黄海和东海小黄鱼遗传多样性的RAPD分析

小黄鱼（Pseudosciaena polyactis）是我国近海重要经济鱼类之一。本文分析了采自黄海和东海5个海区共计48个个体小黄鱼的随机扩增DNA多态性（RAPD）。从40个10 bp引物中选取20个用于群体遗传多样性分析,共检测出145个位点,其中132个（91.03%） 显多态性。用Shannon多样性指数量化的平均遗传多态度为1.93（1.50～2.44）,群体内和群体间的遗传变异比例分别为69%和31%;群体间的平均遗传相似度和遗传距离分别为0.9139和0.0861。用非加权配对算数平均法（UPGMA）聚类分析的结果表明,所分析的5个群体可分为3个地理群系,从分子水平上支持了过去有关学者把黄海和东海的小黄鱼划分为北、中、南3个地理群系的观点。     

不同地理种群羊草分子水平上生态型分化的研究

将来自内蒙古不同地区及吉林盐碱地的羊草（Ｌｅｙｍｕｓ ｃｈｉｎｅｎｓｉｓ）种子同时栽培于校园,以５个样点（阿旗定位站、西乌旗、谢尔塔拉、吉林）的羊草幼叶为材料,选用２０个随机短引物（１００ｎｔ）进行了ＤＮＡ随机扩增,共计获得１００个多态性片段。所得ＲＡＰＤ数据利用自编的计算机软件进行聚类分析、构建分子进行树,结果表明：定位站和西乌旗遗传距离最近,应为同一生态型;而吉林和谢尔塔拉分属不同生态型;阿旗     

基于线粒体COI基因的中国西南地区木领针蓟马地理种群的遗传分化分析

【目的】木领针蓟马Helionothrips mube近年来成为芋头Colocasia esculenta上的一种常见害虫。本研究旨在探讨其中国西南地区地理种群间的遗传变异。【方法】通过Sanger法测定了21个地理种群132头木领针蓟马的线粒体COI基因序列,利用MEGA, DnaSP, Arlequin和Network等软件对木领针蓟马种群间的遗传多样性、遗传分化、分子变异等进行分析。【结果】获得的木领针蓟马132条线粒体COI序列(643 bp)中共发现34个变异位点、16种单倍型,其中单倍型H1出现频率最高、分布最广。木领针蓟马总群体的遗传多样性较高(Hd=0.712, Pi=0.00413, K=2.655),遗传分化程度极大(Fst=0.3443),基因交流水平不高(Nm=0.96)。分子方差分析(AMOVA)表明,木领针蓟马的遗传分化主要来自种群内部,Mantel检测出种群地理距离与遗传距离呈正相关。总群体中性检验Tajima’s D值显著负值,Fu’s Fs值不显著,错配分布曲线呈多峰。综合种群间遗传距离、单倍型系统发育树及中介网络图结果,表明四川成都(CHD)、云南昌宁(CHN)和贵州遵义(ZY)3个种群的遗传分化程度均高于其他种群。【结论】中国西南地区木领针蓟马总群体的遗传多样性较高,遗传分化明显,种群间的基因交流受到地理距离的影响,总群体在较近的历史时期内没有出现扩张现象。     

不同种源羊草的SOD、POD的活性及丙二醛含量的比较

 本文将内蒙古不同种源的羊草(Leymus chinensis)进行PEG水分胁迫处理后,分别进行POD和SOD的酶活性及MDA含量的测定,并算出各浓度梯度和时间梯度下的增量。并把POD、SOD及MDA的测试结果及其浓度梯度和时间梯度下的增量用NTS软件进行聚类分析,发现不同种源羊草的SOD、POD对PEG水分胁迫在时间和浓度上的反应是不同的,且植物体内MDA的积累量也是不同的,聚类分析进一步表明不同地理种群羊草按POD和SOD的酶活及MDA含量都可分成3大类,且所得结果相同,这与它们对各自自然生境的适应也是一致的。     

中国与北美大陆的高卢蜜环菌系统发育分析

在中国和北美大陆分别收集53和15株高卢蜜环菌Armillaria gallica菌株,并用ISSR（inter-simple sequence repeat）分子标记对这些菌株进行了亲缘关系及系统发育分析。结果表明：中国和北美大陆的A. gallica因地理隔离产生明显的遗传分异,在系统发育树上分别形成了各自的进化分支;北美大陆的分支内部遗传分化尚不明显,而中国的进化分支遗传分化程度相对较大且更为古老,中国菌株可能是两个大陆A. gallica的祖先株系。     

Host and geographic barriers shape the competition,coexistence, and extinction patterns of influenza A (H1N1) viruses

The influenza virus mutates and spreads rapidly, making it suitable for studying evolutionary and ecological processes. The ecological factors and processes by which different lineages of influenza compete or coexist within hosts through time and across geographical space are poorly known. We hypothesized that competition would be stronger for influenza viruses infecting the same host compared to different hosts (the Host Barrier Hypothesis), and for those with a higher cross‐region transmission intensity (the Geographic Barrier Hypothesis). Using available sequences of the influenza A (H1N1) virus in GenBank, we identified six lineages, twelve clades, and several replacement events. We found that human‐hosted lineages had a higher cross‐region transmission intensity than swine‐hosted lineages. Co‐occurrence probabilities of lineages infecting the same host were lower than those infecting different hosts, and human‐hosted lineages had lower co‐occurrence probabilities and genetic diversity than swine‐hosted lineages. These results show that H1N1 lineages infecting the same host or with high cross‐region transmission rates experienced stronger competition and extinction pressures than those infecting different hosts or with low cross‐region transmission. Our study highlights how host and geographic barriers shape the competition, extinction, and coexistence patterns of H1N1 lineages and clades.     

基于核密度估计的动物生境适宜度制图方法

生境适宜度制图能提供动物适宜生境的空间分布信息,对野生动物种群管理、保护地规划等非常重要。生境适宜度制图的关键是构建生境适宜度模型(habitat suitability model, HSM),只基于动物出现位置数据构建HSM的方法在实践中得到了非常广泛的应用。然而现有的只基于动物出现位置数据构建HSM的方法还不能很好地直接表达动物生境适宜度和环境因子之间具有生态学意义的数量关系,因此也就不能很好地体现环境因子对动物生境利用的生态学作用。 本文提出了一种基于核密度估计构建HSM的方法,在地理信息系统技术支持下,通过运用核密度估计从代表性的动物出现位置数据中估计出动物出现对各个环境因子的概率密度函数来直接表达生境适宜度与各个环境因子之间的数量关系,以体现环境因子对动物生境利用的生态学作用,在此基础上对生境适宜度与各个环境因子之间的数量关系进行综合构建了具有明确生态学意义的HSM用于动物生境适宜度制图。以美国Voyageures国家公园的白尾鹿(Odocoileus virginianus)生境适宜度制图为例,基于365个出现位置点位数据并结合积雪深度、地表覆被类型、森林边界长度和坡度等环境因子数据,开展了该方法的案例研究。通过交叉验证计算连续Boyce指数对制图结果进行评价,结果表明：基于核密度估计方法构建的HSM预测能力强,所得出的生境适宜度图经10次交叉验证,连续Boyce指数平均值为0.75,标准差为0.11,达到了较高精度。此外,由于基于核密度估计的方法能以“生境适宜度和环境因子之间具有生态学意义的数量关系”的形式来直接体现环境因子对动物生境利用的生态学作用,就模型的可解释性而言,该方法要优于现有的其他构建HSM的方法。     

内蒙古中东部不同草原地带羊草种群遗传分化

运用 RAPD技术对内蒙古不同草原地带分布的 5个羊草种群 (共 10 0个个体 )的遗传多样性进行分析。 31个随机引物(10 nt)在 5个羊草种群中共检测到 4 96个扩增片断 ,其中多态性片断 4 89个 ,总的多态位点百分率达 98.6 %。利用 Nei指数和Shannon指数估算了 5个种群的遗传多样性 ,并计算种群相似系数和遗传距离运用 UPGMA法进行聚类分析。结果表明 :无论是种群内还是种群间 ,羊草均存在较高的遗传变异 ,大部分的遗传变异存在于种群内 (Nei指数和 Shannon指数估算结果分别为 85 .4 %和 72 .5 % ) ,只有少部分的遗传变异存在于种群间 ;不同种群的遗传多样性存在差异 ,各种群的遗传多样性与其所处的地理位置具有显著的相关性 ;5个种群的平均遗传距离为 0 .5 0 95 ,变异范围为 0 .4 6 84～ 0 .5 4 76 ;聚类分析结果显示地理距离较近的种群遗传距离较小 ,首先聚在一起 ,而地理距离较远的种群遗传距离较大 ,说明羊草种群间的遗传分化与地理距离存在一定相关性 ;但地理距离最近的两个种群并未最先聚集 ,说明羊草种群间的分化还与其生境的异质性有关     

不同地区蟪蛄蝉求偶鸣声的比较

北京西郊(BX)、陕西西安(SX)、四川峨嵋山(SE)、山东潍坊(SW)、福建福州(FF)和陕西杨陵(SY)地区蟪蛄蝉鸣声都含高潮声Zhi…”声、脉冲的单一式调幅特性和高潮声的载波主频率(6 433±375)Hz等基本相同,显示种的同一性。但是高潮声的基频和主频率的品质因数(Q_3dB)等显示出不同程度的地区性种下差异。BX、SX和SE的基频相同(550Hz),都为高Q_3dB,即无明显的地区差异。SW和FF的基频分别为450H2和650Hz,Q_3dB都明显降低,即呈-定的地区差异。SY不仅呈节奏变化的单次声-高潮声-尾声的特有模式,而且基频增高为800Hz,即地区差异更明显。     

Beta diversity of angiosperms in temperate floras of eastern Asia and eastern North America

The diversity of a region reflects both local diversity and the turnover of species (beta diversity) between areas. The angiosperm flora of eastern Asia (EAS) is roughly twice as rich as that of eastern North America (ENA), in spite of similar area and climate. Using province/state‐level angiosperm species floras, we calculated beta diversity as the slope of the relationship between the log of species similarity (S ) and either geographic distance or difference in climate. Distance‐based beta diversity was 2.6 times greater in the north–south direction in EAS than in ENA and 3.3 times greater in the east–west direction. When ln S was related to distance and climate difference in multiple regressions, both distance and climate PC1 were significant effects in the north–south direction, but only geographic distance had a significant, unique influence in the east–west direction. The general predominance of distance over environment in beta diversity suggests that history and geography have had a strong influence on the regional diversity of these temperate floras.