基于结构比较的蛋白质同源模建系统及其评估Ⅱ侧链的安装

至今,有关蛋白质侧链的同源模建,除了在本体模板上安装侧链和少数限制条件下在同源模板上安装侧链的报道外,系统的研究和实施似乎还未见报道。本软件系统ＰＭＯＤＥＬＩＮＧ采用同源移植和“死端排除“相结合的侧链安装策略,对与模板蛋白相应践基具有相似大小和形状的目标残基采用直接移植的方法。其余铡链则用广义“死端排除定则”安装。经众多蛋白的测试,达到了较好的模建品质。     

磷酸酪氨酸蛋白专一抗体的制备和纯化

以偶联磷酸化酪氨酸的牛血清白蛋白（ＢＳＡ）作为免疫原免疫兔获得抗血清．自抗血清中分离获得抗体．自酪胺合成磷酸酪胺,并偶联到溴化氰活化的Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ４Ｂ上．抗体经磷酸酪胺－Ｓｅｐｈａｒｏｓｅ４Ｂ亲和柱纯化,所得抗体专一性强,Ｄｏｔｂｌｏｔ显示：抗体仅对酪氨酸磷酸化的蛋白质包括酪氨酸磷酸化的血清白蛋白,溶菌酶,卵清蛋白起抗原抗体反应,而不识别非酪氨酸磷酸化的溶菌酶,卵清蛋白,也不识别作为免疫原的骨架成分ＢＳＡ,也不识别丝氨酸磷酸化的卵清蛋白和苏氨酸磷酸化的卵清蛋白．     

钙网蛋白研究进展

钙网蛋白研究进展陈安和（西南师范大学生命科学系,重庆６３０７１５）关键词钙网蛋白钙网蛋白（ｃａｌｒｅｔｉｃｕｌｉｎ）是１９７４年命名的骨骼肌肌质网膜上的钙结合蛋白。近年的研究发现,该蛋白质在非肌肉组织中含量丰富,它是内质网（ＥＲ）主要的钙结合蛋白之一...     

人腺病毒E4转录区ORF4蛋白与细胞凋亡

人腺病毒基因早期转录区4的第4开放阅读框架编码的E4ORF4蛋白是一种多功能病毒调节蛋白,能够特异地引起转化细胞的凋亡,而对正常细胞没有影响,并且这种凋亡机制不依赖于经典的p53途径,E4ORF4蛋白功能的发挥需要与细胞内蛋白磷酸酶2A的相互作用,而且它还能改变Src激酶的活性,E4ORF4蛋白的多种功能协调合作,最终导致了转化细胞的凋亡。     

单核细胞趋化蛋白-1、高迁移率族蛋白B1与溃疡性结肠炎患者肠道菌群变化的相关性

目的 探讨单核细胞趋化蛋白-1（MCP-1）、高迁移率族蛋白B1（HMGB1）与溃疡性结肠炎（UC）患者肠道菌群变化的相关性。方法 选取2016年9月‒2018年1月遂宁市中心医院收治的98例UC患者资料,根据Mayo评分系统将UC患者分为活动期组（n=50）和缓解期组（n=48）。选取同期进行体检的健康人50例作为对照组。比较各组间肠道菌群,血清MCP-1、HMGB1水平,并进行Pearson相关分析。结果 活动期组患者肠道乳杆菌、双歧杆菌含量[（5.34±0.87）、（5.81±0.83）CFU/g]显著低于缓解期组和对照组[（8.07±0.86）、（8.35±0.88）CFU/g;（8.13±0.91）、（8.46±0.95）CFU/g]（F=12.035,P0.05）。活动期组和缓解期组患者血清MCP-1、HMGB1水平[（267.42±23.51）、（21.35±2.26）ng/mL;（188.15±20.73）、（6.28±1.38）ng/mL]显著高于对照组[（106.38±15.92）、（2.13±0.41）ng/mL]（F=84.163,P<0.001;F=25.386,P<0.001）;活动期组患者血清MCP-1、HMGB1水平[（267.42±23.51）、（21.35±2.26）ng/mL]显著高于缓解期组[（188.15±20.73）、（6.28±1.38）ng/mL]（t=17.676、39.641,均P<0.05）。经过Pearson相关性分析,MCP-1、HMGB1与UC患者乳杆菌、双歧杆菌含量呈负相关（r=‒0.715、‒0.659,r=‒0.703、‒0.614,均P<0.001）,与大肠埃希菌、肠球菌、拟杆菌含量呈正相关（r=0.783、0.702,r=0.762、0.735,r=0.653、0.612,均P<0.001）。结论 MCP-1、HMGB1作为促炎因子可介导肠黏膜炎性反应,引起UC患者肠道菌群的紊乱。     

CCCTC-结合因子与输入蛋白13存在蛋白间相互作用

目的:研究CCCTC-结合因子(CTCF)是否与输入蛋白13(IPO13)存在相互作用。方法:采用GST pull-down及免疫共沉淀实验研究二者的相互作用。结果与结论:实验表明CTCF与IPO13之间存在相互作用     

鳜鱼Mx蛋白全长cDNA的克隆和序列分析

Mx蛋白是一类由I型干扰素诱导表达的抗病毒蛋白.本研究以感染了鳜传染性脾肾坏死病毒(Infectious spleen and kidney necrosis virus,ISKNV)的鳜鱼为材料,提取肝脏总RNA,通过逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增出Mx蛋白基因的核心片段序列,再应用3'和5'快速扩增cDNA末端(RACE)方法PCR扩增Mx蛋白cDNA末端,最终获得鳜鱼Mx蛋白cDNA序列(GenBank登陆号AY392097).序列分析表明鳜鱼Mx蛋白cDNA含有2391bp,其中编码区长1881bp,编码627个氨基酸残基,推测蛋白质分子量大小为7.15kDa.鳜鱼Mx蛋白具有脊椎动物Mx蛋白共有的结构特征一个三联体GTP结合区域(GXXXSGKS/T、DXXG、T/NKXD);一个发动蛋白家族的典型结构特征序列(LPRGS/KGIVTR);以及C端高度保守的Leu拉链结构域.鳜鱼Mx蛋白全基因的获得为下一步研究鱼类Mx蛋白的抗病毒活性、作用机制,以及干扰素的检测奠定了基础.