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An entropy-based statistic TPE has been proposed for genomic association study for disease-susceptibility locus.The statistic TPE may be directly adopted and/or extended to quantitative-trait locus (QTL)mapping for quantitative traits.In this article,the statistic TPE was extended and applied to quantitative trait for association analysis of QTL by means of selective genotyping.The statistical properties (the type I error rate and the power) were examined under a range of parameters and population-sampling strategies (e.g.,various genetic models,various heritabilities,and various sample-selection threshold values) by simulation studies.The results indicated that the statistic Tee is robust and powerful for genomic association study of QTL.A simulation study based on the haplotype frequencies of 10 single nucleotide polymorphisms (SNPs) of angiotensin-I converting enzyme genes was conducted to evaluate the performance of the statistic TPE for genetic association study. 相似文献
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为初步探讨园蛛总科内网型不同的蜘蛛间分子系统发生关系,测定了9种蜘蛛核18S rRNA基因的部分序列。联合GenBank中的2种蜘蛛18S rRNA基因序列数据,用NJ法、MP法和ML法重建分子系统树,结果表明:(1)织圆网的园蛛科和肖蛸科蜘蛛在园蛛总科中不是姊妹群;(2)不织圆网的球蛛科和皿蛛科也不是单系发生,证实了皿蛛片网和球蛛网独立起源的观点;(3)皿蛛科蜘蛛的分子系统发生地位与肖蛸科较近、而与园蛛科较远,这表明皿蛛科和园蛛科问雄性触肢结构的相似性很可能是类似而不是同源相似。 相似文献
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为了寻找降血胆固醇药物,我们对十余种雌酮衍生物在大鼠中进行了筛选。初筛中发现16,17-吡唑雌酮(16,17-PES)降血胆固醇作用比较明显,而对动物体重影响不大。进一步研究的结果表明,16,17-PES 无论经口服或注射给药都能显著降低膳食性高血脂症大鼠的血胆固醇,β-脂蛋白及β-脂蛋白胆固醇含量,在雄鼠中,16,17-PES 皮下给药的降血脂作用与同等剂量雌酮的作用相当;而在雌鼠中,16-17-PES 皮下注射的效果却比雌酮强。在控制大鼠每日摄入等量饲料的情况下,16,17-PES 仍可显著降低血液和肝脏总胆固醇含量。16,17-PES 口服或肌肉注射给药的雌激素活性分别约相当于雌酮的1/3或1/15。长期注射小剂量的16,17-PES,对大鼠及犬的一般活动、食量、体重、血相,肝及肾功能均无明显影响。总的说来,16,17-PES 是一种对大鼠有明显降高血脂作用而雌激素活性和毒性均较微弱的化合物。 相似文献
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Wei LI Yuan-ying SHEN Xuan-rong ZHANG Lai-feng REN Qiang LI Ru SHEN Hai-ping ZHAO 《Virologica Sinica》2008,23(1):57-62
To investigate the distribution of hepatitis B virus (HBV) genotypes and subgenotypes among the Bai nationality in Dali, a total of 100 serum samples from patients with chronic HBV-infection were collected for the detection of HBV genotypes and subgenotypes by genotype-specific primers and restriction fragment length polymorphism (RLFP), respectively. Among the 100 samples, the proportions of genotype B, C and mixed genotype (B+C) were 41%, 25% and 34%, respectively. All the genotype B strains belonged to subgenotype Ba In genotype C, 84% were Subgenotype Cs and 12% were subgenotype Ce. The distribution of genotypes B, C and B+C showed no significant difference between male and female patients (P=0.182) and among the age groups of patients (P=0.812). The rates of HBeAg/HBeAg positivity were no significantly different among genotypes B, genotype C and mixed genotype (B+C) (P=0.077/P=0.663). In Dali, genotypes B, B+C and C existed among Bai nationality with chronic HBV-infection, and genotype B was the major genotype. Subgenotypes Ba and Cs were the predominant strains in patients with HBV genotype B/C infection. The most prominent characteristic was the higher prevalent rate of mixed genotype (B+C) in patients. 相似文献
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[目的]在马铃薯基因组水平上鉴定木质形成素类蛋白(Xylogen-like protein, XYLP)基因家族,分析其理化性质及基因的表达模式。[方法]用生信学方法鉴定马铃薯XYLPs,分析其理化性质、亚细胞定位、进化关系、蛋白质结构、基因结构和染色体定位。利用芯片数据分析马铃薯StXYLPs的时空表达模式及对非生物胁迫的响应。[结果]马铃薯中共有20个StXYLPs;蛋白全长在139~221氨基酸之间,理论等电点在4.36~9.42之间,均锚定在质膜上;蛋白质结构基本相似,均具有保守的nsLTP结构域;StXYLPs在染色体上的定位具有偏好性;StXYLPs具有明显差异的组织表达模式,响应不同的非生物胁迫。[结论]StXYLPs与生长素、细胞分裂素和赤霉素共同调控马铃薯器官发育,19个StXYLPs表达受调控。12个StXYLPs受ABA诱导表达上调,在盐、高温及干旱胁迫下,14个StXYLPs受诱导表达上调,参与对抗非生物胁迫。 相似文献
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