The phylogeny of Orthoptera inferred from mtDNA and description of Elimaea cheni （Tettigoniidae： Phaneropterinae） mitogenome

The complete 15,831 bp nucleotide sequence of the mitochondrial genome from Elimaea cheni(Phaneropterinae)was determined.The putative initiation codon for cox1 was TTA.The phylogeny of Orthoptera based on different mtDNA datasets were analyzed with maximum likelihood(ML)and Bayesian inference(BI).When all 37 genes(mtDNA)were analyzed simultaneously,the monophyly of Caelifera and Ensifera were recovered in the context of our taxon sampling.The phylogeny of Orthoptera was largely consistent with previous phylogenetie hypotheses.Rhaphidophoridae to be a sister group of Tettigoniidae,and the relationships among four subfamilies of Tettigoniidae were(Phaneropterinae+(Conocephalinae+(Bradyporinae+Tettigoniinae))).Pyrgomorphidae was the most basal group of Caelifera.The relationships among six acridid subfamilies were(Oedipodinae+(Acridinae+(Gomphocerinae+(Oxyinae+(Calliptaminae +Cyrtacanthaeridinae))))).However,we did not recover a monophyletic Grylloidea.Myrmecophilidae clustered into one clade with Gryllotalpidae instead of with Gryllidae.ML and BI analyses of all protein coding genes(using all nucleotide sequence data or excluding the third codon position,and amino acid sequences)revealed a topology identical to that of the entire mtDNA genome dataset.However,22 tRNAs genes excluding the DHU loop and T()C loop(TRNA),and two rRNA genes(RRNA)perform poorly when analyzed as single dataset.Our results suggest that the best phylogenetie inferences were ML and BI methods based on total mtDNA.Excluding tRNA genes,rRNA genes and the third codon position of protein coding genes from dataset and converting nucleotide sequences to amino acid sequences do not positively affect phylogenetic reconstruction.     

制备硅包覆的磁性微球用于蓖麻叶DNA的提取

目的:采用溶剂热方法合成Fe3O4磁性微球,在其表面进行硅包覆,将其应用于蓖麻叶染色体DNA提取.方法:利用透射电子显微镜(TEM),红外光谱仪(FT-IR),振动磁强计(VSM)对合成的磁性微球进行表征,最后用电泳验证核酸.结果:合成的硅包覆的磁性微球粒径均匀、具有超顺磁性和高饱和磁含量.对蓖麻叶染色体DNA提取,A260/A280达到1.83,产率为0.556mg/g.结论:与传统氯仿-异戊醇抽提法相比,基于硅包覆磁微球的磁目相提取DNA方法具有操作简便,周期短,提取率高,产品纯度高等优点.     

Mash2基因在体细胞克隆牛肺脏中DNA甲基化状态分析

体细胞核移植(体细胞克隆)技术在动物生产、医药工业、治疗性克隆以及对珍稀濒危动物的拯救有重要意义,然而克隆效率低下以及克隆动物发育异常,严重制约了克隆技术的发展和应用．在体细胞核克隆中,供体核来自高度分化了的体细胞,发生在核移植后几小时内供体核的重编程,决定了克隆胚胎的发育能力．印记基因是由等位基因表观遗传修饰的不对称导致的基因表达具有亲本选择性,而DNA甲基化是调控印记的一个主要方式．印记基因Mash2在胚胎发育和器官形成过程中起着非常重要的作用．为了探求核移植过程中Mash2基因DNA 甲基化的表观重编程是否充分,利用亚硫酸氢盐测序法对出生48 h内死亡的体细胞核移植牛和正常对照牛肺脏中Mash2基因的DNA甲基化状态进行分析．结果显示,尽管位于Mash2基因启动子和第一个外显子处的CpG岛在正常牛和克隆牛中甲基化水平都不高(20.04%,5.55%),但克隆组的甲基化水平仍显著低于正常对照组 (P < 0.05)．甲基化模式正常组中9N3有5种不同的形式,9N4仅1种;而克隆组9C3和9C5也分别是1种．推测Mash2基因的异常DNA甲基化很可能是导致克隆牛肺脏发育异常的一个重要原因．     

两种新型目标分子标记技术——CDDP与PAAP

本文介绍了CDDP和PAAP这两种新型目标分子标记技术的产生原理、引物设计、PCR扩增、PCR产物检测手段、分子标记特征及带型模式,在此基础上对它们的技术特点和技术优势进行了概括,最后,对它们的应用前景进行了展望。     

五种提取马尾松基因组DNA方法的比较

对于含有大量多糖如酚、酯、萜等其它二次代谢产物的松科和杉科等针叶植物,要从其组织中提取高质量的基因组DNA一般都比较困难。本文以马尾松(Pinus massoniana)针叶为材料,分别采取了简易提取法、高盐沉淀法、CTAB沉淀法、Ziegenhagen法和QIAGEN公司DNeasy Plant Mini Kits 5种方法提取基因组DNA;并通过琼脂糖凝胶电泳、限制性内切酶处理和RAPD 3种方法对所提取的DNA样品进行检测,将它们在DNA的产量、质量和耗时、耗费等方面的优缺点进行定量总结,以便在实际工作中根据不同的实验目的选取最合适的方法,并根据分子生态学研究工作的实际特点确定了CTAB沉淀法为最佳方法。     

用于(医学)诊断的DNA探针

用DNA作诊断试验是非常迅速、灵敏和特异的,容易进行并容易分析。DNA杂交试验的非放射性检测方法出现,对现代的重组DNA技术从研究实验室进入更接近临床的实验室起到了相应大的促进作用。在这里要谈到这项新颖技术的基本原则及其应用。 DNA探针是一种能够识别并能特异地与互补DNA片段,即使这些互补的DNA序列是在其它完全无关的DNA序列中。     

DNA疫苗——解开免疫记忆之谜的钥匙？

ＤＮＡ疫苗──解开免疫记忆之谜的钥匙？关键词ＤＮＡ疫苗,免疫记忆ＤＮＡ是一种安全、有效的药物吗？几年前这个似乎是异想天开的问题,现在ＤＮＡ却开始探索性地应用于人体了。这是一项以核酸为基础的新颖的治疗方法。例如,有些患者正在接受这种治疗,即用新基因替换...     

普氏野马线粒体DNA D-loop区序列多态性研究

目的:了解中国新疆吉木萨尔野马繁殖中心的普氏野马(Equus przewalskii)遗传多样性及其遗传背景.方法:采用PCR产物直接测序法,对15匹普氏野马线粒体DNA D-loop高变区进行测序分析.结果:测定15个个体的线粒体DNA D-loop高变区15464～15866片段序列402bp.检测到12种单倍型,包括37个多态位点,占全部序列的9.2%,其中转换位点24个、颠换位点20个、转换位点和颠换并存位点8个、缺失位点3个.A%+T%含量(56.1%)高于G%+C%含量(43.9%),平均A含量为28.4%,T含量为27.7%,C含量为29%,G含为14.9%.单倍型间平均遗传距离为0.030,单倍型多态性(h)为1±0.00116,核苷酸多态性(π)为2.90%.15匹普氏野马线粒体DNA D-loop高变区之间平均核苷酸变异率为2.48%.结论:研究表明我国新疆吉木萨尔野马繁殖中心的普氏野马线粒体DNA D-loop区序列存在丰富的多态性.