Genotype distribution and evolutionary analysis of rotavirus associated with acute diarrhea outpatients in Hubei,China, 2013–2016

Group A human rotaviruses (RVAs) annually cause the deaths of 215,000 infants and young children. To understand the epidemiological characteristics and genetic evolution of RVAs, we performed sentinel surveillance on RVA prevalence in a rotavirus-surveillance network in Hubei, China. From 2013 to 2016, a total of 2007 fecal samples from hospital outpatients with acute gastroenteritis were collected from four cities of Hubei Province. Of the 2007 samples, 153 (7.62%) were identified positive for RVA by real-time RT-PCR. RVA infection in Hubei mainly occurred in autumn and winter. The highest detection rate of RVA infection was in 1–2 years old of outpatients (16.97%). No significant difference of RVA positive rate was observed between females and males. We performed a phylogenetic analysis of the G/P genotypes based on the partial VP7/VP4 gene sequences of RVAs. G9P[8] was the most predominant strain in all four years but the prevalence of G2P[4] genotype increased rapidly since 2014. We reconstructed the evolutionary time scale of RVAs in Hubei, and found that the evolutionary rates of the G9, G2, P[8], and P[4] genotypes of RVA were 1.069×10^-3, 1.029×10^-3, 1.283×10^-3 and 1.172×10^-3 nucleotide substitutions/site/year, respectively. Importantly, using a molecular clock model, we showed that most G9, G2, P[8], and P[4] genotype strains dated from the recent ancestor in 2005, 2005, 1993, and 2013, respectively. The finding of the distribution of RVAs in infants and young children in Hubei Province will contribute to the understanding of the epidemiological characteristics and genetic evolution of RVAs in China.     

湖北兴山发现霍氏缺齿鼩

2016年12月,在湖北省兴山县采集到1只食虫类标本。其体型较小(头体长75.00 mm),通体呈棕褐色,尾较长(82.00 mm),眼细小。头骨扁平,较为坚固,齿尖具有浅红棕色色斑。通过测定其线粒体Cyt b基因序列,并结合缺齿鼩属6个物种的同源区序列,构建其系统发生关系,发现该标本与基因库中霍氏缺齿鼩(Chodsigoa hoffmanni)序列聚为具较高支持度的一支。综合形态学与系统发育学证据,将该标本鉴定为霍氏缺齿鼩。此次发现是湖北省境内该物种的首次记录,也是其在我国云南省及越南分布区外的又一发现,拓展了对该物种在我国分布范围的认识。     

黑犀(奇蹄目,犀科)化石在中国的首次发现

黑犀(Diceros属)的惟一现生代表D.bicornis生活在非洲。该属在新近纪时期曾广泛分布于希腊、土耳其和伊朗等地区,但从未在东亚地区发现过。新种甘肃黑犀(Diceros gan- suensis sp.nov.)是该属在中国和东亚的首次发现。化石采自甘肃临夏盆地晚中新世柳树组中部。新种以尺寸较小、头型短、枕顶高耸、枕面窄而高、枕嵴无中沟、副枕突短小、下颌上升支距m3较近、前臼齿较小、DP1无后脊、P2原脊孤立、P2和P3后脊细窄而区别于东地中海地区的Diceros neumayri。D.neumayri的分类位置一直是一个争论的焦点,曾在黑犀(Diceros属)和白犀(Ceratotherium属)之间反复变更。研究显示,甘肃黑犀和D.neumayri的一系列共同的原始特征表明它们与更进步的白犀有明显的区别,应该归入黑犀属。     

青海曲麻莱-治多地区巴颜喀拉山群(上三叠统)遗迹化石

首次对青海南部曲麻莱-治多地区巴颜喀拉山群上部(上三叠统)遗迹化石进行了系统采集,共采获遗迹化石33属54种。据遗迹化石的形态、习性、水深等环境成因特征,可划分为两类组合:一类以Cosmorhaphe,Helminthopsis,Helminthoida,Megagrapton,Paleodictyon等为主,产生于浊流事件前;另一类以Chondrites,Neo-nereites,Palaeophycus,Phycosiphon,Planolites,Zoophycos等为主,产生于浊流事件后,两者均为半深海-深海Nereites遗迹相的典型代表,反映晚三叠世研究区应为浊流沉积发育的复理石相沉积。     

秦巴拟小鲵在河南的发现及地理分布探讨

报道了采自河南省内乡县的一种小鲵科标本,经形态学鉴定以及DNA序列比对,确定为秦巴拟小鲵(Pseudohynobius tsinpaensis)。内乡是该物种已知分布区的东限,与已知分布点相差3个经度,呈间断分布。秦巴拟小鲵在内乡的发现可为探讨小鲵科动物的起源和演化提供重要的动物地理学依据。     

贵州龙洞和万家洞内部分环境因子与动物群落结构的相关性

分别在2005年的10月和2006年的2月赴遵义龙洞和万家洞对肉眼见到的软体动物、节肢动物和脊索动物进行了观察和采集,在龙洞共获标本454号,隶属3门6纲13目20科29种或类群;在万家洞共获标本1726号,隶属3门7纲11目18科22种或类群。根据两洞内各光带中动物种类和数量组成不同,将其划分为6个动物群落,经群落多样性分析,物种丰富度、群落多样性、最大多样性、均匀度、优势度和相似性指数最高的分别是群落A(3.1932)、C(2.0788)、A(2.8332)、B(0.7828)、E(0.3789)和B-E(1.7854)。此外还研究了部分环境因子与群落多样性的相关性。结果显示,土壤中有机质的含量与群落多样性指数呈极显著正相关,相关系数为0.828(双尾显著性检验≤0.05);空气中CO2的含量与物种数、物种丰富度指数、群落多样性指数、群落最大多样性指数和群落优势度指数都成不显著负相关,相关系数分别为-0.160、-0.263、-0.072、-0.117和-0.031。由此证明土壤有机质的含量和空气中CO2的含量是影响洞穴动物群落变化的重要因子。     

广东省蛇类新纪录——菱斑小头蛇

2007年6月23日,在广东省南昆山省级自然保护区采集到一条菱斑小头蛇(Oligodon catenata),为广东省蛇类新纪录。该新分布区的发现说明菱斑小头蛇在我国可能并非间断分布。     

粤西茂名地区毒蛇咬伤的流行病学特征研究

目的 探讨茂名地区毒蛇咬伤的流行病学特征.方法 收集2014～2019年我院收治的毒蛇咬伤患者1625例的临床资料,对毒蛇种类、性别、年龄、咬伤部位、咬伤地点、伤后就诊时间、住院时间进行统计分析.结果 茂名地区主要致伤毒蛇为竹叶青蛇和眼镜蛇;受伤患者以41～70岁男性多见;被咬伤部位主要为腕关节、踝关节以下;咬伤地点多...     

云南省小黑山自然保护区种子植物区系研究

小黑山自然保护区有野生种子植物170科787属2195种。分析表明该区种子植物区系的地理成分复杂,联系广泛。热带性质的属有506属,占总属数的68.6%,温带性质的属有224属,占总属数的30.4%。热带性质的种890种,占总种数的40.9%,温带性质的种有1267种,占总种数的58.3%。表明该地区植物区系具有明显的亚热带性质,同时深受热带植物区系的影响。植物区系来源主要由东亚成分、热带亚洲成分(印度—马来西亚成分)、中国特有成分三部分融合而成。特有现象明显,有东亚特有科5科,中国特有属6属,中国特有种778种,占种总数的35.8%,而云南特有种有355种,占中国特有种的45.6%。保护区还拥有众多的珍稀濒危植物。     

A new species of Sanicula L. (Umbelliferae/Apiaceae) endemic to Baja California, Mexico

A new species of the genusSanicula (sect.Sanicoria) endemic to the southern Sierra Juárez of Baja California, Mexico, is described and illustrated.Sanicula moranii resemblesS. deserticola andS. bipinnatifida, but has thicker basal leaves, with broader petioles and rachises, and shorter fruit prickles that are confined to the apical part of the mericarps. The taxonomic relationships of these species are discussed, along with aspects of their distribution and habitat.

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Resumen  Una neuva especie del géneroSanicula (secciónSanicoria) endémica de la Sierra Juárez de Baja California, México, es descrita e ilustrada.Sanicula moranii presenta similitud conS. deserticola yS. bipinnatifida, no obstante tiene gruesas hojas basales con pecíolos y raquis anchos, y espínulas del fruto más cortas que se distribuyen únicamente en la parte apical de los mericarpos. Además, se comentan las relaciones taxonómicas de las tres especies, así como algunos aspectos de sus distribuciones y hábitats.