糖多孢红霉菌同源片段长度与染色体重组率关系的研究

为了探索同源片段长度与糖多孢红霉菌染色体同源重组率的关系,化学合成或用重叠PCR合成带有突变位点、在突变位点两侧长度为（26bp+27bp）、（500bp+576bp）和（1908bp+1749bp）的同源序列,克隆于糖多孢红霉菌同源重组载体pWHM3后,分别构建了pWHM1113、 pWHM1116和 pWHM1119质粒。以PEG介导转化糖多孢红霉菌A226原生质体,3个质粒分别获得每皿30个、69个和170个转化子,但pWHM1113质粒不能与染色体有效整合,pWHM1116质粒与染色体整合率为转化子的2%,而pWHM1119质粒与染色体整合率达到转化子的19%。 pWHM1116和 pWHM1119质粒均可进行有效的染色体二次重组,将突变位位点引入染色体。因此,同源片段长度为（500bp+576bp）或更长时,可与糖多孢红霉菌染色体进行有效的单重组和双重组。     

剪切修复偶联因子1的结构与功能

剪切修复偶联因子1是一种重要的DNA修复因子,参与了包括核苷酸剪切修复和重组修复在内的多种DNA修复过程。本文主要介绍了该因子在DNA修复过程中的作用和机制,及在肿瘤治疗和衰老过程中的可能作用。     

DNA 的电荷转移

在双链DNA分子中,电荷常出现远距离的迁移现象,这与很多生物学功能有密切的关系,本文说明了DNA电荷转移的形成机制,分析了误配、绞联、三股螺旋及DNA结合蛋白对DNA电荷转移效率的影响,同时论述了DNA电荷转移的生物学意义。     

基因表达聚类分析技术的现状与发展

随着多个生物基因组测序的完成、DNA芯片技术的广泛应用,基因表达数据分析已成为后基因组时代的研究热点.聚类分析能将功能相关的基因按表达谱的相似程度归纳成类,有助于对未知功能的基因进行研究,是目前基因表达分析研究的主要计算技术之一.已有多种聚类分析算法用于基因表达数据分析,各种算法因其着眼点、原理等方面的差异,而各有其优缺点.如何对各种聚类算法的有效性进行分析、并开发新型的、适合于基因表达数据分析的方法已是当务之急.     

大鼠Shh-N融合蛋白的表达、纯化及功能研究

为了获得重组Sonic hedgehog N端蛋白（Shh-N）并研究其功能,应用PCR技术扩增Shh-N cDNA,然后克隆至原核表达质粒中,转化E.coli后获得表达菌株, 经1 mmol/L IPTG诱导高效表达出带有His-tag的融合蛋白,其中大部分为可溶性蛋白,少量为包涵体.用His-tag特异性结合树脂纯化可溶性融合蛋白,经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴定为单一区带,凝胶自动扫描分析表明,Shh-N的纯度达85%以上.纯化后的Shh-N在成纤维生长因子8(FGF₈)的协同作用下,能诱导神经前体细胞（NPC）向酪氨酸羟化酶阳性神经元（TH⁺）发育.在此基础上可以诱导不同类型的人类干细胞定向分化为多巴胺(DA)神经元,从而为临床治疗帕金森病（PD）提供充足的供体细胞.     

AFLP分子标记及其应用

扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism,AFLP),是Zabeau等(1992)发展的一种新DNA指纹技术。该技术原理简单,引物设计巧妙,既具有RFLP技术的可靠性又具有RAPD技术的高效性,被称为“最有力的分子标记”。系统介绍了AFLP分子标记的基本原理、技术流程和优化措施,对AFLP标记在植物居群生物学、保护生物学、分子系统学等领域中的应用作了简要介绍,并对其应用前景进行了展望。     

国槐DNA导入花生D5代性状遗传变异的分析

利用花粉管通道技术对国槐DNA导入花生栽培品种79266,D2代变异株98D010－7经连续自交,D3代获得9个株系,61个株行,641个单株,观察D5代群体内每个单株的开花型、株型、主茎高、第一对侧枝长、分枝数及单株结果数等主要农艺性状的表现型。结果表明：（1）79266和98D010－7均为连续开花型,D5代出现了交替开花型变异株,占总株数4．37％,开花型分离株行占16．39％;（2）79266株型直立,98D010－7株型葡匐,D5代表现型有直立,葡匐和半葡匐3种类型,分别占34．95％、14．04％和51．09％;表现分离的株行占73．77％;（3）株高和第一对侧枝长与79266相比显著降低;（4）单档分枝数与受体平均值相近,只有1个株系分枝数显著少于受体79266,其它8个株系差异不显著;（5）D5代群体有3个株系的单株结果数显著大于受体79266的单株结果数。     

海洋单细胞四爿藻基因组DNA的微量提取

四爿藻具有坚硬的囊壳和特殊的细胞壁组成,细胞不易破碎,且含有丰富的糖蛋白,易对DNA造成污染,使其基因组DNA提取较为困难、纯度不高。研究对比传统的CTAB法与高盐低pH法提取四爿藻DNA,高盐低pH法快速经济,得到的基因组DNA纯度较高,是一种行之有效的四爿藻基因组DNA提取方法。该法通过改变抽提介质,提高细胞破碎效率,减少抽提次数,有效去除污染,提取的基因组DNA不仅可以成功进行nrDNA转录间隔区(ITS)扩增,而且扩增产物适合于进行测序分析,这为其它淡水和海洋单细胞及多细胞藻类基因组DNA的提取也提供了借鉴。     

基于贝叶斯网络的DNA序列剪接位点预测

采用基于贝叶斯网络的建模方法,预测真核生物DNA序列中的剪接位点．分别建立了供体位点和受体位点模型,并根据两种位点的生物学特性,对模型的拓扑结构和上下游节点的选择进行了优化．通过贝叶斯网络的最大似然学习算法求出模型参数后,利用10分组交互验证方法对测试数据进行剪接位点预测。结果显示,受体位点的平均预测准确率为92．5％,伪受体位点的平均预测准确率为94．0％,供体位点的平均预测准确率为92．3％,伪供体位点的平均预测准确率为93．5％,整体效果要好于基于使用独立和条件概率矩阵、以及隐Markov模型的预测方法．表明利用贝叶斯网络对剪接位点建模是预测剪接位点的一种有效手段．     

塔克拉玛干沙漠腹地隔离人群线粒体DNA序列多态性分析

对新疆塔克拉玛干沙漠腹地的75名克里雅人线粒体DNA的高可变I区的15996—16401的片段进行了序列分析,在所测定的75个个体中,共检测到68个位点存在变异,界定了71种不同的单倍型。克里雅人群的核昔酸变异度和平均核苷酸差异都介于所报道的东方人群和西方人群之间。根据Neighbor-joining法构建系统发育树,发现中亚的各人群均处于东方人群的亚洲谱系和西方人群的欧洲谱系之间,并且克里雅与新疆维吾尔和境外维吾尔之间的遗传距离最近,表明他们之间有很密切的亲缘关系。