性研究。CYP450和单胺氧化酶在偏头痛的病理和治疗中都占有重要的地位。通过分析疾病相关酶基因的代谢通路,有助于了解疾病的分子病理基础,并为新药设计提供可靠靶点。  相似文献   
175.
免疫稳态的维持涉及多种细胞因子的基因表达调控,其中在转录后水平对mRNA稳定性的调控起重要作用。ARE(AU-rich element)位于mRNA 3'UTR(非编码区),富含AU碱基,某些RNA结合蛋白通过识别结合ARE影响mRNA的稳定性。本文综合最新研究,概述了TTP、HUR等RNA结合蛋白对mRNA稳定性的调节机制及其在信号通路中的作用。  相似文献   
176.
肿瘤细胞的一大重要特征是代谢水平的改变。戊糖磷酸途径作为细胞产生NADPH和五碳糖的主要通路,在肿瘤发生发展过程中发挥着重要功能。转酮酶是戊糖磷酸途径中的关键酶之一,越来越多的研究表明其与癌症病人预后具有显著相关性。作为肿瘤诊断、治疗的潜在靶标,转酮酶具有重要的研究价值。我们就目前癌症研究中对转酮酶的研究进展做简要综述。  相似文献   
177.
为了解环境胁迫对植物体中抗坏血酸含量及氧化还原状态的影响,以不同强度的冰冻和干旱两种胁迫为例,研究了它们对沈阳几种针叶树离体叶抗坏血酸、脱氢抗坏血酸含量以及抗坏血酸-谷胱甘肽循环中4种酶活性的影响.结果表明,两种胁迫达到一定强度后,都能使还原态抗坏血酸含量下降而使脱氢抗坏血酸含量上升.冰冻使抗坏血酸过氧化酶和单脱氢抗坏血酸还原酶活性下降.轻度失水使这两种酶活性上升,失水加重后转而趋于下降.脱氢抗坏血酸还原酶和谷胱甘肽还原酶活性对两种胁迫反应均不如前两种酶敏感.结合以前的研究结果,认为这一H2O2清除系统在导致驯化(acclimation)的轻度胁迫作用下可以得到加强,而当胁迫强度过大时则其清除能力下降并使组织受到伤害.文中还报告了沈阳几种针叶树抗寒性和针叶中抗坏血酸含量及上述4种酶活性之间的相关关系.  相似文献   
178.
A structurally unique aminoglycoside produced in Streptoalloteichus tenebrarius, Apramycin is used in veterinary medicine or the treatment of Salmonella, Escherichia coli, and Pasteurella multocida infections. Although apramycin was discovered nearly 50 years ago, many biosynthetic steps of apramycin remain unknown. In this study, we identified a HemK family methyltransferase, AprI, to be the 7’-N-methyltransferase in apramycin biosynthetic pathway. Biochemical experiments showed that AprI converted demethyl-aprosamine to aprosamine. Through gene disruption of aprI, we identified a new aminoglycoside antibiotic demethyl-apramycin as the main product in aprI disruption strain. The demethyl-apramycin is an impurity in apramycin product. In addition to demethyl-apramycin, carbamyltobramycin is another major impurity. However, unlike demethyl-apramycin, tobramycin is biosynthesized by an independent biosynthetic pathway in S. tenebrarius. The titer and rate of apramycin were improved by overexpression of the aprI and disruption of the tobM2, which is a crucial gene for tobramycin biosynthesis. The titer of apramycin increased from 2227 ± 320 mg/L to 2331 ± 210 mg/L, while the titer of product impurity demethyl-apramycin decreased from 196 ± 36 mg/L to 51 ± 9 mg/L. Moreover, the carbamyltobramycin titer of the wild-type strain was 607 ± 111 mg/L and that of the engineering strain was null. The rate of apramycin increased from 68% to 87% and that of demethyl-apramycin decreased from 1.17% to 0.34%.  相似文献   
179.
马铃薯块茎切片- 软腐病菌亲和互作过程中, 不同强度的亲和互作中活性氧的释放有其不同的特点。在强亲和互作中的24 小时内,无明显的活性氧释放。但在弱亲和互作中,互作8 小时后,即有明显的活性氧的释放,20 小时达到高峰,并且这种活性氧的释放提高寄主的抗病性。试验显示马铃薯块茎切片与软腐病菌的亲和互作诱导寄主抗氰交替途径的运行,SHAM 处理降低亲和互作过程中寄主的感病性, 同时SHAM 处理也促进亲和互作中寄主活性氧释放高峰的出现, 表明抗氰交替途径的运行可通过抑制亲和互作中寄主活性氧的产生而促进寄主的感病性。从而证明了一种新的寄主植物抗感病反应机制  相似文献   
180.
目的:研究β片层阻断肽H102对转基因AD小鼠脑内NF-κB通路相关蛋白活性及表达的影响。方法:将30只8周龄APP/PS1双转基因小鼠随机分为模型组和给药组,另选15只同周龄同背景的C57BL/6J小鼠设为对照组(n=15)。给药组每日经鼻腔给予H102溶液5 μl (5.8 mg/kg),对照组和模型组每日给予等量空白辅料溶液。给药16周后,采用Morris水迷宫检测小鼠的空间参考记忆变化,采用免疫组织化学方法和免疫印迹技术测定小鼠脑组织内β样淀粉样蛋白(Aβ1-42)、核因子-κB (NF-κB)、核因子-κB抑制蛋白(IκB)、IκB蛋白激酶(IKK)及其磷酸化蛋白(p-NF-κB、p-IκB、p-IKK)以及诱导型一氧化氮合酶(iNOS)和活化型半胱天冬酶-3(cleaved Caspase 3)蛋白的表达。结果:①Morris水迷宫测试:模型组小鼠的空间学习记忆能力较对照组显著降低,给药组较模型组显著提高(P<0.05)。②免疫组化及免疫印迹检测结果模型组小鼠脑组织内Aβ1-42、p-IKK、p-NF-κB、p-IκB、核内NF-κB及iNOS和cleaved Caspase 3蛋白的表达较对照组显著增高,给药组蛋白表达较模型组显著降低(P<0.05)。结论:H102可抑制APP/PS1双转基因小鼠脑内NF-κB信号转导通路,抑制细胞凋亡和炎症反应,明显改善转基因AD小鼠的学习记忆能力。  相似文献   
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