养分管理对农田土壤微生物量的影响

土壤微生物与土壤质量、健康、植物的生产力和农业的可持续发展密切相关。任何对土壤中微生物的扰动都可能影响土壤的长期生产力,并可能产生严重后果。大量研究结果表明,肥料类型、施肥处理年限长短、施肥水平高低及施肥措施都会造成土壤成分的变化,进而影响土壤中微生物的生长以及繁殖。简要介绍了微生物量的几种测定方法,综述了各种养分管理措施对农田生态系统中土壤微生物量的影响,从而了解土壤微生物因人类对土壤的利用而发生的变化,以期为农业的可持续发展和生态环境的保护提供理论依据。     

石油污染土壤生物降解生态条件研究

生物治理是石油污染土壤主要的有效的治理方法。微生物、污染物及环境等方面的因素都影响着生物降解效率。通过最佳生物降解条件的研究,提出了提高生物降解效率的措施。     

呼吸道感染病原菌分析

目的 了解老年人院内呼吸道感染与非老年人呼吸道感染病原菌分布情况。方法 回顾性调查１９９８年１月至１２月老年人院内呼吸道感染（老年组）的２８５份痰标本和同时期非老年人呼吸道感染（非老年组,含门诊和住院）的１１９２份痰标本的培养情况。结果 老年组阳性率为８９．１％（２５４／２８５）,其中２２份标本为混合感染,共检出病原菌２７６株,以非发酵菌占绝对优势（９７．８％）;非老年组阳性率为４０．３％（４８０／１１９２）,病原菌无明显集中趋势,非发酵菌２８．３％,肠杆菌科２３．８％,革兰阳性菌２５．０％,真菌２２．９％。结论 老年组阳性率明显高于非老年组（Ｘ＾２＝２１９．６,Ｐ〈０．００５）,病原菌以非发酵菌为主,非老年组病原菌各科细菌所占比例无明显差异,引起呼吸道感染的病原菌主要为条件致病菌。     

抑制差减杂交筛选禽致病性大肠杆菌基因组差异片段及其分析

采用抑制差减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)对禽致病性大肠杆菌E037株(血清型O78)与非致病菌株K-12MG1655以及同一O2血清型高致病菌株E058与低致病菌株E526进行基因组差异片段克隆与分析。从E037株中共检出17个特异性差异片段,E058株中共检出32个特异性差异片段。经同源分析,这些序列可分为4类:质粒相关序列、噬菌体相关序列、已知功能序列、未知功能序列。这些差异片段包含许多重要的大肠杆菌毒力相关基因,如大肠杆菌素、气杆菌素受体、铁基因簇等。49个片段中,14个片段与其它微生物基因组同源性较高。结果表明,大肠杆菌高致病株与低致病菌株或非致病菌株基因组间存在较多差异基因,其中包括毒力、毒力相关基因、代谢以及噬菌体等基因成分。     

光钳操纵生物活体的动态监测技术的研究

采用摄像、录像和视屏监控系统及显色偏振装置与光钳系统耦合,从空间分辨、色分辨和时间分辨多方面改善系统品质,实现了光钳捕获与操纵生物活体的动态监测、实时记录、资料保存和屏幕再现的功能,并能测量光钳操纵细胞的位移量和由此计算操纵速度,提高了光钳的自我调整和光钳操纵细胞的精细度。本研究为激光光钳技术在细胞工程等方面的应用研究提供了行之有效的技术手段。     

利用微生物重组技术促进羰基不对称还原研究进展

手性醇是许多手性药物合成的关键手性砌块,利用微生物细胞催化相应前手性羰基化合物不对称还原,是合成手性醇的重要方法之一。但应用野生微生物催化时,反应的时空产率、立体选择性较低。详细介绍了利用微生物重组技术以促进前手性羰基化合物不对称还原反应合成手性醇的国内外研究进展。从酶的种类、表达系统以及辅酶再生系统3个方面对重组细胞催化反应体系的构建进行了概述。同时按照反应底物的类型,对重组微生物在催化不同类型羰基化合物不对称还原合成手性醇中的应用分别进行了归纳和介绍。     

Characterization of Lipids and Proteins Associated to the Cell Wall of the Acapsular Mutant Cryptococcus neoformans Cap 67

Cryptococcus neoformans is an opportunistic human pathogen that causes life‐threatening meningitis. In this fungus, the cell wall is exceptionally not the outermost structure due to the presence of a surrounding polysaccharide capsule, which has been highly studied. Considering that there is little information about C. neoformans cell wall composition, we aimed at describing proteins and lipids extractable from this organelle, using as model the acapsular mutant C. neoformans cap 67. Purified cell wall preparations were extracted with either chloroform/methanol or hot sodium dodecyl sulfate. Total lipids fractionated in silica gel 60 were analyzed by electrospray ionization tandem mass spectrometry (ESI‐MS/MS), while trypsin digested proteins were analyzed by liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC‐MS/MS). We detected 25 phospholipid species among phosphatidylcholine, phosphatidylethanolamine, phosphatidylserine, phosphatidylinositol, and phosphatidic acid. Two glycolipid species were identified as monohexosyl ceramides. We identified 192 noncovalently linked proteins belonging to different metabolic processes. Most proteins were classified as secretory, mainly via nonclassical mechanisms, suggesting a role for extracellular vesicles (EV) in transwall transportation. In concert with that, orthologs from 86% of these proteins have previously been reported both in fungal cell wall and/or in EV. The possible role of the presently described structures in fungal–host relationship is discussed.     

具有抑菌作用的放线菌GNF1的分离鉴定和生物学活性的研究

从几种复合微生物有机肥中分离出一系列不同的菌株,与实验室保存的菌株GNW(自生固氮菌)和HP2(解磷菌)混合接种培养,检测是否因基因杂交、突变等原因而产生具有抑菌作用的菌株.结果分离出一株具有抑菌作用的放线菌菌株GNF1,根据其形态学特征、生理生化特征和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析结果,鉴定其属于链霉菌属(Streptomyces)的一个菌株,GNF1菌株的代谢产物中存在具有抑菌作用的活性成分,与植物根际促生菌GNW、HP2以及某些原核病原微生物共培养培养时能明显抑制它们的生长.     

互花米草入侵对土壤生态系统的影响

互花米草是全球海岸滩涂湿地生态系统最成功的入侵植物之一,对中国沿海湿地土壤生态系统也产生了重大影响.本文主要从入侵地土壤生态系统的结构组分(土壤微生物和土壤动物)与物质循环(土壤碳循环、氮循环、磷循环和重金属元素)两大方面,综述了近年来国内外互花米草入侵对沿海滩涂与河口地区土壤生态系统的影响.此外,本文还指出了未来互花米草的研究方向,包括加强互花米草对入侵地土壤微生物的影响的研究,整合互花米草对地上、地下资源竞争和生态过程影响的研究,以及互花米草在全球变化大背景下入侵动态预测.     

基因组数据库简介

本文以北京大学生物信息中心安装的3个国际著名基因组数据库GDB、GenoList和Ensembl为基础,介绍目前常用的基因组数据库,包括这些数据数据库的内容、数据格式、使用方法,以及用于构建上述数据库的数据库管理系统。 Abstract:A brief introduction to the genome databases GDB,GenoList and Ensembl is given.These databases,mirrored and maintained at the Centre of Bioinformatics,Peking University,provide useful information for genome research.