测定淀粉分支酶活性方法的改进

以发育中的小麦籽粒为材料,对现有的淀粉分支酶活性测定方法从缓冲体系,酶液浓度、反应体系总体积、反应时间、到酶反应终止方式作了适当改进。改进后的酶活性测定方法能很好的区分不同小麦品种间的酶活性差异,实验重复性好,比原测定方法更快捷、省时、经济和易于操作。     

卷首语:复杂与永续

<正>过去的150年,现代生态学在从微观到宏观的不同层次、不同分支学科中都取得了长足的进展,生态学的多学科交叉和整体论渊源及其与社会可持续发展紧密相关的学科特点使其成为一门当代最有潜力也最具挑战的朝阳学科。生态学被认为是应付全球变化挑战、改善人与自然关系、惠荫人类福祉、推进地球永续发展的重要理论和方法依据及规划、建设与管理的系统     

HRCA技术检测中华鳖虹彩病毒

[目的]中华鳖虹彩病毒(STIV)是甲鱼重要的病毒性病原之一,建立特异性好、灵敏度高的中华鳖虹彩病毒超分支滚环扩增体系(HRCA),对STIV进行快速、准确地检测.[方法]根据中华鳖虹彩病毒(STIV)独有的基因序列和锁式探针公共连接序列分别设计特异性的锁式探针及其扩增引物,对HRCA的系列反应条件进行优化,验证该方法的特异性和灵敏度,并用该方法对感染STIV显症和未显症的甲鱼组织进行检测.[结果]10 nmol/L探针经T4 DNA连接酶作用20 min环化,Bst DNA聚合酶大片段扩增20 min即可获得很好的检测效果.特异性试验表明,在多种待检病毒样中,HRCA能特异地检测出STIV,同时HRCA具有极高的灵敏度,能检测出的最低模板量为101拷贝,而常规PCR的检测下限为103拷贝,对显症和尚未显症的感染早期甲鱼组织的检测结果均为阳性.[结论]建立的中华鳖虹彩病毒HRCA检测体系具有灵敏、快速、简便等特点,能从组织样品中准确地检测出STIV,可以用于该类疾病的早期诊断,具有较好的推广前景.     

两种小达氏涡虫的阴茎发育与分类性状关系

小达氏涡虫属个体的骨质阴茎足物种鉴定的重要依据.本实验观察了中国小达氏涡虫(Microdalyellia sinensis)与湖南小达氏涡虫(M.hunanensis)阴茎的形态形成及发育.结果表明:(1)阴茎末端各分支的形态形成是一次性成型,终身不变;(2)两种涡虫在发育的第12 d都完成阴茎的骨质化;(3)阴茎的基柄形态随个体发育而增长.研究证实,小达氏涡虫属阴茎末端分支结构是稳定的分类性状,可以作为重要的分类依据.     

应用CGH数据和树模型探索癌症的发病机理

比较基因组杂交技术(comparative genomic hybridization, CGH)主要用于检测肿瘤的染色体缺失和扩嘱, 迄今已积累了大量的实验数据, 为全基因组分析肿瘤的发生机制提供了可能。树模型在生物信息学领域通常被用于研究生物形成和进化的历史, 物种之间的进化关系常以系统发生树来表示。树模型同样可以作为一种有力的生物信息学工具来分析CGH数据, 探索癌症的发病机理。文中介绍了两种常见的树模型—— 分支树和距离树, 详细叙述了重建树模型的基本原理和方法, 分析了创建树模型时要注意的几个技术问题, 并对其在肿瘤研究中的应用进行了回顾和总结。肿瘤的树状模型作为单路径线性模型的泛化, 克服了以往单路径线性模型的缺点, 理论上能更加精确地概括到肿脉的多基因、多路径、多阶段的发生发展模式, 从不同角度探讨肿瘤发生发展的分子机制。该模型除可用于分析肿瘤的CGH数据外, 还可用于分析其他多种类型的数据, 包括微阵列CGH(array-CGH)技术等产生的高分辨率数据。     

硝尔库勒湖沉积物中非培养放线菌多样性

[目的]认识和了解盐湖沉积环境中放线菌的多样性,为今后的开发和利用奠定基础.[方法]应用免培养技术和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对新疆硝尔库勒盐湖沉积物中放线菌的多样性进行了研究.实验采用SDS-CTAB法提取土样中总DNA,利用放线菌特异性引物对土样总DNA进行16S rRNA基因扩增,并构建16S IRNA基因克隆文库;对随机挑选的160个克隆通过酶切筛选出51个不同图谱的重组克隆,并对其测序.[结果]所获得的51个克隆序列属于39个OTUs,其中52.9%的克隆序列分布于放线菌门(phylum Actinobacteria)放线菌亚(Actinobacteridae)的5个亚目和酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)中,并且在这两个亚纲中有大量克隆序列属于放线菌的新类群,另外47.1%的克隆序列以极高的自展值在放线菌门内支持形成一个独立的大分支,极有可能代表一个新亚目或更高级分类单元的类群.[结论]这些研究结果说明硝尔库勒盐湖中存在有较为丰富的放线菌系统发育多样性,并且潜藏着新类型的放线菌资源.     

生态位构建对具有资源竞争物种的进化分布动态的影响

生态位构建是有机体通过自身活动、代谢等行为调节或影响其环境或其他生物有机体的过程,进而导致有机体在自然选择过程中产生不同的进化轨迹。已有研究结论是基于双位点种群遗传模型、基于个体模型以及及元胞自动机模拟模型得出的。目前分析物种进化入侵的常用方法之一是进化分布动态模型。通过引入该方法,着重研究了依特征调节的生态位构建作用对具有种内资源竞争的物种进化动态的影响。结果表明:依特征调节的生态位构建确实能够引起物种进化轨迹的明显改变。若生态位构建中心位于特征值较小的特征时,将减少进化分支,且相较于不存在生态位构建的情况而言,种群密度提高;与此相反,生态位构建中心为特征值较大的特征时,生态位构建维持进化多样性,尽管其破坏了原有进化的对称分布。这意味着生态位构建通过与环境长期的正反馈作用,使具有较强依赖的种群特征出现明显差异,分支数虽有减少,但显著提升了优势特征的种群密度,且物种进化分支数随着构建强度的增加而减少。强烈的种内竞争和较弱的生态位构建作用将有利于维持种群的进化多样性。     

由微分方程所描述的微生物连续培养动力系统(Ⅰ)

陆续介绍微生物连续培养(Chemostat)的基本原理,以单种微生物连续培养模型为基础,较详细地介绍几类由微分方程所描述的微生物连续培养动力系统模型,涉及的问题有解的稳定性,系统的持久性,周期解和Hopf分支等．     

分支系统学当前的理论和方法概述及华东地区山胡椒属十二个种的分支系统学研究

本文概述了当前分支系统学研究中涉及的主要理论和方法,包括性状的选取、性状状态和极性的确定、数据矩阵的分析计算、结果分支图的处理、分支图可靠性的评价及分支图的应用。本文同时以华东地区樟科山胡椒属Linderal2个种的分支系统学研究为例,讨论了用形态性状进行分支系统学研究中可能遇到的问题,也揭示了一些分支系统学与传统的系统学在应用性状推导进化关系上的不同点。对这12个种的分支系统学研究得出了一些不同于传统系统学方法所推测的山胡椒属内的系统发育关系,如分支系统学研究显示山胡椒组和球果组很近缘。在严格一致性分支图上,杯托组的黑壳楠和江浙山胡椒分别位于最原始和最进化的分支,表明这个组是复系类群。分支图也显示山胡椒组可能是复系类群。     

一类具有时滞的生化反应模型的Hopf分支

在生物化工用肺炎杆菌与甘油转化为1,3-丙二醇的过程中会出现振荡现象,本文对出现振荡的机理进行了研究,根据生物意义,在模型中引入了时滞项,经分析和计算得到了产生Hopf分支的分支值以及分支值随控制参数变化的规律,并利用时滞微分方程的数值解法绘制了周期解的图形和相图。为这一过程的振荡机理研究提供了理论依据。并可用于指导工艺控制。