Non-histone protein methylation in Trypanosoma cruzi epimastigotes

Post-translational methylation of proteins, which occurs in arginines and lysines, modulates several biological processes at different levels of cell signaling. Recently, methylation has been demonstrated in the regulation beyond histones, for example, in the dynamics of protein-protein and protein-nucleic acid interactions. However, the presence and role of non-histone methylation in Trypanosoma cruzi, the etiologic agent of Chagas disease, has not yet been elucidated. Here, we applied mass spectrometry-based-proteomics (LC-MS/MS) to profile the methylproteome of T. cruzi epimastigotes, describing a total of 1252 methyl sites in 824 proteins. Functional enrichment and protein-protein interaction analysis show that protein methylation impacts important biological processes of the parasite, such as translation, RNA and DNA binding, amino acid, and carbohydrate metabolism. In addition, 171 of the methylated proteins were previously reported to bear phosphorylation sites in T. cruzi, including flagellar proteins and RNA binding proteins, indicating that there may be an interplay between these different modifications in non-histone proteins. Our results show that a broad spectrum of functions is affected by methylation in T. cruzi, indicating its potential to impact important processes in the biology of the parasite and other trypanosomes.     

Enrichment of homoacetogens converting H2/CO2 into acids and ethanol and simultaneous methane production

An anaerobic granular sludge was enriched to utilize H₂/CO₂ in a continuous gas-fed up-flow anaerobic sludge reactor by applying operating conditions expected to produce acetic acid, butyric acid, and ethanol. Three stages of fermentation were found: Stage I with acetic acid accumulation with the highest concentration of 35 mM along with a pH decrease from initial 6 to 4.5. In Stage II, H₂/CO₂ was replaced by 100% H₂ to induce solventogenesis, whereas butyric acid was produced with the highest concentration of 2.5 mM. At stage III with 10 µM tungsten (W) addition, iso-valeric acid, valeric acid, and caproic acid were produced at pH 4.5–5.0. In the batch tests inoculated with the enriched sludge taken from the bioreactor (day 70), however, methane production occurred at pH 6. Exogenous 15 mM acetate addition enhanced both the H₂ and CO₂ consumption rate compared to exogenous 10, 30, and 45 mM acetate by the enriched sludge. Exogenous acetate was failed to be converted to ethanol using H₂ as electron donor by the enriched acetogens.     

Membrane inlet—ion mobility spectrometry with automatic spectra evaluation as online monitoring tool for the process control of microalgae cultivation

The cultivation of algae either in open raceway ponds or in closed bioreactors could allow the renewable production of biomass for food, pharmaceutical, cosmetic, or chemical industries. Optimal cultivation conditions are however required to ensure that the production of these compounds is both efficient and economical. Therefore, high-frequency analytical measurements are required to allow timely process control and to detect possible disturbances during algae growth. Such analytical methods are only available to a limited extent. Therefore, we introduced a method for monitoring algae release volatile organic compounds (VOCs) in the headspace above a bioreactor in real time. This method is based on ion mobility spectrometry (IMS) in combination with a membrane inlet (MI). The unique feature of IMS is that complete spectra are detected in real time instead of sum signals. These spectral patterns produced in the ion mobility spectrum were evaluated automatically via principal component analysis (PCA). The detected peak patterns are characteristic for the respective algae culture; allow the assignment of the individual growth phases and reflect the influence of experimental parameters. These results allow for the first time a continuous monitoring of the algae cultivation and thus an early detection of possible disturbances in the biotechnological process.     

pH对灵芝液态发酵代谢物及抗氧化活性的影响

已有研究报道灵芝栽培生长的最适pH在中性偏酸环境,在碱性范围的生长及代谢情况鲜见报道。本研究主要探究广泛pH对灵芝液态发酵代谢物及其抗氧化活性的影响。采用摇瓶液态培养后分析代谢物中灵芝三萜、胞内外多糖、菌丝体蛋白及抗氧化活性等指标,系统比较灵芝菌丝体在pH值2-11的生长和代谢情况。研究结果表明,灵芝菌丝体生长、合成灵芝三萜、胞内多糖、30E胞外多糖、菌丝体蛋白和菌丝体水解氨基酸的最适pH值分别为10、3、2、7、2和2。对应结果分别为17.13 g/L、33.86 mg/g、72.73 mg/g、7.86 g/L、71.42 mg/g和107.10 mg/g。比对照分别提高28.5%、77.3%、22.4%、96.5%、97.1%和70.8%。胞内多糖组分1和组分2最高分子量均在初始pH 4,分别为1.016×10⁸ g/mol和9.280×10⁴ g/mol,胞外多糖组分1最高分子量在初始pH 10,为4.946×10⁶ g/mol;对菌丝体的总抗氧化能力、1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(1,1-diphenyl-2- picrylhydrazyl,DPPH)自由基清除能力、羟自由基清除能力分析结果表明最佳的初始pH分别为3、7、9。本研究为液态发酵方式下灵芝生长及其代谢物定向调控发酵的工艺优化提供参考依据,同时发现灵芝菌丝体中优质蛋白及抗氧化活性可在功能性食品和化妆品领域推广应用。     

吸烟对种植体周围炎患者龈下菌群、龈沟液炎症因子和RANKL/OPG比值的影响

摘要 目的：探讨吸烟对种植体周围炎患者龈下菌群分布、龈沟液炎症因子白细胞介素-4（IL-4）、白细胞介素-5（IL-5）、白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-8（IL-8）、白细胞介素-17（IL-17）和核因子-κB受体活化因子配体/骨保护素（RANKL/OPG）比值的影响。方法：选择2019年3月至2022年3月首都医科大学附属北京友谊医院口腔科收治的种植体周围炎患者99例（共151颗种植体）,根据是否吸烟分为吸烟组（45例,68颗种植体）和非吸烟组（54例,83颗种植体）,比较两组患者种植体牙周改良菌斑指数（mPLI）、牙龈出血指数（GBI）、种植体周围探诊深度（PPD）,采集两组龈下菌斑进行细胞培养并进行菌种鉴定,分析两组龈下菌群分布情况,比较两组龈沟液中IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-17、RANKL/OPG比值。结果：吸烟组mPLI、GBI、PPD高于不吸烟组（P＜0.05）。吸烟组厌氧菌检出率高于非吸烟组（P＜0.05）,有益菌检出率低于非吸烟组（P＜0.05）,两组需氧菌检出率比较差异无统计学意义（P＞0.05）。吸烟组龈沟液IL-4、IL-5、IL-6、IL-8、IL-17水平均高于非吸烟组（P＜0.05）。吸烟组龈沟液RANKL水平、RANKL/OPG比值高于非吸烟组（P＜0.05）,OPG水平低于非吸烟组（P＜0.05）。结论：吸烟可导致种植体周围炎患者龈下厌氧菌增加,加重炎症反应,增加牙槽骨吸收风险。     

2型糖尿病伴慢性牙周炎患者龈沟液Omentin-1、MMP-9、OPG/RANKL比值与牙周指标、氧化应激和NLRP3炎症小体的关系

摘要 目的：探讨2型糖尿病（T2DM）伴慢性牙周炎（CP）患者龈沟液网膜素-1（Omentin-1）、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）、骨保护素（OPG）/细胞核因子κB受体活化因子配体（RANKL）比值与牙周指标、氧化应激和核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白3（NLRP3）炎症小体的关系。方法：选择2020年6月至2022年6月首都医科大学附属北京康复医院收治的73例T2DM患者（T2DM组）,77例CP患者（CP组）,83例T2DM伴CP患者（T2DM伴CP组）。检测所有患者龈沟液中Omentin-1、MMP-9、OPG/RANKL比值,分析其与牙周指标、氧化应激和NLRP3炎症小体相关分子信使核糖核酸（mRNA）表达的相关性。结果：T2DM伴CP组龈沟液中Omentin-1,OPG/RANKL比值、总抗氧化能力（TAC）、超氧化物歧化酶（SOD）低于T2DM组和CP组（P＜0.05）,MMP-9、丙二醛（MDA）、NLRP3mRNA、凋亡相关斑点样蛋白（ASC）mRNA、半胱氨酸蛋白酶-1（caspase-1）mRNA表达以及出血指数（SBI）、菌斑指数（PLI）、牙周袋探诊深度（PD）、附着丧失（AL）高于T2DM组和CP组（P＜0.05）。T2DM伴CP患者龈沟液中Omentin-1、OPG/RANKL比值与TAC、SOD呈正相关（P＜0.05）,与MDA、NLRP3mRNA、ASC mRNA、caspase-1mRNA表达以及PLI、SBI、AL、PD呈负相关（P＜0.05）,MMP-9与TAC、SOD呈负相关（P＜0.05）,与MDA、NLRP3mRNA、ASC mRNA、caspase-1mRNA表达以及PLI、SBI、AL、PD呈正相关（P＜0.05）。结论：T2DM伴CP患者龈沟液中Omentin-1水平、OPG/ RANKL比值降低,MMP-9水平升高,与牙周组织破坏加重、氧化应激、NLRP3炎症小体激活有关。     

原发性肾病综合征合并血栓栓塞的临床研究

摘要 目的：肺栓塞及下肢深静脉血栓是影响肾病综合征(Nephrotic Syndrome,NS)预后的重要因素,但在其发生率以及治疗方面仍存在争议。本文将通过回顾性的病例研究对NS患者中血栓栓塞事件的发生率、危险因素以及是否需要早期干预等问题进行探讨。方法：收集上海交通大学医学院附属新华医院肾内科2014年1-12月诊断为原发性NS患者,并同时收集患者基本临床信息,血栓检查结果以及NS相关血液及尿液检查结果等在内的临床资料,采用多种统计方法分析血栓发生率及其危险因素,并进一步讨论NS患者的预防性抗凝措施。结果：NS患者下肢静脉血栓或肺栓塞的发生率均为15.4%,两种血栓同时发生的概率为9.6%。NS患者血栓事件的发生率与D-二聚体、血浆白蛋白、病程、病理类型呈明显相关,且具有统计学意义。结论：NS患者血栓栓塞的发生率与D-二聚体、血浆白蛋白、病程、病理类型呈显著相关,膜性肾病患者血栓栓塞发生率最高。如NS患者合并高危因素,建议定期筛查,综合评估后预防性抗凝。     

肝细胞癌组织miR-124-3p、miR-212-5p表达与PI3K/Akt信号通路和预后的关系研究

摘要 目的：探讨肝细胞癌组织中微小核糖核酸（miR）-124-3p、miR-212-5p表达与磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）信号通路和预后的关系。方法：选择2017年9月至2019年9月徐州医科大学附属医院肝胆外科收治的93例肝细胞癌患者,采用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）检测肝细胞癌组织中miR-124-3p、miR-212-5p、PI3K 信使RNA（mRNA）、Akt mRNA的表达。Pearson相关性分析miR-124-3p、miR-212-5p表达与PI3K/Akt信号通路相关mRNA表达的相关性。绘制Kaplan-Meier生存曲线,Log-Rank检验不同miR-124-3p、miR-212-5p表达肝细胞癌患者3年总生存率（OS）的差异。结果：肝细胞癌组织中miR-124-3p表达低于癌旁组织（P＜0.05）,miR-212-5p、PI3K mRNA、Akt mRNA表达高于癌旁组织（P＜0.05）。肝细胞癌组织中miR-124-3p表达与PI3K mRNA、Akt mRNA表达呈负相关（P＜0.05）,miR-212-5p表达与PI3K mRNA、Akt mRNA表达呈正相关（P＜0.05）。Ⅱa期、低分化患者肝细胞癌组织中miR-124-3p表达低于Ⅰa-Ⅰb期、中高分化患者（P＜0.05）,miR-212-5p表达高于Ⅰa-Ⅰb期、中高分化患者（P＜0.05）。随访期间死亡37例, miR-124-3p低表达组3年OS为42.55%,低于miR-124-3p高表达组的78.26%（P＜0.05）,miR-212-5p高表达组3年OS为50.00%,低于miR-212-5p低表达组的71.11%（P＜0.05）。结论：肝细胞癌组织中miR-124-3p表达下调,miR-212-5p表达上调,且与肝细胞癌PI3K/Akt信号通路激活,PI3K mRNA和Akt mRNA高表达,低分化,CNLC分期Ⅱa期以及低OS有关。     

OSBPL3在代谢相关脂肪性肝病中的作用及机制研究

摘要 目的：探究氧化固醇结合蛋白类似物3（Oxysterol Binding Protein-like 3,OSBPL3）在代谢相关脂肪性肝病中的作用及可能机制。方法：建立肝脏特异性沉默OSBPL3小鼠模型和空载体对照组,分别予以普食和高脂喂养12周。分为正常对照组、OSBPL3沉默组、肥胖对照组、肥胖OSBPL3沉默组。观察小鼠一般情况,Real-time PCR检测脂质合成基因及脂质分解基因mRNA水平,western blot检测Akt/mTOR通路关键蛋白的表达。人HepG2细胞株给予不同浓度油酸（oleic acid,OA）处理,观察油红O染色的变化,western blot检测OSBPL3表达水平。结果：正常对照组与OSBPL3沉默组小鼠各项指标相比无统计学差异（P＞0.05）;与对照组相比,肥胖对照组及肥胖OSBPL3沉默组体质量、内脏脂肪及内脏脂肪指数较高（P＜0.05）;与肥胖对照组相比,肥胖OSBPL3沉默组体质量、内脏脂肪及内脏脂肪指数较低（P＜0.05）。与对照组相比,肥胖对照组及肥胖OSBPL3沉默组总胆固醇(Total cholesterol,TC)、甘油三酯(triglycerides,TG)、高密度脂蛋白胆固醇(high density lipoprotein cholesterol,HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-C)较高（P＜0.05）;与肥胖对照组相比,肥胖OSBPL3沉默组TC、TG、LDL-C及HDL-C较低（P＜0.05）。与正常对照组与OSBPL3沉默组小鼠SREBP-1C、FAS及PPARα表达水平相比无统计学差异（P＞0.05）;与对照组相比,肥胖对照组及肥胖OSBPL3沉默组SREBP-1C、FAS较高,PPARα表达水平较低（P＜0.05）;与肥胖对照组相比,肥胖OSBPL3沉默组SREBP-1C、FAS表达水平较低,PPARα表达水平较高（P＜0.05）。与对照组相比,肥胖对照组Akt及mTOR磷酸化表达水平较高（P＜0.05）;与肥胖对照组相比,肥胖OSBPL3沉默组Akt及mTOR磷酸化表达水平较低（P＜0.05）。随着OA作用浓度的升高,油红O染色逐渐加深。与0 μmol/L油酸相比,油酸以剂量依赖性方式增加HepG2细胞OSBPL3 mRNA水平（P<0.05）。结论：OSBPL3能够调控脂质代谢的表达,可能通过调控Akt/mTOR信号通路发挥生物学功能,有望为研究NAFLD疾病发生发展及治疗提供参考依据。     

宫颈癌组织miR-200b-5p、miR-424-5p表达与临床病理特征、PI3K/AKT/mTOR信号通路和预后的关系研究

摘要 目的：探讨宫颈癌组织微小核糖核酸（miRNA）-200b-5p、miR-424-5p表达与临床病理特征、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（PI3K/AKT/mTOR）信号通路和预后的关系。方法：选取2016年7月～2019年6月西安市中心医院收治的123例宫颈癌患者,采用定量聚合酶链式反应（qPCR）检测癌组织与癌旁组织中miR-200b-5p、miR-424-5p、PI3K信使RNA（mRNA）、AKT mRNA、mTOR mRNA表达。分析miR-200b-5p、miR-424-5p表达与PI3K mRNA、AKT mRNA、mTOR mRNA表达的相关性及与临床病理特征的关系。采用K-M法绘制不同miR-200b-5p、miR-424-5p表达宫颈癌患者生存曲线。结果：与癌旁组织比较,宫颈癌组织中miR-200b-5p、miR-424-5p表达降低,PI3K mRNA、AKT mRNA、mTOR mRNA表达升高（P＜0.05）。Pearson相关性分析显示,宫颈癌组织中miR-200b-5p、miR-424-5p表达与PI3K mRNA、AKT mRNA、mTOR mRNA表达均呈负相关,PI3K mRNA、AKT mRNA、mTOR mRNA表达呈两两相关（P＜0.05）。miR-200b-5p、miR-424-5p表达与宫颈癌分化程度、国际妇产科联盟（FIGO）分期和淋巴结转移有关（P＜0.05）。随访3年,123例宫颈癌患者累积生存率为62.60%（77/123）。K-M生存曲线分析显示,miR-200b-5p、miR-424-5p高表达组累积生存率分别高于miR-200b-5p、miR-424-5p低表达组（P＜0.05）。结论：宫颈癌组织中miR-200b-5p、miR-424-5p低表达,与分化程度、FIGO分期、淋巴结转移、PI3K/AKT/mTOR信号通路和预后有关。