棉花高质量DNA的提取及SRAP反应体系的优化

建立一种简便、快速、经济、有效的gDNA提取方法,并以得到高质量的gDNA为模板摸索棉花SRAP反应体系的最优条件。在提取棉花DNA之前对样品进行预除酚处理,采用CTAB法并加以改进,摸索了一种简便、快速、经济、有效的gDNA提取方法。结果表明预处理除酚法提取天然彩色棉的gDNA为白色,OD260 nm/OD280 nm平均值达到1.900,OD260 nm/OD230 nm平均值1.659,琼脂糖电泳检测表明所提取的DNA较完整,RNA含量少;通过对重要参数进行摸索和优化试验,建立一套稳定可靠、扩增效果好、可重复性强的适用于棉花的SRAP反应体系：25μL的反应体系中,模板DNA量30ng、2.5mmolm/L Mg2＋浓度、0.8μmol/L的上下游引物、200μmol/L的dNTPs以及Taq酶1U。     

Analysis of the genetic diversity of garlic (Allium sativum L.) germplasm by SRAP

Cluster analysis and principal component analysis were used to investigate the genetic diversity of 40 garlic germplasms analyzed with 23 sequence-related amplified polymorphism (SRAP) primer combinations. A total of 130 polymorphic loci were detected among these germplasms, with an average of 5.65 polymorphic loci per SRAP primer combination. The percentage of polymorphic loci was 69.1%, whereas the mean effective number of alleles, the mean Nei's gene diversity, and the mean Shannon's information index were 1.4446, 0.2788, and 0.4365, respectively. Cluster analysis revealed that the 40 germplasms could be divided into 3 groups. The results of principal component analysis were consistent with those of unweighted pair-group method with arithmetic averages (UPGMA) clustering analysis. The Shannon-Weaver information index ranged from 0.2419 to 0.4202, indicating that the garlic germplasms had high genetic diversity.     

SRAP结合SCoT标记分析番木瓜种质的遗传多样性

利用SRAP和SCoT两种分子标记相结合对中国22个番木瓜主要栽培品种(系)进行遗传多样性研究。SCoT标记检测获得的遗传多样性参数值和遗传相似系数范围均高于SRAP标记检测的结果,表明SCoT标记检测多态性的能力高于SRAP标记。基于两种标记数据合并后的UPGMA聚类结果显示,番木瓜种质间的遗传相似系数为0.65~0.90,种质间遗传多样性水平较低;在遗传相似系数为0.82时,将所有参试材料划分为3个类群。应用Mantel检测对SRAP和SCoT及两种标记合并进行相关性分析,表明三者之间具有显著的相关性,且相关性很高。聚类结果从分子水平反映出中国番木瓜主要栽培品种(系)的遗传基础狭窄。     

卵圆型软条白沙枇杷变异种质鉴定研究

本研究以卵圆型软条白沙枇杷变异种质为试材,母株软条白沙及中国、日本、新西兰3个国家的30个白肉枇杷栽培品种为对照,以形态学性状调查为基础,结合SRAP分子标记对变异种质进行鉴定研究。从96对引物中筛选出18对进行扩增,共获得135个位点,其中102个多态性位点,多态性位点百分率为75.6%。不同品种间的遗传相似系数GS在0.53~0.89之间。在GS为0.66处,可将31份枇杷种质分为4类。第Ⅰ类为来自中国浙江的8份种质。第Ⅱ类为来自日本、新西兰和中国江苏和福建的19个种质。第Ⅲ类为上海白沙和广西白蜜枇杷2个种质。第Ⅳ类为福建白梨和龙才白2个种质。而卵圆型软条白沙与对照品种遗传相似系数为0.55~0.88,与白荔枝的遗传相似度最大(GS=0.88),与乌躬白遗传相似度最小(GS=0.55),与母株软条白沙的遗传相似系数仅为0.73,二者的遗传相似度不大。生物学性状调查表明,卵圆型软条白沙变异材料与母株软条白沙在果型、种子数和可食率等性状上具有明显差异。综合研究结果显示,卵圆形软条白沙与母株软条白沙相比,综合性状发生了明显的遗传变异,应属芽变种质材料。本研究对枇杷变异材料的创新利用、新品种审定与知识产权保护具有重要的实际意义。     

基于SRAP分析的梨授粉品种亲缘关系对砀山酥梨石细胞含量的影响

利用SRAP分子标记,从88对引物中筛选出34对引物组合,分析砀山酥梨母本与授粉品种之间的亲缘关系,探讨梨授粉品种亲缘关系对砀山酥梨石细胞含量的影响。结果表明:授粉品种紫酥、鸭梨和马蹄黄与砀山酥梨亲缘关系较远,授粉品种华山、幸水和圆黄与砀山酥梨亲缘关系较近;砀山酥梨自然授粉果实石细胞含量为0.61%;选用紫酥、鸭梨和马蹄黄作授粉树时,果实石细胞含量分别为0.34%、0.33%、0.36%,低于自然授粉的砀山酥梨;选用华山、幸水和圆黄作授粉树时,果实石细胞含量分别为0.84%、0.70%、0.66%,高于自然授粉的砀山酥梨。选用与砀山酥梨亲缘关系较远的梨品种作授粉树可减少砀山酥梨石细胞含量,改善口感     

基于SRAP标记的山药种质资源遗传多样性分析

目的:研究我国山药种质资源遗传多样性,为合理利用资源和开展选育种工作提供理论依据。方法:以国内94份山药种质资源为材料,采用SRAP标记并通过NTSYS2.10软件进行SHAN聚类分析、PROJECTION主成分分析;利用POPGENE软件估算遗传多样性参数。结果:从49对SRAP引物中筛选出30对能产生稳定清晰可辨的扩增产物的引物,共扩增出754条DNA带,其中多态性条带616条,占总条带的81.7%。聚类结果表明:当遗传相似系数(GS)为0.822时,可将94份资源分为5类:第Ⅰ类20份、第Ⅱ类43份、第Ⅲ类7份、第Ⅳ类3份、第Ⅴ类21份。第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ类分别为薯蓣、褐苞薯蓣、山薯和参薯。主成分分析结果显示:第一与第二主成分可解释88.34%(82.10%和6.24%)的遗传总变异。遗传多样性参数分析表明:比较5个遗传多样性参数值,5个群体的遗传多样性水平表现为Ⅰ>Ⅴ>Ⅲ>Ⅱ>Ⅳ,第Ⅰ类(薯蓣)遗传多样性水平高;山药遗传群体间遗传分化系数为51.88%,大部分差异存在于群体之间,群体间遗传分化高。结论:山药种质资源丰富且群体遗传分化高,有利于山药新品种的选育。SRAP标记可有效应用于山药种质资源的鉴别和遗传多样性分析。通过DNA指纹鉴定技术鉴别山药品种具有重要性与紧迫性。     

SRA的RNA和蛋白质均有转录辅激活功能

类固醇受体激活物（steroid receptor activator, SRA）是一种 类固醇受体辅激活物.最初的研究认为,SRA只存在RNA形式,不存在蛋白质 形式.但是后来的研究发现,SRA是在RNA和蛋白质两个水平上发挥功能的分 子,其cDNA序列存在687 bp保守的核心区域,该核心区域对其发挥转录共激 活活性是必需的.SRA的RNA形式主要参与核受体的转录共激活作用,其表达 与乳腺癌的发生有很大关系,SRA的蛋白质形式（steroid receptor activator protein ,SRAP）也具有类似的功能.但是不同于RNA形式, SRAP可结合到特定基因的启动子区域,并起到阻遏物的作用.本文对SRA的 特点、表达及功能等方面的最新研究进展及其可能的作用机制与作用形式 进行概述.     

Genetic diversity in Vicia amoena (Fabaceae) germplasm resource in China using SRAP and ISSR markers

The genetic diversity in 17 germplasms of Vicia amoena L. from north China was analyzed using SRAP and ISSR markers. Three hundred and sixty-eight (94.11%) polymorphic bands (211 and 157 obtained from 20 pairs of SRAP and ISSR primers, respectively) were scored. Although SRAP was more effective than ISSR markers with higher PIC, RP and larger variation range of genetic distance, both the markers were useful for assessing V. amoena genetic diversity. Cluster analysis showed that the 17 germplasms were clustered into 5 groups. The results of principal coordinate analysis supported UPGMA clustering. The germplasms from source areas where the annual average temperature ranged from −1.0 to 5 °C exhibited the highest level of genetic diversity with the highest PPI, I and H. These results have important implications in genome mapping, breeding purposes, and germplasm conservation.     

应用SRAP标记分析福瑞鲤及其原始亲本的遗传结构

摘要：应用SRAP分子标记对建鲤（Cyprinus carpio var. jian）、黄河鲤（C.c.haematopterus）和福瑞鲤（FFRC Strain Common Carp,C.carpio）进行遗传结构分析。结果显示,筛选出的10个多态性较好的引物组合共扩增出110个位点,其中多态性位点92个,平均多...