PYTHIUM SYLVATICUM鉴定及其专一性PCR引物

从杭州采集的水稻、棉花和大豆猝倒苗中分离到国内新记录腐霉种Pythium sylvaticum。该腐霉为异宗配合种,菌丝膨大体球形或柠檬形,雄器异丝生,藏卵器光滑,每个藏卵器上1~3个雄器,雄器常在接近藏卵器处形成二叉状分枝,卵孢子不满器。测定了该种4 个菌株的核糖体内转录间隔区(ITS)的序列,根据与59种腐霉ITS序列的比较,设计了P. sylvaticum种专一性引物PSF1和PSR2。实际结果表明:该引物能从11种共14株腐霉DNA中特异性地扩增P. sylvaticum,从而与其它10种腐霉区分。     

侵染天南星科植物病毒的分子鉴定及其生态学研究

通过病毒粒子部分提纯和形态学观察,发现侵染我国南方天南星科植物的病毒主要有线状和球状两种形态．经病毒基因组序列分析确定线状病毒为芋花叶病毒(DsMV);经血清学反应和序列分析确定球状病毒为黄瓜花叶病毒(CMV)．CMV CP基因序列同源性分析的结果表明,侵染天南星科的CMV是相对独立的种内变异类型,归属于亚组L同时,CMV存在对天南星科植物的适应性变异．对采自我国海南、湖南、浙江、上海等地的126个天南星科植物样品进行RNA核酸斑点杂交检测,获得病毒检测结果。海南省样品DsMV的检出率为73．3％,CMV的检出率为46．7％;湖南省样品DsMV的检出率为100％,CMV的检出率为38.5％;浙江省样品DsMV的检出率为93．0％,CMV的检出率为7．0％;上海市样品DsMV的检出率为100％,尚没有检测到CMV,首次证实了自然条件下CMV作为天南星科植物主要病毒的存在,在我国南方地区,该病毒对天南星科植物的自然侵染受到气候、季节和寄主等生态因子的影响。DsMV则在天南星科植物上普遍存在。     

百合斑驳病毒浙江分离物的基因组3′端序列分析

经RT-PCR扩增从浙江丽水的亚洲百合［Lilium cvs.(Asiatic Hybrids)］获得2个Potyvirus病毒分离物G和X的3′端cDNA片段,序列分析表明均为百合斑驳病毒（Lily mottle virus,LMoV）;将12个来源于不同地区百合与郁金香上的Potyvirus分离物进行序列同源性比较和系统进化树分析,结果表明G、X、ML61、1229、2b、MD、HZ、J这8个分离物的CP核苷酸序列同源性达85.9%～100%,在进化树中聚集成簇,归为LMoV;2b2、TM和TBV1 3个分离物同源性达91.2%～99.3%,在进化树中也单独成簇,归为郁金香碎色病毒（Tulip breaking virus,TBV）;2b3 与其它11个分离物同源性在74.4%～79.8%之间,为伦布兰特郁金香碎色病毒（Rembrandt tulip breaking virus,ReTBV）。Nib基因序列和3′UTR序列分析也表明G、X、ML61、1229、J、HZ这6个分离物之间亲缘关系较近,属于LMoV,而TM与它们的亲缘关系很远,属于TBV。LMoV分离物存在着两个群体,G和X分别处在第1群体和第2群体中,不表现地域相关性及寄主相关性。根据研究结果,将迄今世界各地侵染百合与郁金香的Potyvirus分离物归为LMoV、TBV和ReTBV 3个种。     

盐芥(Arabidopsis salsuginea)cDNA文库的随机测序

实验以盐生植物盐芥为材料 ,提取经盐处理的盐芥总RNA ,分离mRNA后 ,构建cDNA文库。从cDNA文库中随机挑取克隆进行测序。结果共测得 5 3个表达序列标记 (EST) ,有 37个EST( 6 9 8% )与拟南芥的基因在多肽水平上有较高同源性 ;2 1个EST( 39.6 % )的功能未知     

东北过伐林区四种森林类型的物种多样性比较研究

运用无偏对应分析(DCA)、群落本质多样性排序和方差分析的方法,研究了东北过伐林区吉林省汪清林业局境内的四种森林类型——针阔混交林、阔叶混交林、柞木林和长白落叶松人工林的林分层次的植物物种多样性间的差异。从4种类型下层植被多样性指数的比较结果来看,针阔混交林最高,阔叶混交林和落叶松人工林次之,柞木林最低。最后提出了部分经营建议。     

狂犬病病毒SRV9疫苗株糖蛋白核酸序列及抗原特性研究

狂犬病病毒SRV9株是经克隆获得的中等蚀斑口服弱毒疫苗候选株,具有安全和免疫原性较好等。本试验根据狂犬病病毒糖蛋白核苷酸5'末端和3'末端序列设计了一对引物,通过反转录－聚合酶链式反应（RT－PCR）分别扩增了SRV9及其母源株SAD B19糖蛋白的全长cDNA,测序结果表明,SRV9和SAD B19糖蛋白cDNA读框长1575bp,编码524氨基酸残基的多肽。通过和其母源株SAD B19核苷酸序列比较发现,SRV9析158,575,931位碱基分别出现了G→A,A→G和A→G的转换,相应地导致第53位,192位,311位氨基酸出现了Gly→Glu,His→Arg,Thr→Ala突变。和我国现行的和疫苗株ERA的核苷酸和氨基酸比较,有10个碱其不同,7个氨基酸发生改变。经Jameson-Wolf抗原表位优势图分析发现。SRV9在192位氨基酸的改变,导致该部位产生了一个新的潜在抗原位点。由于狂犬病病毒糖蛋白是诱导机体产生中和抗体唯一抗原,因此,上述氨基酸的改变可能与其特殊的蚀斑特性和其安全性提高有关。保持对毒株的氨基酸序列分析也是监测其特性的重要手段之一。     

2种蜜蜂和4种胡蜂蜂毒明肽基因比较

从中华蜜蜂、意大利蜜蜂和大胡蜂、墨胸胡蜂、额斑黄胡蜂、亚非马蜂6种蜂的雌成蜂毒腺中快速抽提总RNA,用RT—PCR方法分别扩增各得到大小约为150bp的cDNA片段,进一步将这6个片段克隆人pGEM^5—T easy载体,进行测序和序列分析。结果表明,所扩增得到的6个片段长度均为141bp,均为编码蜂毒apamin前体的cDNA。序列比较发现,中华蜜蜂、大胡蜂、墨胸胡蜂和亚非马蜂序列完全一样,都与已发表意大利蜜蜂precursor of apamin核苷酸序列具有95％同源性,氨基酸序列具有95％的同源性。额斑黄胡蜂和意大利蜜蜂precursor of apamin核苷酸序列完全一样。本研究首次从中华蜜蜂与几种胡蜂中克隆到蜂毒precursor of apamin基因,并发现胡蜂科与蜜蜂科来源的蜂毒明肽序列是完全保守的。     

赤麂线粒体全基因组的序列和结构

提取赤麂细胞株总DNA,参照我们实验室已测定的同属动物小麂线粒体全基因组序列设计引物,PCR扩增、测序、拼接,获得赤麂线粒体全基因组序列并进行生物信息学分析。赤麂线粒体全基因组序列全长16354bp。定位了22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白编码基因和1个D-loop区。赤麂与小麂及其它哺乳动物线粒体的基因组结构相同,它们的序列同源性都较高。     

中华蜜蜂磷酸甘油变位酶（PhosphoglycerateMutase）基因的序列分析

在中华蜜蜂(Apis cerana)工蜂毒腺cDNA库内发现了一个插有1104bp外源片段的克隆,内含一个765bp的开放阅读框架(ORF),编码一个含有254．个氨基酸残基的依赖于2,3一二磷酸甘油酸的磷酸甘油变位酶(dPGAM),催化3一磷酸甘油和2一磷酸甘油之间的转化。推测的氨基酸序列与其他7种生物的dPGAM的相似性很高(39％-88％),而与其他4种不依赖于2,3-二磷酸甘油酸的磷酸甘油变位酶(iPGAM)的相似性则很低(10％-12％),氨基酸序列的多重联配表明组成dPGAM活性位点的氨基酸残基在包括中华蜜蜂在内的所有生物体内是十分保守的,Ac—PGAM是一种典型的dPGAM。这是昆虫纲中继在果蝇中发现PGAM基因后的第2个昆虫dPGAM基因,其对PGAM基因的结构与功能研究及对昆虫的分子生物学研究具有意义。同时,对PGAM的进化关系的分析表明该基因可以用作研究物种系统关系的一个依据。